Protein–RNA interactions for Protein: Q12789

GTF3C1, General transcription factor 3C polypeptide 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C1Q12789 MIR365A-201ENST00000362260 87 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
GTF3C1Q12789 Y_RNA.282-201ENST00000364793 102 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
GTF3C1Q12789 MIR4324-201ENST00000584846 72 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
GTF3C1Q12789 RNU6-1255P-201ENST00000363434 112 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
GTF3C1Q12789 RNU6-1241P-201ENST00000384536 107 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
GTF3C1Q12789 MIR4712-201ENST00000583750 82 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
GTF3C1Q12789 MIR494-201ENST00000349529 81 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
GTF3C1Q12789 Y_RNA.219-201ENST00000364232 113 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
GTF3C1Q12789 RNU6-246P-201ENST00000384702 107 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
GTF3C1Q12789 SNORA26.2-201ENST00000390922 122 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
GTF3C1Q12789 RNU6-279P-201ENST00000391297 101 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
GTF3C1Q12789 RNU6-518P-201ENST00000516056 96 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
GTF3C1Q12789 RNU6-1238P-201ENST00000517215 102 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
GTF3C1Q12789 MIR3165-201ENST00000579874 75 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
GTF3C1Q12789 MIR3202-2-201ENST00000635980 79 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
GTF3C1Q12789 MIR382-201ENST00000637119 76 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
GTF3C1Q12789 Y_RNA.325-201ENST00000365171 122 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
GTF3C1Q12789 RNU6-696P-201ENST00000390834 107 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
GTF3C1Q12789 RNU6-1262P-201ENST00000516217 96 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
GTF3C1Q12789 snoU83B.1-201ENST00000517136 88 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
GTF3C1Q12789 AP002795.1-201ENST00000534879 84 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
GTF3C1Q12789 MIR548V-201ENST00000584165 80 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
GTF3C1Q12789 U4.2-201ENST00000618561 85 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
GTF3C1Q12789 RNU6-458P-201ENST00000384179 107 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
GTF3C1Q12789 U6.58-201ENST00000613107 107 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
GTF3C1Q12789 RNU6-228P-201ENST00000362700 106 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
GTF3C1Q12789 RNU6-604P-201ENST00000390917 100 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
GTF3C1Q12789 MIR429-201ENST00000362106 83 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
GTF3C1Q12789 Y_RNA.388-201ENST00000383919 113 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
GTF3C1Q12789 Y_RNA.788-201ENST00000622394 112 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
GTF3C1Q12789 ULK3-223ENST00000631115 126 ntTSL 5 BASIC-0.82□□□□□ -2.54
GTF3C1Q12789 Y_RNA.74-201ENST00000362911 99 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
GTF3C1Q12789 Y_RNA.236-201ENST00000364427 111 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
GTF3C1Q12789 MIR548C-201ENST00000384815 97 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
GTF3C1Q12789 SNORD113-2-201ENST00000391082 72 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
GTF3C1Q12789 MIR1207-201ENST00000408249 87 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
GTF3C1Q12789 MIR548Q-201ENST00000408404 100 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
GTF3C1Q12789 RNA5SP461-201ENST00000516451 104 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
GTF3C1Q12789 SNORD115-33-201ENST00000363723 82 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
GTF3C1Q12789 RNU6-663P-201ENST00000391105 106 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
GTF3C1Q12789 Y_RNA.613-201ENST00000410726 97 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
GTF3C1Q12789 MIR4484-201ENST00000582855 83 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
GTF3C1Q12789 MIR1302-4-201ENST00000408701 150 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.54
GTF3C1Q12789 MIR548AG1-201ENST00000579932 66 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.54
GTF3C1Q12789 MIR4499-201ENST00000584834 69 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.54
GTF3C1Q12789 RNU6-668P-201ENST00000364180 107 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
GTF3C1Q12789 Y_RNA.316-201ENST00000365118 111 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
