Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI33

SCN11A, Sodium channel protein type 11 subunit alpha, humanhuman

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Length 1,791 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN11AQ9UI33 AL035470.1-201ENST00000622571 220 ntBASIC-4.14□□□□□ -3.07
SCN11AQ9UI33 RNU6-633P-201ENST00000362612 103 ntBASIC-4.14□□□□□ -3.07
SCN11AQ9UI33 RNU6-918P-201ENST00000391219 106 ntBASIC-4.14□□□□□ -3.07
SCN11AQ9UI33 RNU6-231P-201ENST00000517122 103 ntBASIC-4.14□□□□□ -3.07
SCN11AQ9UI33 SNORD58C-201ENST00000365223 64 ntBASIC-4.15□□□□□ -3.07
SCN11AQ9UI33 Y_RNA.586-201ENST00000391146 98 ntBASIC-4.15□□□□□ -3.07
SCN11AQ9UI33 AC093729.1-201ENST00000513074 128 ntBASIC-4.15□□□□□ -3.07
SCN11AQ9UI33 U6.104-201ENST00000637979 90 ntBASIC-4.15□□□□□ -3.07
SCN11AQ9UI33 SNORA63.4-201ENST00000362763 126 ntBASIC-4.16□□□□□ -3.08
SCN11AQ9UI33 SNORD45C-201ENST00000383893 79 ntBASIC-4.16□□□□□ -3.08
SCN11AQ9UI33 RNU6-876P-201ENST00000391295 104 ntBASIC-4.16□□□□□ -3.08
SCN11AQ9UI33 Y_RNA.626-201ENST00000411288 95 ntBASIC-4.16□□□□□ -3.08
SCN11AQ9UI33 MIR548AI-201ENST00000579940 88 ntBASIC-4.16□□□□□ -3.08
SCN11AQ9UI33 RNU7-61P-201ENST00000515897 61 ntBASIC-4.17□□□□□ -3.08
SCN11AQ9UI33 MIR4317-201ENST00000637586 65 ntBASIC-4.17□□□□□ -3.08
SCN11AQ9UI33 RNU4-40P-201ENST00000364351 143 ntBASIC-4.17□□□□□ -3.08
SCN11AQ9UI33 RNU6-686P-201ENST00000364839 107 ntBASIC-4.17□□□□□ -3.08
SCN11AQ9UI33 Y_RNA.632-201ENST00000459189 102 ntBASIC-4.17□□□□□ -3.08
SCN11AQ9UI33 AC139453.2-201ENST00000487255 133 ntBASIC-4.17□□□□□ -3.08
SCN11AQ9UI33 RNU6-988P-201ENST00000519081 107 ntBASIC-4.17□□□□□ -3.08
SCN11AQ9UI33 Y_RNA.210-201ENST00000364161 110 ntBASIC-4.18□□□□□ -3.08
SCN11AQ9UI33 Y_RNA.277-201ENST00000364754 102 ntBASIC-4.18□□□□□ -3.08
SCN11AQ9UI33 SNORD45A-201ENST00000384512 84 ntBASIC-4.18□□□□□ -3.08
SCN11AQ9UI33 RNU7-119P-201ENST00000459279 63 ntBASIC-4.18□□□□□ -3.08
SCN11AQ9UI33 RNU6-574P-201ENST00000384265 107 ntBASIC-4.19□□□□□ -3.08
SCN11AQ9UI33 MIRLET7A1-201ENST00000362295 80 ntBASIC-4.19□□□□□ -3.08
SCN11AQ9UI33 TRAJ9-201ENST00000390528 61 ntAPPRIS P1 BASIC-4.19□□□□□ -3.08
SCN11AQ9UI33 ZEB1-AS1-204ENST00000450834 576 ntTSL 3 BASIC-4.19□□□□□ -3.08
SCN11AQ9UI33 RNU6-450P-201ENST00000364654 107 ntBASIC-4.2□□□□□ -3.08
SCN11AQ9UI33 Y_RNA.459-201ENST00000384251 102 ntBASIC-4.2□□□□□ -3.08
SCN11AQ9UI33 Y_RNA.554-201ENST00000384672 102 ntBASIC-4.21□□□□□ -3.08
