Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

Predictions only

Length 1,050 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 Y_RNA.325-201ENST00000365171 122 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
HERC3Q15034 MIR154-201ENST00000385243 84 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
HERC3Q15034 MIR548V-201ENST00000584165 80 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
HERC3Q15034 U4.4-201ENST00000620626 117 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
HERC3Q15034 Y_RNA.514-201ENST00000384528 112 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
HERC3Q15034 RNU6-732P-201ENST00000516033 103 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
HERC3Q15034 SNORD63.1-201ENST00000516178 80 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
HERC3Q15034 snoU83B.1-201ENST00000517136 88 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
HERC3Q15034 RNU6-1238P-201ENST00000517215 102 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
HERC3Q15034 U7.5-201ENST00000517224 61 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
HERC3Q15034 MIR429-201ENST00000362106 83 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
HERC3Q15034 SNORD73B-201ENST00000364394 72 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
HERC3Q15034 RNU6-458P-201ENST00000384179 107 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
HERC3Q15034 U6.58-201ENST00000613107 107 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
HERC3Q15034 RNU6-1216P-201ENST00000362590 107 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
HERC3Q15034 Y_RNA.236-201ENST00000364427 111 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
HERC3Q15034 Y_RNA.282-201ENST00000364793 102 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
HERC3Q15034 MIR527-201ENST00000385244 85 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
HERC3Q15034 RNU7-88P-201ENST00000458752 63 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
HERC3Q15034 MIR3134-201ENST00000579433 74 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
HERC3Q15034 Y_RNA.788-201ENST00000622394 112 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
HERC3Q15034 RNU6-1255P-201ENST00000363434 112 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
HERC3Q15034 RNU6-895P-201ENST00000384125 103 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
HERC3Q15034 AL353691.2-201ENST00000443795 59 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
HERC3Q15034 MIR3202-2-201ENST00000635980 79 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
HERC3Q15034 RNA5SP173-201ENST00000364857 136 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
HERC3Q15034 SNORD113-2-201ENST00000391082 72 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
HERC3Q15034 MIR3165-201ENST00000579874 75 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
HERC3Q15034 MIR630-201ENST00000384957 97 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
HERC3Q15034 RNU6-1174P-201ENST00000517278 101 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
HERC3Q15034 Y_RNA.43-201ENST00000362670 111 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
HERC3Q15034 Y_RNA.583-201ENST00000391033 113 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
HERC3Q15034 RNU6-687P-201ENST00000516443 89 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
HERC3Q15034 U7.4-201ENST00000614961 63 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
HERC3Q15034 MIR4320-201ENST00000636981 65 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
HERC3Q15034 RNU6-411P-201ENST00000384451 107 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
HERC3Q15034 SNORD116-24-201ENST00000384549 92 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
HERC3Q15034 SNORA26.2-201ENST00000390922 122 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
HERC3Q15034 MIR889-201ENST00000401280 79 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
HERC3Q15034 RNY4P29-201ENST00000410801 97 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
HERC3Q15034 RNU6-706P-201ENST00000517229 104 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
HERC3Q15034 hsa-mir-3607.1-201ENST00000637229 79 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
HERC3Q15034 Y_RNA.109-201ENST00000363215 102 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
HERC3Q15034 SNORD115-31-201ENST00000365318 82 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
HERC3Q15034 Y_RNA.375-201ENST00000365625 101 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
HERC3Q15034 RNU6-696P-201ENST00000390834 107 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
HERC3Q15034 Y_RNA.468-201ENST00000384298 102 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
HERC3Q15034 SNORD19-201ENST00000391191 68 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
HERC3Q15034 SNORD116-16-201ENST00000384533 92 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
HERC3Q15034 HLA-S-202ENST00000425174 53 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
HERC3Q15034 Y_RNA.388-201ENST00000383919 113 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
HERC3Q15034 MIR29B1-201ENST00000385015 81 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
HERC3Q15034 RNU6-1262P-201ENST00000516217 96 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
HERC3Q15034 RNU6-573P-201ENST00000383938 106 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
HERC3Q15034 Y_RNA.442-201ENST00000384131 102 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
HERC3Q15034 RNU6-1124P-201ENST00000384169 107 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
HERC3Q15034 RNU6-1015P-201ENST00000517121 99 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
HERC3Q15034 MIR5591-201ENST00000578248 65 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
HERC3Q15034 MIR4520-1-201ENST00000582609 70 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
HERC3Q15034 MIR5683-201ENST00000636514 76 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
HERC3Q15034 RNA5SP266-201ENST00000410273 108 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
HERC3Q15034 MIR4490-201ENST00000582647 84 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
HERC3Q15034 RNU6-228P-201ENST00000362700 106 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
HERC3Q15034 RNU6-598P-201ENST00000364017 105 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
HERC3Q15034 MIR1302-4-201ENST00000408701 150 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
HERC3Q15034 AP002795.1-201ENST00000534879 84 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
HERC3Q15034 RNU6-540P-201ENST00000384622 101 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
HERC3Q15034 MIR548Q-201ENST00000408404 100 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
HERC3Q15034 RNU6-542P-201ENST00000516405 103 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
HERC3Q15034 MIR507-201ENST00000385234 94 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
HERC3Q15034 RNU6-279P-201ENST00000391297 101 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
HERC3Q15034 MIR1255A-201ENST00000408338 113 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
HERC3Q15034 RNU6-634P-201ENST00000459134 106 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
HERC3Q15034 RNU6-857P-201ENST00000515893 110 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
HERC3Q15034 MIR1246-201ENST00000636535 73 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
HERC3Q15034 Y_RNA.181-201ENST00000363872 101 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
HERC3Q15034 RNA5SP331-201ENST00000364986 107 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
HERC3Q15034 SNORA41B-201ENST00000384785 128 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
HERC3Q15034 RNA5SP180-201ENST00000516181 101 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
HERC3Q15034 AC138207.3-201ENST00000585289 166 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
HERC3Q15034 MIR6818-201ENST00000621576 65 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
HERC3Q15034 ULK3-223ENST00000631115 126 ntTSL 5 BASIC-1.22□□□□□ -2.6
HERC3Q15034 MIR6502-201ENST00000617296 76 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
HERC3Q15034 Y_RNA.457-201ENST00000384237 111 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
HERC3Q15034 AL627230.5-201ENST00000619807 58 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
HERC3Q15034 AC091912.2-201ENST00000624798 167 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
HERC3Q15034 MIR6874-201ENST00000635894 71 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
HERC3Q15034 RNA5SP26-201ENST00000362406 119 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
HERC3Q15034 SNORD78.1-201ENST00000390866 65 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
HERC3Q15034 U2.18-201ENST00000622185 84 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
HERC3Q15034 Y_RNA.443-201ENST00000384135 111 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
HERC3Q15034 Y_RNA.545-201ENST00000384652 105 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
HERC3Q15034 RNU6-663P-201ENST00000391105 106 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
HERC3Q15034 MIR548AA1-201ENST00000384971 97 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
HERC3Q15034 RNU6-576P-201ENST00000390854 102 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
HERC3Q15034 RNA5SP86-201ENST00000390869 98 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
HERC3Q15034 SNX3P1X-201ENST00000414887 175 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
HERC3Q15034 RNU6-523P-201ENST00000516304 54 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
HERC3Q15034 SNORD1B-201ENST00000363091 84 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
HERC3Q15034 MIR487B-201ENST00000385021 84 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 186.4 ms