Protein–RNA interactions for Protein: Q1ED39

KNOP1, Lysine-rich nucleolar protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.109-201ENST00000363215 102 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
KNOP1Q1ED39 SNORD19-201ENST00000391191 68 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
KNOP1Q1ED39 AC020913.3-201ENST00000594678 125 ntTSL 3 BASIC-1.13□□□□□ -2.59
KNOP1Q1ED39 MIR409-201ENST00000362237 79 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
KNOP1Q1ED39 RNA5SP173-201ENST00000364857 136 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
KNOP1Q1ED39 RNU6-696P-201ENST00000390834 107 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
KNOP1Q1ED39 SNORD113-2-201ENST00000391082 72 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
KNOP1Q1ED39 MIR3134-201ENST00000579433 74 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
KNOP1Q1ED39 SNORD116-24-201ENST00000384549 92 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
KNOP1Q1ED39 MIR29B1-201ENST00000385015 81 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
KNOP1Q1ED39 SCARNA17-201ENST00000516183 144 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
KNOP1Q1ED39 RNY1P9-201ENST00000532431 109 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
KNOP1Q1ED39 RNU6-895P-201ENST00000384125 103 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
KNOP1Q1ED39 RNU6-687P-201ENST00000516443 89 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
KNOP1Q1ED39 SNORD115-31-201ENST00000365318 82 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
KNOP1Q1ED39 AP002795.1-201ENST00000534879 84 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
KNOP1Q1ED39 MIR5683-201ENST00000636514 76 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
KNOP1Q1ED39 SNORD73B-201ENST00000364394 72 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.375-201ENST00000365625 101 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
KNOP1Q1ED39 RNU6-1262P-201ENST00000516217 96 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
KNOP1Q1ED39 RNU6-598P-201ENST00000364017 105 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
KNOP1Q1ED39 RNU6-411P-201ENST00000384451 107 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
KNOP1Q1ED39 SNORD116-16-201ENST00000384533 92 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
KNOP1Q1ED39 SNORD57-201ENST00000448188 72 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
KNOP1Q1ED39 MIR4490-201ENST00000582647 84 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
KNOP1Q1ED39 MIR6818-201ENST00000621576 65 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
KNOP1Q1ED39 MIR507-201ENST00000385234 94 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
KNOP1Q1ED39 SCARNA21.1-201ENST00000515996 128 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
KNOP1Q1ED39 U7.4-201ENST00000614961 63 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
KNOP1Q1ED39 MIR3202-2-201ENST00000635980 79 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
KNOP1Q1ED39 ULK3-223ENST00000631115 126 ntTSL 5 BASIC-1.21□□□□□ -2.6
KNOP1Q1ED39 RNA5SP26-201ENST00000362406 119 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
KNOP1Q1ED39 RNU6-1157P-201ENST00000384456 106 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
KNOP1Q1ED39 MIR548Q-201ENST00000408404 100 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
KNOP1Q1ED39 MIR378F-201ENST00000578143 78 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
KNOP1Q1ED39 RNU6-1255P-201ENST00000363434 112 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
KNOP1Q1ED39 SNORA41B-201ENST00000384785 128 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
KNOP1Q1ED39 AL627230.5-201ENST00000619807 58 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
KNOP1Q1ED39 RNY4P29-201ENST00000410801 97 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
KNOP1Q1ED39 RNU6-1015P-201ENST00000517121 99 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
KNOP1Q1ED39 SNORA26.2-201ENST00000390922 122 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
KNOP1Q1ED39 RNA5SP266-201ENST00000410273 108 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.43-201ENST00000362670 111 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
KNOP1Q1ED39 RNU6-542P-201ENST00000516405 103 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
KNOP1Q1ED39 RNU6-573P-201ENST00000383938 106 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
KNOP1Q1ED39 MIR587-201ENST00000384845 96 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
KNOP1Q1ED39 U2.18-201ENST00000622185 84 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.388-201ENST00000383919 113 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
KNOP1Q1ED39 RNU6-1124P-201ENST00000384169 107 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
