Protein–RNA interactions for Protein: Q96GW7

BCAN, Brevican core protein, humanhuman

Predictions only

Length 911 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCANQ96GW7 RNU6-663P-201ENST00000391105 106 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
BCANQ96GW7 Y_RNA.613-201ENST00000410726 97 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
BCANQ96GW7 Y_RNA.484-201ENST00000384389 103 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
BCANQ96GW7 MT-TQ-201ENST00000387372 72 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
BCANQ96GW7 MIR3681-201ENST00000580089 72 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
BCANQ96GW7 Y_RNA.375-201ENST00000365625 101 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
BCANQ96GW7 RNU6-1296P-201ENST00000383879 107 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
BCANQ96GW7 SNORD116-24-201ENST00000384549 92 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
BCANQ96GW7 SNORD30.1-201ENST00000391309 70 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
BCANQ96GW7 MIR548AG1-201ENST00000579932 66 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
BCANQ96GW7 Y_RNA.246-201ENST00000364495 108 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
BCANQ96GW7 RNU6-246P-201ENST00000384702 107 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
BCANQ96GW7 MIR147A-201ENST00000385079 72 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
BCANQ96GW7 MIR124-2-201ENST00000385081 109 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
BCANQ96GW7 SNX3P1X-201ENST00000414887 175 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
BCANQ96GW7 AP000533.3-201ENST00000447704 118 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
BCANQ96GW7 U4.4-201ENST00000620626 117 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
BCANQ96GW7 RNU6-540P-201ENST00000384622 101 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
BCANQ96GW7 RNU6-1246P-201ENST00000391064 107 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
BCANQ96GW7 MIR548V-201ENST00000584165 80 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
BCANQ96GW7 SNORD115-33-201ENST00000363723 82 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
BCANQ96GW7 Y_RNA.282-201ENST00000364793 102 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
BCANQ96GW7 SNORA26.4-201ENST00000391188 123 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
BCANQ96GW7 MIR1468-201ENST00000410600 86 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
BCANQ96GW7 SNORD18.2-201ENST00000459604 70 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
BCANQ96GW7 RNU6-1233P-201ENST00000362922 102 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
BCANQ96GW7 Y_RNA.325-201ENST00000365171 122 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
BCANQ96GW7 RNU6-1236P-201ENST00000517080 99 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
BCANQ96GW7 MIR429-201ENST00000362106 83 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
BCANQ96GW7 RNU6-649P-201ENST00000384463 107 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
BCANQ96GW7 TRAJ57-201ENST00000390482 63 ntAPPRIS P1 BASIC-0.56□□□□□ -2.5
BCANQ96GW7 SNORD113-2-201ENST00000391082 72 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
BCANQ96GW7 MIR4723-201ENST00000585070 81 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
BCANQ96GW7 RNU6-431P-201ENST00000383874 107 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
BCANQ96GW7 RNU6-458P-201ENST00000384179 107 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
BCANQ96GW7 SNORD116-16-201ENST00000384533 92 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
BCANQ96GW7 MIR29B1-201ENST00000385015 81 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
BCANQ96GW7 RNU6-732P-201ENST00000516033 103 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
BCANQ96GW7 SCARNA20.2-201ENST00000516052 116 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
BCANQ96GW7 U6.58-201ENST00000613107 107 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
BCANQ96GW7 SNORD114-25-201ENST00000363742 72 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
BCANQ96GW7 SNORD114-17-201ENST00000364699 75 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
BCANQ96GW7 RNU6-542P-201ENST00000516405 103 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
BCANQ96GW7 Y_RNA.514-201ENST00000384528 112 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
BCANQ96GW7 MIR196A1-201ENST00000388006 70 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
BCANQ96GW7 RNU6-696P-201ENST00000390834 107 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
BCANQ96GW7 U7.5-201ENST00000517224 61 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
BCANQ96GW7 RNU6-1174P-201ENST00000517278 101 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
BCANQ96GW7 MIR630-201ENST00000384957 97 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
