Protein–RNA interactions for Protein: Q13315

ATM, Serine-protein kinase ATM, humanhuman

Predictions only

Length 3,056 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATMQ13315 RNU6-255P-201ENST00000516957 105 ntBASIC-3.9□□□□□ -3.03
ATMQ13315 RNY3P15-201ENST00000516297 97 ntBASIC-3.9□□□□□ -3.03
ATMQ13315 RNU6-315P-201ENST00000362666 107 ntBASIC-3.91□□□□□ -3.03
ATMQ13315 RNU6-1061P-201ENST00000516530 99 ntBASIC-3.91□□□□□ -3.03
ATMQ13315 AC078883.4-201ENST00000623218 367 ntBASIC-3.91□□□□□ -3.03
ATMQ13315 KCNQ1OT1_5.1-201ENST00000621902 226 ntBASIC-3.91□□□□□ -3.04
ATMQ13315 MTND3P10-201ENST00000450967 341 ntBASIC-3.92□□□□□ -3.04
ATMQ13315 RNU6-209P-201ENST00000384118 107 ntBASIC-3.93□□□□□ -3.04
ATMQ13315 DNAJC19P2-201ENST00000593340 302 ntBASIC-3.93□□□□□ -3.04
ATMQ13315 MIR4272-201ENST00000635924 64 ntBASIC-3.93□□□□□ -3.04
ATMQ13315 AL589823.1-201ENST00000429577 183 ntBASIC-3.93□□□□□ -3.04
ATMQ13315 RNU6-1091P-201ENST00000363945 107 ntBASIC-3.94□□□□□ -3.04
ATMQ13315 PLS1-AS1-201ENST00000485338 346 ntTSL 3 BASIC-3.94□□□□□ -3.04
ATMQ13315 RNU6-699P-201ENST00000517081 110 ntBASIC-3.94□□□□□ -3.04
ATMQ13315 U7.3-201ENST00000616123 62 ntBASIC-3.94□□□□□ -3.04
ATMQ13315 RNU6-959P-201ENST00000384671 107 ntBASIC-3.95□□□□□ -3.04
ATMQ13315 RNU6-259P-201ENST00000383999 107 ntBASIC-3.95□□□□□ -3.04
ATMQ13315 RNU6-838P-201ENST00000363399 108 ntBASIC-3.96□□□□□ -3.04
ATMQ13315 Y_RNA.292-201ENST00000364904 97 ntBASIC-3.96□□□□□ -3.04
ATMQ13315 RNU6-497P-201ENST00000365316 104 ntBASIC-3.96□□□□□ -3.04
ATMQ13315 RNU6-890P-201ENST00000384121 107 ntBASIC-3.96□□□□□ -3.04
ATMQ13315 MIR4511-201ENST00000582784 87 ntBASIC-3.96□□□□□ -3.04
ATMQ13315 RNU6-931P-201ENST00000363850 107 ntBASIC-3.96□□□□□ -3.04
ATMQ13315 RNU6-907P-201ENST00000390924 102 ntBASIC-3.97□□□□□ -3.04
ATMQ13315 RNU6-634P-201ENST00000459134 106 ntBASIC-3.97□□□□□ -3.05
ATMQ13315 RNU6-485P-201ENST00000363475 107 ntBASIC-3.98□□□□□ -3.05
ATMQ13315 AL445567.1-201ENST00000439121 144 ntBASIC-3.98□□□□□ -3.05
ATMQ13315 AC092567.1-201ENST00000452397 251 ntTSL 3 BASIC-3.98□□□□□ -3.05
ATMQ13315 Y_RNA.187-201ENST00000363918 113 ntBASIC-3.98□□□□□ -3.05
ATMQ13315 RNU6-673P-201ENST00000365084 104 ntBASIC-3.98□□□□□ -3.05
ATMQ13315 SNORA40.4-201ENST00000390971 128 ntBASIC-3.98□□□□□ -3.05
ATMQ13315 RNU6-121P-201ENST00000410525 99 ntBASIC-3.98□□□□□ -3.05