KNOP1Q1ED39 RNU6-576P-201ENST00000390854 102 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.583-201ENST00000391033 113 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
KNOP1Q1ED39 RNU7-134P-201ENST00000458997 64 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
KNOP1Q1ED39 RNU6-634P-201ENST00000459134 106 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
KNOP1Q1ED39 RNU6-228P-201ENST00000362700 106 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
KNOP1Q1ED39 SNORD1B-201ENST00000363091 84 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.514-201ENST00000384528 112 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
KNOP1Q1ED39 RNU6-630P-201ENST00000391258 106 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
KNOP1Q1ED39 MIR6738-201ENST00000619620 64 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
KNOP1Q1ED39 RNA5SP331-201ENST00000364986 107 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
KNOP1Q1ED39 RNU6-540P-201ENST00000384622 101 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
KNOP1Q1ED39 MIR548AA1-201ENST00000384971 97 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
KNOP1Q1ED39 RNU6-279P-201ENST00000391297 101 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
KNOP1Q1ED39 MIR1255A-201ENST00000408338 113 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
KNOP1Q1ED39 RPL35AP4-201ENST00000412007 102 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
KNOP1Q1ED39 RNU6-857P-201ENST00000515893 110 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
KNOP1Q1ED39 RNU6-164P-201ENST00000364604 103 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
KNOP1Q1ED39 RNU6-10P-201ENST00000384036 107 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.443-201ENST00000384135 111 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.457-201ENST00000384237 111 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
KNOP1Q1ED39 RNU6-24P-201ENST00000384440 107 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
KNOP1Q1ED39 AC090616.4-201ENST00000448026 115 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
KNOP1Q1ED39 MIR4324-201ENST00000584846 72 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
KNOP1Q1ED39 RNU6-92P-201ENST00000605893 104 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
KNOP1Q1ED39 RNU6-608P-201ENST00000383927 104 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
KNOP1Q1ED39 MIR520D-201ENST00000385002 87 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
KNOP1Q1ED39 RNU6-1267P-201ENST00000410747 107 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.545-201ENST00000384652 105 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
KNOP1Q1ED39 TRAJ9-201ENST00000390528 61 ntAPPRIS P1 BASIC-1.35□□□□□ -2.63
KNOP1Q1ED39 RNU6-663P-201ENST00000391105 106 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
KNOP1Q1ED39 MIR1302-4-201ENST00000408701 150 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
KNOP1Q1ED39 RNU6-523P-201ENST00000516304 54 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
KNOP1Q1ED39 MIR4306-201ENST00000583390 91 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
KNOP1Q1ED39 RNU6-1111P-201ENST00000391118 107 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
KNOP1Q1ED39 MIR3170-201ENST00000582699 77 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
KNOP1Q1ED39 SPRY4-IT1_2.1-201ENST00000612613 121 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.603-201ENST00000410571 108 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
KNOP1Q1ED39 SNORD78.1-201ENST00000390866 65 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
KNOP1Q1ED39 RNU6-871P-201ENST00000516122 100 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.365-201ENST00000365537 102 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
KNOP1Q1ED39 RNU6-995P-201ENST00000391244 107 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
KNOP1Q1ED39 RNU6-172P-201ENST00000411000 93 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
KNOP1Q1ED39 SNX3P1X-201ENST00000414887 175 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
KNOP1Q1ED39 RNU7-151P-201ENST00000516930 53 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.64
KNOP1Q1ED39 SNORD60.1-201ENST00000362451 73 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
KNOP1Q1ED39 SNORA25.4-201ENST00000363666 124 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
KNOP1Q1ED39 AC091912.2-201ENST00000624798 167 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
KNOP1Q1ED39 RNU6-247P-201ENST00000362636 107 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
KNOP1Q1ED39 SNORD30.1-201ENST00000391309 70 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
KNOP1Q1ED39 MIR6874-201ENST00000635894 71 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
KNOP1Q1ED39 MIR8485-201ENST00000401372 91 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
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