BCANQ96GW7 Y_RNA.583-201ENST00000391033 113 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
BCANQ96GW7 AL500527.2-201ENST00000454105 95 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
BCANQ96GW7 SNORD63.1-201ENST00000516178 80 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
BCANQ96GW7 RNU6-1238P-201ENST00000517215 102 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
BCANQ96GW7 Y_RNA.443-201ENST00000384135 111 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
BCANQ96GW7 MIR527-201ENST00000385244 85 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
BCANQ96GW7 SNORD64-201ENST00000386683 67 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
BCANQ96GW7 AL353691.2-201ENST00000443795 59 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
BCANQ96GW7 AC020913.3-201ENST00000594678 125 ntTSL 3 BASIC-0.61□□□□□ -2.51
BCANQ96GW7 ULK3-223ENST00000631115 126 ntTSL 5 BASIC-0.61□□□□□ -2.51
BCANQ96GW7 MIR382-201ENST00000637119 76 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
BCANQ96GW7 Y_RNA.109-201ENST00000363215 102 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
BCANQ96GW7 Y_RNA.236-201ENST00000364427 111 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
BCANQ96GW7 SNORD19-201ENST00000391191 68 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
BCANQ96GW7 RNU6-630P-201ENST00000391258 106 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
BCANQ96GW7 SCARNA21.1-201ENST00000515996 128 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
BCANQ96GW7 SNORA41B-201ENST00000384785 128 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
BCANQ96GW7 RNU6-1262P-201ENST00000516217 96 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
BCANQ96GW7 SNORA25.4-201ENST00000363666 124 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
BCANQ96GW7 RNU6-539P-201ENST00000516665 103 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
BCANQ96GW7 RNU6-598P-201ENST00000364017 105 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
BCANQ96GW7 RNU6-92P-201ENST00000605893 104 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
BCANQ96GW7 SNORD83B-201ENST00000386745 93 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
BCANQ96GW7 RNU7-88P-201ENST00000458752 63 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
BCANQ96GW7 AP002795.1-201ENST00000534879 84 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
BCANQ96GW7 MIR4499-201ENST00000584834 69 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
BCANQ96GW7 MIR6818-201ENST00000621576 65 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
BCANQ96GW7 SNORD1B-201ENST00000363091 84 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
BCANQ96GW7 MIR587-201ENST00000384845 96 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
BCANQ96GW7 MIR601-201ENST00000385256 79 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
BCANQ96GW7 MIR5683-201ENST00000636514 76 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
BCANQ96GW7 RNA5SP26-201ENST00000362406 119 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
BCANQ96GW7 MIR548AA1-201ENST00000384971 97 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
BCANQ96GW7 TRAJ9-201ENST00000390528 61 ntAPPRIS P1 BASIC-0.69□□□□□ -2.52
BCANQ96GW7 MIR4511-201ENST00000582784 87 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
BCANQ96GW7 AC005520.4-201ENST00000604337 90 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
BCANQ96GW7 SPRY4-IT1_2.1-201ENST00000612613 121 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
BCANQ96GW7 U6.111-201ENST00000636093 83 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
BCANQ96GW7 AC103706.3-201ENST00000636297 85 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
BCANQ96GW7 SNORD60.1-201ENST00000362451 73 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
BCANQ96GW7 Y_RNA.468-201ENST00000384298 102 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
BCANQ96GW7 snoU83B.1-201ENST00000517136 88 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
BCANQ96GW7 uc_338.19-201ENST00000616808 99 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
BCANQ96GW7 RNU6-122P-201ENST00000516818 107 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
BCANQ96GW7 MIR4490-201ENST00000582647 84 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
BCANQ96GW7 RNU6-669P-201ENST00000365575 107 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
BCANQ96GW7 RNU6-1157P-201ENST00000384456 106 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
BCANQ96GW7 U2.18-201ENST00000622185 84 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
BCANQ96GW7 SNORA25.5-201ENST00000363782 126 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
BCANQ96GW7 MIR125B1-201ENST00000385236 88 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
BCANQ96GW7 SCARNA17-201ENST00000516183 144 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 203 ms