Protein–RNA interactions for Protein: Q13835

PKP1, Plakophilin-1, humanhuman

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Length 747 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP1Q13835 RNU6-663P-201ENST00000391105 106 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
PKP1Q13835 Y_RNA.698-201ENST00000516798 118 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
PKP1Q13835 RNU6-776P-201ENST00000364403 104 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
PKP1Q13835 RNU6-1022P-201ENST00000365049 104 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
PKP1Q13835 Y_RNA.613-201ENST00000410726 97 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
PKP1Q13835 SCARNA20.2-201ENST00000516052 116 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
PKP1Q13835 RNU6-542P-201ENST00000516405 103 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
PKP1Q13835 SNORD114-17-201ENST00000364699 75 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
PKP1Q13835 SNORD64-201ENST00000386683 67 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
PKP1Q13835 SNORD30.1-201ENST00000391309 70 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
PKP1Q13835 AL500527.2-201ENST00000454105 95 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
PKP1Q13835 MIR196A1-201ENST00000388006 70 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
PKP1Q13835 MIR889-201ENST00000401280 79 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
PKP1Q13835 MIR548AX-201ENST00000580117 73 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
PKP1Q13835 Y_RNA.236-201ENST00000364427 111 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
PKP1Q13835 Y_RNA.325-201ENST00000365171 122 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
PKP1Q13835 MIR147A-201ENST00000385079 72 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
PKP1Q13835 RNU6-1275P-201ENST00000391087 107 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
PKP1Q13835 U4.4-201ENST00000620626 117 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
PKP1Q13835 RNU6-649P-201ENST00000384463 107 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
PKP1Q13835 RNU6-540P-201ENST00000384622 101 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
PKP1Q13835 MIR548AG1-201ENST00000579932 66 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
PKP1Q13835 RNU6-1233P-201ENST00000362922 102 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
PKP1Q13835 Y_RNA.443-201ENST00000384135 111 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
PKP1Q13835 RNU6-630P-201ENST00000391258 106 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
PKP1Q13835 MIR3681-201ENST00000580089 72 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
PKP1Q13835 Y_RNA.282-201ENST00000364793 102 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
PKP1Q13835 RNU6-458P-201ENST00000384179 107 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
PKP1Q13835 RNU6-523P-201ENST00000516304 54 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
PKP1Q13835 U6.58-201ENST00000613107 107 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
PKP1Q13835 Y_RNA.565-201ENST00000384719 101 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
PKP1Q13835 RNU6-539P-201ENST00000516665 103 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
PKP1Q13835 MIR382-201ENST00000637119 76 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
PKP1Q13835 SNORA25.4-201ENST00000363666 124 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
PKP1Q13835 RNA5SP67-201ENST00000516422 131 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
PKP1Q13835 SNORD63.1-201ENST00000516178 80 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
PKP1Q13835 SNORD115-33-201ENST00000363723 82 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
PKP1Q13835 RNU6-246P-201ENST00000384702 107 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
PKP1Q13835 SNORD83B-201ENST00000386745 93 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
PKP1Q13835 SNORA26.4-201ENST00000391188 123 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
PKP1Q13835 U7.5-201ENST00000517224 61 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
PKP1Q13835 RNU7-88P-201ENST00000458752 63 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
PKP1Q13835 RNU6-1238P-201ENST00000517215 102 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
PKP1Q13835 MIR4499-201ENST00000584834 69 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
PKP1Q13835 SNORD116-16-201ENST00000384533 92 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
PKP1Q13835 RNU6-696P-201ENST00000390834 107 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
PKP1Q13835 SCARNA21.1-201ENST00000515996 128 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
PKP1Q13835 RNU6-1236P-201ENST00000517080 99 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
PKP1Q13835 U6.111-201ENST00000636093 83 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
PKP1Q13835 Y_RNA.109-201ENST00000363215 102 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
PKP1Q13835 RNU6-732P-201ENST00000516033 103 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
PKP1Q13835 RNU6-638P-201ENST00000516582 104 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
PKP1Q13835 RNU6-92P-201ENST00000605893 104 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
PKP1Q13835 uc_338.19-201ENST00000616808 99 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
PKP1Q13835 AC020913.3-201ENST00000594678 125 ntTSL 3 BASIC-0.8□□□□□ -2.54
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PKP1Q13835 RNU6-1157P-201ENST00000384456 106 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
PKP1Q13835 SNORD19-201ENST00000391191 68 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
PKP1Q13835 snoU83B.1-201ENST00000517136 88 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
PKP1Q13835 AC103706.3-201ENST00000636297 85 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
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PKP1Q13835 TRAJ9-201ENST00000390528 61 ntAPPRIS P1 BASIC-0.84□□□□□ -2.54
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PKP1Q13835 AC005520.4-201ENST00000604337 90 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
PKP1Q13835 RNU7-134P-201ENST00000458997 64 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
PKP1Q13835 RNU6-1262P-201ENST00000516217 96 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
PKP1Q13835 RNA5SP26-201ENST00000362406 119 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
PKP1Q13835 RNU6-800P-201ENST00000384473 103 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
PKP1Q13835 SNORA41B-201ENST00000384785 128 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
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PKP1Q13835 RNA5SP266-201ENST00000410273 108 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
PKP1Q13835 SCARNA17-201ENST00000516183 144 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
PKP1Q13835 MIR6818-201ENST00000621576 65 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
PKP1Q13835 SNORA25.5-201ENST00000363782 126 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
PKP1Q13835 RNU6-598P-201ENST00000364017 105 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
PKP1Q13835 MIR587-201ENST00000384845 96 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
PKP1Q13835 RNU6-995P-201ENST00000391244 107 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
PKP1Q13835 AC114801.3-201ENST00000510231 177 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
PKP1Q13835 MIR378F-201ENST00000578143 78 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
PKP1Q13835 ULK3-223ENST00000631115 126 ntTSL 5 BASIC-0.91□□□□□ -2.56
PKP1Q13835 MIR5683-201ENST00000636514 76 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
PKP1Q13835 SNORD60.1-201ENST00000362451 73 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
PKP1Q13835 Y_RNA.514-201ENST00000384528 112 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
PKP1Q13835 MIR29B1-201ENST00000385015 81 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
PKP1Q13835 RPL35AP4-201ENST00000412007 102 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
PKP1Q13835 MIR6738-201ENST00000619620 64 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
PKP1Q13835 Y_RNA.583-201ENST00000391033 113 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
PKP1Q13835 MIR8485-201ENST00000401372 91 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
PKP1Q13835 U2.18-201ENST00000622185 84 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
PKP1Q13835 SNORD1B-201ENST00000363091 84 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
PKP1Q13835 RNU6-940P-201ENST00000363433 104 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
PKP1Q13835 AC090616.4-201ENST00000448026 115 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
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