Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVE5

USP40, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 40, humanhuman

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Length 1,235 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP40Q9NVE5 RNU7-165P-201ENST00000458864 60 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
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USP40Q9NVE5 MIR4315-2-201ENST00000640925 73 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
USP40Q9NVE5 MIR892B-201ENST00000401279 77 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
USP40Q9NVE5 SNORD63.1-201ENST00000516178 80 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
USP40Q9NVE5 MIR6854-201ENST00000614935 69 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
USP40Q9NVE5 RNU6-828P-201ENST00000364876 107 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
USP40Q9NVE5 MIR329-2-201ENST00000385029 84 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
USP40Q9NVE5 MIR124-2-201ENST00000385081 109 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
USP40Q9NVE5 RNU6-258P-201ENST00000390884 101 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
USP40Q9NVE5 RNU6-732P-201ENST00000516033 103 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
USP40Q9NVE5 MIR3170-201ENST00000582699 77 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
USP40Q9NVE5 MIR6718-201ENST00000616153 80 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
USP40Q9NVE5 KIF20B-201ENST00000260753 6306 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC0.27□□□□□ -2.37
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USP40Q9NVE5 MIR520D-201ENST00000385002 87 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
USP40Q9NVE5 SNORD19-201ENST00000391191 68 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
USP40Q9NVE5 RNU6-995P-201ENST00000391244 107 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
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USP40Q9NVE5 MIR4280-201ENST00000582178 76 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
USP40Q9NVE5 HOTAIR_3.1-201ENST00000611352 97 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
USP40Q9NVE5 RNA5SP214-201ENST00000363378 118 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
USP40Q9NVE5 MIR545-201ENST00000385085 106 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
USP40Q9NVE5 RNA5SP285-201ENST00000516619 119 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
USP40Q9NVE5 RNU6-1238P-201ENST00000517215 102 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
USP40Q9NVE5 SNORD114-9-201ENST00000364370 72 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
USP40Q9NVE5 MIR5093-201ENST00000583199 100 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
USP40Q9NVE5 RNU6-986P-201ENST00000363133 102 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
USP40Q9NVE5 MIR610-201ENST00000385139 96 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
USP40Q9NVE5 AL445193.1-201ENST00000441183 141 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
USP40Q9NVE5 AP002795.1-201ENST00000534879 84 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
USP40Q9NVE5 MIR4743-201ENST00000584576 69 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
USP40Q9NVE5 RNU7-159P-201ENST00000459284 62 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
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USP40Q9NVE5 RNU6-247P-201ENST00000362636 107 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
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USP40Q9NVE5 RNU6-901P-201ENST00000384593 106 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
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USP40Q9NVE5 MIR1295A-201ENST00000408463 79 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
USP40Q9NVE5 MIR548AL-201ENST00000578416 97 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
USP40Q9NVE5 MIR5190-201ENST00000581537 80 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
USP40Q9NVE5 AL590491.3-201ENST00000610731 82 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
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USP40Q9NVE5 RNU6ATAC11P-201ENST00000408541 125 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
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USP40Q9NVE5 MIR5683-201ENST00000636514 76 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
USP40Q9NVE5 SNORD114-16-201ENST00000363044 70 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
USP40Q9NVE5 SNORA27.2-201ENST00000363365 126 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
USP40Q9NVE5 MIR6086-201ENST00000638065 55 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
USP40Q9NVE5 SNORD114-11-201ENST00000363738 75 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
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USP40Q9NVE5 Y_RNA.699-201ENST00000516803 93 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
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USP40Q9NVE5 SNORD45.2-201ENST00000363552 72 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
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USP40Q9NVE5 SNORD75.1-201ENST00000408373 60 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
USP40Q9NVE5 RNY3P8-201ENST00000411366 126 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
USP40Q9NVE5 MIR4667-201ENST00000578933 66 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
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USP40Q9NVE5 SNORD114-17-201ENST00000364699 75 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
USP40Q9NVE5 RNU6-721P-201ENST00000410155 105 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
USP40Q9NVE5 AL353691.2-201ENST00000443795 59 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
USP40Q9NVE5 MIR4636-201ENST00000582271 80 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
USP40Q9NVE5 RNU6-1204P-201ENST00000363948 107 ntBASIC0□□□□□ -2.41
USP40Q9NVE5 Y_RNA.189-201ENST00000363959 112 ntBASIC0□□□□□ -2.41
USP40Q9NVE5 SNORD114-12-201ENST00000365400 75 ntBASIC0□□□□□ -2.41
USP40Q9NVE5 AP000533.3-201ENST00000447704 118 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
USP40Q9NVE5 RPL35AP4-201ENST00000412007 102 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
USP40Q9NVE5 MIR3179-1-201ENST00000578940 84 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
USP40Q9NVE5 MIR3179-2-201ENST00000579107 84 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
USP40Q9NVE5 MIR5589-201ENST00000579442 60 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
USP40Q9NVE5 MIR3179-3-201ENST00000579566 84 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
USP40Q9NVE5 MIR3179-4-201ENST00000617599 84 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
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