ATMQ13315 SNORD127-201ENST00000458892 86 ntBASIC-3.98□□□□□ -3.05
ATMQ13315 RPS29P30-201ENST00000600975 111 ntBASIC-3.98□□□□□ -3.05
ATMQ13315 SNORD58B-201ENST00000607313 66 ntBASIC-3.98□□□□□ -3.05
ATMQ13315 RNU6-294P-201ENST00000364999 102 ntBASIC-3.99□□□□□ -3.05
ATMQ13315 SNORD116-22-201ENST00000384430 92 ntBASIC-3.99□□□□□ -3.05
ATMQ13315 Y_RNA.607-201ENST00000410597 98 ntBASIC-4□□□□□ -3.05
ATMQ13315 NBR2-204ENST00000587322 63 ntBASIC-4□□□□□ -3.05
ATMQ13315 RNU6-1257P-201ENST00000384625 110 ntBASIC-4.01□□□□□ -3.05
ATMQ13315 AC104985.2-201ENST00000620598 500 ntBASIC-4.01□□□□□ -3.05
ATMQ13315 Y_RNA.16-201ENST00000362421 102 ntBASIC-4.01□□□□□ -3.05
ATMQ13315 MIR2052-201ENST00000636055 55 ntBASIC-4.01□□□□□ -3.05
ATMQ13315 SNORA19-201ENST00000384737 128 ntBASIC-4.02□□□□□ -3.05
ATMQ13315 AC110620.1-201ENST00000416042 228 ntBASIC-4.02□□□□□ -3.05
ATMQ13315 U7.2-201ENST00000607576 63 ntBASIC-4.02□□□□□ -3.05
ATMQ13315 Y_RNA.818-201ENST00000618813 71 ntBASIC-4.03□□□□□ -3.05
ATMQ13315 Y_RNA.661-201ENST00000516003 99 ntBASIC-4.03□□□□□ -3.05
ATMQ13315 RNU6-835P-201ENST00000516974 104 ntBASIC-4.03□□□□□ -3.05
ATMQ13315 AC072026.1-201ENST00000605023 201 ntBASIC-4.03□□□□□ -3.05
ATMQ13315 RNU6-1188P-201ENST00000363795 107 ntBASIC-4.03□□□□□ -3.06
ATMQ13315 SNORA40.14-201ENST00000516543 86 ntBASIC-4.03□□□□□ -3.06
ATMQ13315 Y_RNA.93-201ENST00000363066 109 ntBASIC-4.04□□□□□ -3.06
ATMQ13315 SNORA25.4-201ENST00000363666 124 ntBASIC-4.04□□□□□ -3.06
ATMQ13315 RNU6-239P-201ENST00000390990 99 ntBASIC-4.05□□□□□ -3.06
ATMQ13315 MIR6863-201ENST00000636112 90 ntBASIC-4.05□□□□□ -3.06
ATMQ13315 AC103706.3-201ENST00000636297 85 ntBASIC-4.05□□□□□ -3.06
ATMQ13315 RNU6-687P-201ENST00000516443 89 ntBASIC-4.05□□□□□ -3.06
ATMQ13315 SNORA63.7-201ENST00000365579 123 ntBASIC-4.06□□□□□ -3.06
ATMQ13315 RNU6-883P-201ENST00000384597 107 ntBASIC-4.06□□□□□ -3.06
ATMQ13315 AL158147.1-201ENST00000443970 75 ntBASIC-4.06□□□□□ -3.06
ATMQ13315 Y_RNA.201-201ENST00000364052 96 ntBASIC-4.07□□□□□ -3.06
ATMQ13315 Y_RNA.611-201ENST00000410682 108 ntBASIC-4.07□□□□□ -3.06
ATMQ13315 AP001340.1-201ENST00000624405 217 ntBASIC-4.07□□□□□ -3.06
ATMQ13315 Y_RNA.459-201ENST00000384251 102 ntBASIC-4.08□□□□□ -3.06
ATMQ13315 MIR4679-1-201ENST00000637619 75 ntBASIC-4.08□□□□□ -3.06
