Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

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Length 1,447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 MIR154-201ENST00000385243 84 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
PTCH1Q13635 SNORD78.1-201ENST00000390866 65 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
PTCH1Q13635 RNU6-279P-201ENST00000391297 101 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
PTCH1Q13635 SNORD18.2-201ENST00000459604 70 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
PTCH1Q13635 MIR4441-201ENST00000582623 100 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
PTCH1Q13635 MIR4436A-201ENST00000585278 85 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
PTCH1Q13635 FAS-AS1.1-201ENST00000615327 126 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
PTCH1Q13635 Y_RNA.74-201ENST00000362911 99 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
PTCH1Q13635 Y_RNA.246-201ENST00000364495 108 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
PTCH1Q13635 RNU6-24P-201ENST00000384440 107 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
PTCH1Q13635 RNU6-411P-201ENST00000384451 107 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
PTCH1Q13635 RNU6-1246P-201ENST00000391064 107 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
PTCH1Q13635 AP000533.3-201ENST00000447704 118 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
PTCH1Q13635 MIR548AG1-201ENST00000579932 66 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
PTCH1Q13635 RNU6-698P-201ENST00000363523 107 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
PTCH1Q13635 RNU6-34P-201ENST00000364874 107 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
PTCH1Q13635 Y_RNA.484-201ENST00000384389 103 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
PTCH1Q13635 RNU6-857P-201ENST00000515893 110 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
PTCH1Q13635 SNORD115-31-201ENST00000365318 82 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
PTCH1Q13635 SNORD116-24-201ENST00000384549 92 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
PTCH1Q13635 Y_RNA.181-201ENST00000363872 101 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
PTCH1Q13635 Y_RNA.325-201ENST00000365171 122 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
PTCH1Q13635 RNU6-895P-201ENST00000384125 103 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
PTCH1Q13635 Y_RNA.613-201ENST00000410726 97 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
PTCH1Q13635 RNU6-1015P-201ENST00000517121 99 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
PTCH1Q13635 MIR548V-201ENST00000584165 80 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
PTCH1Q13635 MIR6738-201ENST00000619620 64 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
PTCH1Q13635 U4.4-201ENST00000620626 117 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
PTCH1Q13635 MIR1285-2-201ENST00000408311 88 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
PTCH1Q13635 Y_RNA.375-201ENST00000365625 101 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
PTCH1Q13635 RNU6-246P-201ENST00000384702 107 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
PTCH1Q13635 MIR630-201ENST00000384957 97 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
PTCH1Q13635 RNU6-523P-201ENST00000516304 54 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
PTCH1Q13635 Y_RNA.244-201ENST00000364484 109 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
PTCH1Q13635 Y_RNA.282-201ENST00000364793 102 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
PTCH1Q13635 RNA5SP461-201ENST00000516451 104 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
PTCH1Q13635 Y_RNA.685-201ENST00000516532 108 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
PTCH1Q13635 SNORD114-17-201ENST00000364699 75 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
PTCH1Q13635 SNORD113-2-201ENST00000391082 72 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
PTCH1Q13635 RNU6-634P-201ENST00000459134 106 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
PTCH1Q13635 RNY4P7-201ENST00000364600 96 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
PTCH1Q13635 RNU6-540P-201ENST00000384622 101 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
PTCH1Q13635 MIR527-201ENST00000385244 85 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
PTCH1Q13635 RNA5SP225-201ENST00000410874 135 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
PTCH1Q13635 U7.5-201ENST00000517224 61 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
PTCH1Q13635 SNORD115-33-201ENST00000363723 82 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.49
PTCH1Q13635 Y_RNA.236-201ENST00000364427 111 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.49
PTCH1Q13635 RNU6-458P-201ENST00000384179 107 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.49
PTCH1Q13635 SNORA26.4-201ENST00000391188 123 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.49
PTCH1Q13635 U6.58-201ENST00000613107 107 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.49
PTCH1Q13635 Y_RNA.204-201ENST00000364112 102 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
PTCH1Q13635 MIR147A-201ENST00000385079 72 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
PTCH1Q13635 RNU6-542P-201ENST00000516405 103 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
PTCH1Q13635 MIR4662A-201ENST00000637499 67 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
PTCH1Q13635 MIR429-201ENST00000362106 83 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
PTCH1Q13635 RNU6-1233P-201ENST00000362922 102 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
PTCH1Q13635 Y_RNA.109-201ENST00000363215 102 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
PTCH1Q13635 Y_RNA.545-201ENST00000384652 105 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
PTCH1Q13635 RNU7-88P-201ENST00000458752 63 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
PTCH1Q13635 RNU6-1174P-201ENST00000517278 101 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
PTCH1Q13635 MIR4324-201ENST00000584846 72 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
PTCH1Q13635 RNU6-431P-201ENST00000383874 107 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
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PTCH1Q13635 SNORD63.1-201ENST00000516178 80 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
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PTCH1Q13635 SNORD116-16-201ENST00000384533 92 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
PTCH1Q13635 SNORD64-201ENST00000386683 67 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
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PTCH1Q13635 MIR889-201ENST00000401280 79 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
PTCH1Q13635 RNU6-732P-201ENST00000516033 103 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
PTCH1Q13635 RNU6-871P-201ENST00000516122 100 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
PTCH1Q13635 SNORA72.7-201ENST00000516349 94 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
PTCH1Q13635 SNORD114-25-201ENST00000363742 72 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
PTCH1Q13635 RNU6-776P-201ENST00000364403 104 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
PTCH1Q13635 RNU6-1022P-201ENST00000365049 104 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
PTCH1Q13635 Y_RNA.443-201ENST00000384135 111 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
PTCH1Q13635 SNORA41B-201ENST00000384785 128 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
PTCH1Q13635 RNU6-696P-201ENST00000390834 107 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
PTCH1Q13635 SNORD19-201ENST00000391191 68 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
PTCH1Q13635 RNU6-630P-201ENST00000391258 106 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
PTCH1Q13635 RNU6-1262P-201ENST00000516217 96 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
PTCH1Q13635 RNU6-598P-201ENST00000364017 105 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
PTCH1Q13635 SNORD30.1-201ENST00000391309 70 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
PTCH1Q13635 SCARNA20.2-201ENST00000516052 116 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
PTCH1Q13635 AL353691.2-201ENST00000443795 59 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
PTCH1Q13635 TRAJ9-201ENST00000390528 61 ntAPPRIS P1 BASIC-0.55□□□□□ -2.5
PTCH1Q13635 RNU6-92P-201ENST00000605893 104 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
PTCH1Q13635 MIR382-201ENST00000637119 76 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
PTCH1Q13635 SNORA25.4-201ENST00000363666 124 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
PTCH1Q13635 Y_RNA.475-201ENST00000384345 101 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
PTCH1Q13635 RNU6-649P-201ENST00000384463 107 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
PTCH1Q13635 Y_RNA.565-201ENST00000384719 101 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
PTCH1Q13635 AP002795.1-201ENST00000534879 84 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
PTCH1Q13635 Y_RNA.616-201ENST00000410835 95 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
PTCH1Q13635 RNU6-539P-201ENST00000516665 103 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
PTCH1Q13635 AC005520.4-201ENST00000604337 90 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
PTCH1Q13635 U6.111-201ENST00000636093 83 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
PTCH1Q13635 MIR5683-201ENST00000636514 76 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
PTCH1Q13635 MIR548Q-201ENST00000408404 100 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
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