SCN11AQ9UI33 RNU6-1211P-201ENST00000459179 105 ntBASIC-4.21□□□□□ -3.08
SCN11AQ9UI33 AC104211.3-201ENST00000518861 270 ntTSL 3 BASIC-4.22□□□□□ -3.09
SCN11AQ9UI33 RNU6-380P-201ENST00000410207 107 ntBASIC-4.23□□□□□ -3.09
SCN11AQ9UI33 RNU6-1061P-201ENST00000516530 99 ntBASIC-4.23□□□□□ -3.09
SCN11AQ9UI33 SNORA40.16-201ENST00000517238 121 ntBASIC-4.23□□□□□ -3.09
SCN11AQ9UI33 SNORA81.3-201ENST00000517283 198 ntBASIC-4.23□□□□□ -3.09
SCN11AQ9UI33 Y_RNA.58-201ENST00000362807 102 ntBASIC-4.24□□□□□ -3.09
SCN11AQ9UI33 RNU6-836P-201ENST00000362920 107 ntBASIC-4.25□□□□□ -3.09
SCN11AQ9UI33 Y_RNA.544-201ENST00000384650 113 ntBASIC-4.25□□□□□ -3.09
SCN11AQ9UI33 U7.2-201ENST00000607576 63 ntBASIC-4.25□□□□□ -3.09
SCN11AQ9UI33 Y_RNA.218-201ENST00000364218 104 ntBASIC-4.25□□□□□ -3.09
SCN11AQ9UI33 MTATP8P2-201ENST00000435212 202 ntBASIC-4.25□□□□□ -3.09
SCN11AQ9UI33 Y_RNA.335-201ENST00000365299 96 ntBASIC-4.27□□□□□ -3.09
SCN11AQ9UI33 RNU6-659P-201ENST00000516454 104 ntBASIC-4.27□□□□□ -3.09
SCN11AQ9UI33 RNU6-904P-201ENST00000516206 101 ntBASIC-4.27□□□□□ -3.09
SCN11AQ9UI33 MIR3688-2-201ENST00000636963 87 ntBASIC-4.27□□□□□ -3.09
SCN11AQ9UI33 SNORD116-24-201ENST00000384549 92 ntBASIC-4.28□□□□□ -3.09
SCN11AQ9UI33 Y_RNA.532-201ENST00000384590 113 ntBASIC-4.28□□□□□ -3.09
SCN11AQ9UI33 SNORD116-4-201ENST00000384733 96 ntBASIC-4.28□□□□□ -3.09
SCN11AQ9UI33 RNU6-1135P-201ENST00000411083 103 ntBASIC-4.28□□□□□ -3.09
SCN11AQ9UI33 RNU6-277P-201ENST00000516272 106 ntBASIC-4.28□□□□□ -3.09
SCN11AQ9UI33 Y_RNA.709-201ENST00000516952 92 ntBASIC-4.28□□□□□ -3.09
SCN11AQ9UI33 U7.3-201ENST00000616123 62 ntBASIC-4.29□□□□□ -3.1
SCN11AQ9UI33 SNORD58.1-201ENST00000391313 66 ntBASIC-4.3□□□□□ -3.1
SCN11AQ9UI33 MIR4668-201ENST00000582284 70 ntBASIC-4.3□□□□□ -3.1
SCN11AQ9UI33 U4.5-201ENST00000617137 123 ntBASIC-4.3□□□□□ -3.1
SCN11AQ9UI33 SNORA25.5-201ENST00000363782 126 ntBASIC-4.32□□□□□ -3.1
SCN11AQ9UI33 MIR154-201ENST00000385243 84 ntBASIC-4.32□□□□□ -3.1
SCN11AQ9UI33 AC113195.1-201ENST00000579952 141 ntBASIC-4.32□□□□□ -3.1
SCN11AQ9UI33 Y_RNA.93-201ENST00000363066 109 ntBASIC-4.32□□□□□ -3.1
SCN11AQ9UI33 Y_RNA.219-201ENST00000364232 113 ntBASIC-4.32□□□□□ -3.1
SCN11AQ9UI33 RNU6-1015P-201ENST00000517121 99 ntBASIC-4.32□□□□□ -3.1
SCN11AQ9UI33 Y_RNA.260-201ENST00000364628 101 ntBASIC-4.33□□□□□ -3.1
SCN11AQ9UI33 RNU6-1219P-201ENST00000516143 112 ntBASIC-4.34□□□□□ -3.1
SCN11AQ9UI33 MIR1277-201ENST00000408536 78 ntBASIC-4.35□□□□□ -3.11
