Protein–RNA interactions for Protein: Q13216

ERCC8, DNA excision repair protein ERCC-8, humanhuman

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Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC8Q13216 RNU6-630P-201ENST00000391258 106 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
ERCC8Q13216 MIR1285-2-201ENST00000408311 88 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
ERCC8Q13216 Y_RNA.607-201ENST00000410597 98 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
ERCC8Q13216 MIR1246-201ENST00000636535 73 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
ERCC8Q13216 RNU6-1131P-201ENST00000364955 107 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
ERCC8Q13216 RNU6-608P-201ENST00000383927 104 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
ERCC8Q13216 MIR8053-201ENST00000613344 75 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
ERCC8Q13216 RNU6-315P-201ENST00000362666 107 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
ERCC8Q13216 Y_RNA.178-201ENST00000363832 102 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
ERCC8Q13216 RNU6-668P-201ENST00000364180 107 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
ERCC8Q13216 SNORD113-2-201ENST00000391082 72 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
ERCC8Q13216 Y_RNA.603-201ENST00000410571 108 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
ERCC8Q13216 HAR1A.1-201ENST00000459583 118 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
ERCC8Q13216 RNU6-168P-201ENST00000516189 101 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
ERCC8Q13216 RNU6-919P-201ENST00000516731 104 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
ERCC8Q13216 RNU6-380P-201ENST00000410207 107 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
ERCC8Q13216 MIR5588-201ENST00000581890 63 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
ERCC8Q13216 RNA5SP215-201ENST00000363440 122 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
ERCC8Q13216 Y_RNA.316-201ENST00000365118 111 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
ERCC8Q13216 Y_RNA.457-201ENST00000384237 111 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
ERCC8Q13216 SNX3P1X-201ENST00000414887 175 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
ERCC8Q13216 MIR4770-201ENST00000579149 58 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
ERCC8Q13216 MIR6502-201ENST00000617296 76 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
ERCC8Q13216 RNU6-979P-201ENST00000383896 107 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
ERCC8Q13216 Y_RNA.426-201ENST00000384068 113 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
ERCC8Q13216 SNORD116-16-201ENST00000384533 92 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
ERCC8Q13216 RNY1P1-201ENST00000364372 112 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
ERCC8Q13216 SNORA41B-201ENST00000384785 128 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
ERCC8Q13216 IGLL4P-201ENST00000614590 133 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
ERCC8Q13216 RNU6-44P-201ENST00000384045 107 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
ERCC8Q13216 MIR601-201ENST00000385256 79 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
ERCC8Q13216 MIR4520-1-201ENST00000582609 70 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
ERCC8Q13216 Y_RNA.313-201ENST00000365095 103 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
ERCC8Q13216 Y_RNA.442-201ENST00000384131 102 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
ERCC8Q13216 RNU6-1267P-201ENST00000410747 107 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
ERCC8Q13216 AC018880.2-201ENST00000414265 201 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
ERCC8Q13216 MIR365A-201ENST00000362260 87 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
ERCC8Q13216 RNU6-1094P-201ENST00000362416 104 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
ERCC8Q13216 RNU6-1081P-201ENST00000384537 107 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
ERCC8Q13216 RNU6-1152P-201ENST00000384576 107 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
ERCC8Q13216 RNA5SP89-201ENST00000410300 108 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
ERCC8Q13216 SNORD1B-201ENST00000363091 84 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
ERCC8Q13216 RNU6-1241P-201ENST00000384536 107 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
ERCC8Q13216 MIR3170-201ENST00000582699 77 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
ERCC8Q13216 MIR4712-201ENST00000583750 82 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
ERCC8Q13216 MIR198-201ENST00000637333 62 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
ERCC8Q13216 Y_RNA.232-201ENST00000364369 96 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.68
ERCC8Q13216 MIR4441-201ENST00000582623 100 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.68
ERCC8Q13216 RNU6-79P-201ENST00000362511 107 ntBASIC-1.67□□□□□ -2.68
ERCC8Q13216 SNORD116-24-201ENST00000384549 92 ntBASIC-1.67□□□□□ -2.68
ERCC8Q13216 AL603908.1-201ENST00000406098 201 ntBASIC-1.67□□□□□ -2.68
ERCC8Q13216 RNU7-171P-201ENST00000459581 62 ntBASIC-1.67□□□□□ -2.68
ERCC8Q13216 MIR548AA1-201ENST00000384971 97 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
ERCC8Q13216 Y_RNA.788-201ENST00000622394 112 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
ERCC8Q13216 RNA5SP173-201ENST00000364857 136 ntBASIC-1.69□□□□□ -2.68
ERCC8Q13216 Y_RNA.340-201ENST00000365330 92 ntBASIC-1.69□□□□□ -2.68
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ERCC8Q13216 RNU6-70P-201ENST00000516438 60 ntBASIC-1.69□□□□□ -2.68
ERCC8Q13216 MIR1245B-201ENST00000636115 69 ntBASIC-1.69□□□□□ -2.68
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ERCC8Q13216 Y_RNA.94-201ENST00000363068 106 ntBASIC-1.72□□□□□ -2.68
ERCC8Q13216 SNORD115-31-201ENST00000365318 82 ntBASIC-1.72□□□□□ -2.68
ERCC8Q13216 RNY4P30-201ENST00000410216 95 ntBASIC-1.72□□□□□ -2.68
ERCC8Q13216 SPRY4-IT1_2.1-201ENST00000612613 121 ntBASIC-1.72□□□□□ -2.68
ERCC8Q13216 Y_RNA.543-201ENST00000384649 107 ntBASIC-1.73□□□□□ -2.69
ERCC8Q13216 MIR494-201ENST00000349529 81 ntBASIC-1.74□□□□□ -2.69
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ERCC8Q13216 MTRNR2L9-201ENST00000622562 75 ntBASIC-1.75□□□□□ -2.69
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ERCC8Q13216 RNA5SP331-201ENST00000364986 107 ntBASIC-1.77□□□□□ -2.69
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ERCC8Q13216 RNA5SP86-201ENST00000390869 98 ntBASIC-1.78□□□□□ -2.69
ERCC8Q13216 RNU6ATAC17P-201ENST00000516074 71 ntBASIC-1.78□□□□□ -2.69
ERCC8Q13216 MIR7978-201ENST00000636158 59 ntBASIC-1.78□□□□□ -2.69
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ERCC8Q13216 RNU6-995P-201ENST00000391244 107 ntBASIC-1.79□□□□□ -2.7
ERCC8Q13216 RNU6-687P-201ENST00000516443 89 ntBASIC-1.79□□□□□ -2.7
ERCC8Q13216 Y_RNA.699-201ENST00000516803 93 ntBASIC-1.79□□□□□ -2.7
ERCC8Q13216 SNORD18.1-201ENST00000363807 70 ntBASIC-1.8□□□□□ -2.7
ERCC8Q13216 Y_RNA.291-201ENST00000364886 113 ntBASIC-1.8□□□□□ -2.7
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ERCC8Q13216 SNORD63.2-201ENST00000516303 64 ntBASIC-1.8□□□□□ -2.7
ERCC8Q13216 MIR4666B-201ENST00000578142 81 ntBASIC-1.8□□□□□ -2.7
ERCC8Q13216 RNU6-787P-201ENST00000384032 107 ntBASIC-1.81□□□□□ -2.7
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