ATMQ13315 RNU6-500P-201ENST00000362349 107 ntBASIC-4.08□□□□□ -3.06
ATMQ13315 SNORD111B-201ENST00000408587 80 ntBASIC-4.09□□□□□ -3.06
ATMQ13315 RNY3P16-201ENST00000516338 101 ntBASIC-4.1□□□□□ -3.07
ATMQ13315 Y_RNA.788-201ENST00000622394 112 ntBASIC-4.1□□□□□ -3.07
ATMQ13315 RNU6-1042P-201ENST00000384204 107 ntBASIC-4.11□□□□□ -3.07
ATMQ13315 Y_RNA.290-201ENST00000364879 114 ntBASIC-4.12□□□□□ -3.07
ATMQ13315 SNORD58C-201ENST00000365223 64 ntBASIC-4.12□□□□□ -3.07
ATMQ13315 U2.14-201ENST00000615943 113 ntBASIC-4.12□□□□□ -3.07
ATMQ13315 MTND2P14-201ENST00000482139 351 ntBASIC-4.13□□□□□ -3.07
ATMQ13315 Y_RNA.496-201ENST00000384444 101 ntBASIC-4.13□□□□□ -3.07
ATMQ13315 TRAJ21-201ENST00000390516 55 ntAPPRIS P1 BASIC-4.14□□□□□ -3.07
ATMQ13315 AC114801.3-201ENST00000510231 177 ntBASIC-4.14□□□□□ -3.07
ATMQ13315 MIR4282-201ENST00000583613 67 ntBASIC-4.14□□□□□ -3.07
ATMQ13315 RNU6-81P-201ENST00000365608 104 ntBASIC-4.14□□□□□ -3.07
ATMQ13315 RNU6-772P-201ENST00000516042 105 ntBASIC-4.14□□□□□ -3.07
ATMQ13315 RNU6-219P-201ENST00000364728 107 ntBASIC-4.15□□□□□ -3.07
ATMQ13315 SNORD113-4-201ENST00000364802 75 ntBASIC-4.15□□□□□ -3.07
ATMQ13315 SNORD33.1-201ENST00000516213 88 ntBASIC-4.15□□□□□ -3.07
ATMQ13315 AC090582.1-201ENST00000636321 199 ntBASIC-4.15□□□□□ -3.07
ATMQ13315 MIR559-201ENST00000385188 96 ntBASIC-4.15□□□□□ -3.07
ATMQ13315 MTND2P30-201ENST00000456663 382 ntBASIC-4.15□□□□□ -3.07
ATMQ13315 MIR3134-201ENST00000579433 74 ntBASIC-4.17□□□□□ -3.08
ATMQ13315 RNU6-446P-201ENST00000362827 106 ntBASIC-4.17□□□□□ -3.08
ATMQ13315 Y_RNA.107-201ENST00000363190 121 ntBASIC-4.18□□□□□ -3.08
ATMQ13315 SNORA40.15-201ENST00000516884 107 ntBASIC-4.18□□□□□ -3.08
ATMQ13315 Y_RNA.88-201ENST00000363029 99 ntBASIC-4.18□□□□□ -3.08
ATMQ13315 RNU6-915P-201ENST00000364943 103 ntBASIC-4.18□□□□□ -3.08
ATMQ13315 MIR590-201ENST00000385008 97 ntBASIC-4.18□□□□□ -3.08
ATMQ13315 AL158828.1-201ENST00000438582 197 ntTSL 5 BASIC-4.18□□□□□ -3.08
ATMQ13315 RNU6-829P-201ENST00000363700 112 ntBASIC-4.19□□□□□ -3.08
ATMQ13315 RNU7-197P-201ENST00000458836 62 ntBASIC-4.19□□□□□ -3.08
ATMQ13315 SNORA81.3-201ENST00000517283 198 ntBASIC-4.19□□□□□ -3.08
ATMQ13315 Y_RNA.94-201ENST00000363068 106 ntBASIC-4.2□□□□□ -3.08
ATMQ13315 Y_RNA.632-201ENST00000459189 102 ntBASIC-4.2□□□□□ -3.08
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