SCN11AQ9UI33 MIR548AH-201ENST00000637109 76 ntBASIC-4.35□□□□□ -3.11
SCN11AQ9UI33 Y_RNA.478-201ENST00000384358 107 ntBASIC-4.36□□□□□ -3.11
SCN11AQ9UI33 MIR664A-201ENST00000626086 82 ntBASIC-4.36□□□□□ -3.11
SCN11AQ9UI33 SNORD116-22-201ENST00000384430 92 ntBASIC-4.37□□□□□ -3.11
SCN11AQ9UI33 RNU6-162P-201ENST00000516228 103 ntBASIC-4.37□□□□□ -3.11
SCN11AQ9UI33 RNU6-267P-201ENST00000516714 103 ntBASIC-4.37□□□□□ -3.11
SCN11AQ9UI33 AL157777.2-201ENST00000258070 137 ntBASIC-4.37□□□□□ -3.11
SCN11AQ9UI33 RNU6-1241P-201ENST00000384536 107 ntBASIC-4.37□□□□□ -3.11
SCN11AQ9UI33 RNU6-422P-201ENST00000384632 107 ntBASIC-4.38□□□□□ -3.11
SCN11AQ9UI33 RNU6-788P-201ENST00000390967 104 ntBASIC-4.38□□□□□ -3.11
SCN11AQ9UI33 RNU2-16P-201ENST00000410712 136 ntBASIC-4.38□□□□□ -3.11
SCN11AQ9UI33 Y_RNA.620-201ENST00000411009 88 ntBASIC-4.38□□□□□ -3.11
SCN11AQ9UI33 RNU6-1107P-201ENST00000364817 104 ntBASIC-4.39□□□□□ -3.11
SCN11AQ9UI33 Y_RNA.272-201ENST00000364696 102 ntBASIC-4.4□□□□□ -3.11
SCN11AQ9UI33 RNY4P13-201ENST00000384284 96 ntBASIC-4.4□□□□□ -3.11
SCN11AQ9UI33 SNORD19B-201ENST00000459623 84 ntBASIC-4.4□□□□□ -3.11
SCN11AQ9UI33 Y_RNA.107-201ENST00000363190 121 ntBASIC-4.41□□□□□ -3.12
SCN11AQ9UI33 RNU6-940P-201ENST00000363433 104 ntBASIC-4.41□□□□□ -3.12
SCN11AQ9UI33 AC069439.1-201ENST00000494739 167 ntBASIC-4.41□□□□□ -3.12
SCN11AQ9UI33 Y_RNA.722-201ENST00000517279 114 ntBASIC-4.41□□□□□ -3.12
SCN11AQ9UI33 MIR548X-201ENST00000580069 75 ntBASIC-4.42□□□□□ -3.12
SCN11AQ9UI33 MIR4801-201ENST00000582704 82 ntBASIC-4.42□□□□□ -3.12
SCN11AQ9UI33 RNU6-713P-201ENST00000384761 107 ntBASIC-4.42□□□□□ -3.12
SCN11AQ9UI33 AC006160.2-201ENST00000637708 154 ntBASIC-4.42□□□□□ -3.12
SCN11AQ9UI33 RNU4-85P-201ENST00000364675 123 ntBASIC-4.43□□□□□ -3.12
SCN11AQ9UI33 SNORA33.2-201ENST00000365413 134 ntBASIC-4.43□□□□□ -3.12
SCN11AQ9UI33 RNU6-895P-201ENST00000384125 103 ntBASIC-4.43□□□□□ -3.12
SCN11AQ9UI33 SNORD115.2-201ENST00000391126 59 ntBASIC-4.43□□□□□ -3.12
SCN11AQ9UI33 RNU6-772P-201ENST00000516042 105 ntBASIC-4.43□□□□□ -3.12
SCN11AQ9UI33 RNU6-70P-201ENST00000516438 60 ntBASIC-4.43□□□□□ -3.12
SCN11AQ9UI33 Y_RNA.818-201ENST00000618813 71 ntBASIC-4.43□□□□□ -3.12
SCN11AQ9UI33 TRGJP-201ENST00000390338 61 ntAPPRIS P1 BASIC-4.45□□□□□ -3.12
SCN11AQ9UI33 MIR4484-201ENST00000582855 83 ntBASIC-4.45□□□□□ -3.12
SCN11AQ9UI33 RNU4-71P-201ENST00000516258 113 ntBASIC-4.46□□□□□ -3.12
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