GTF3C1Q12789 SNORD115-31-201ENST00000365318 82 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
GTF3C1Q12789 FAS-AS1.1-201ENST00000615327 126 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
GTF3C1Q12789 RNU6-1233P-201ENST00000362922 102 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
GTF3C1Q12789 Y_RNA.375-201ENST00000365625 101 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
GTF3C1Q12789 SNORD116-16-201ENST00000384533 92 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
GTF3C1Q12789 RNU6-576P-201ENST00000390854 102 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
GTF3C1Q12789 RNU6ATAC17P-201ENST00000516074 71 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
GTF3C1Q12789 MIR3115-201ENST00000577915 68 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
GTF3C1Q12789 RNA5SP170-201ENST00000517150 101 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
GTF3C1Q12789 RNU6-940P-201ENST00000363433 104 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
GTF3C1Q12789 Y_RNA.181-201ENST00000363872 101 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
GTF3C1Q12789 RNY4P29-201ENST00000410801 97 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
GTF3C1Q12789 SNORD1B-201ENST00000363091 84 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
GTF3C1Q12789 MIR548AA1-201ENST00000384971 97 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
GTF3C1Q12789 U7.4-201ENST00000614961 63 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
GTF3C1Q12789 MIR6818-201ENST00000621576 65 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
GTF3C1Q12789 SNORA25.5-201ENST00000363782 126 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
GTF3C1Q12789 RNU7-151P-201ENST00000516930 53 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
GTF3C1Q12789 RNU6-1157P-201ENST00000384456 106 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.55
GTF3C1Q12789 RNU6-630P-201ENST00000391258 106 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.55
GTF3C1Q12789 AC018880.2-201ENST00000414265 201 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.55
GTF3C1Q12789 MIR4441-201ENST00000582623 100 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.55
GTF3C1Q12789 SNORD19-201ENST00000391191 68 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
GTF3C1Q12789 SNORA41B-201ENST00000384785 128 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
GTF3C1Q12789 RNU6-706P-201ENST00000517229 104 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
GTF3C1Q12789 SNORD73B-201ENST00000364394 72 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
GTF3C1Q12789 Y_RNA.365-201ENST00000365537 102 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
GTF3C1Q12789 RNU6-242P-201ENST00000384359 107 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
GTF3C1Q12789 Y_RNA.616-201ENST00000410835 95 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
GTF3C1Q12789 RNA5SP180-201ENST00000516181 101 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
GTF3C1Q12789 hsa-mir-3607.1-201ENST00000637229 79 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
GTF3C1Q12789 SNORD60.1-201ENST00000362451 73 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
GTF3C1Q12789 AC138207.3-201ENST00000585289 166 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
GTF3C1Q12789 RNU6-1124P-201ENST00000384169 107 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
GTF3C1Q12789 MIR29B1-201ENST00000385015 81 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
GTF3C1Q12789 U2.18-201ENST00000622185 84 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
GTF3C1Q12789 RNU6-857P-201ENST00000515893 110 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
GTF3C1Q12789 RNU6-1174P-201ENST00000517278 101 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
GTF3C1Q12789 RNU6-895P-201ENST00000384125 103 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
GTF3C1Q12789 RNU6-411P-201ENST00000384451 107 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
GTF3C1Q12789 RNU6-1216P-201ENST00000362590 107 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
GTF3C1Q12789 MIR507-201ENST00000385234 94 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
GTF3C1Q12789 HLA-S-202ENST00000425174 53 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
GTF3C1Q12789 RNU6-92P-201ENST00000605893 104 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
GTF3C1Q12789 MIR147A-201ENST00000385079 72 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.57
GTF3C1Q12789 SNORD78.1-201ENST00000390866 65 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.57
GTF3C1Q12789 RNU6-634P-201ENST00000459134 106 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.57
GTF3C1Q12789 SNORA25.4-201ENST00000363666 124 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
GTF3C1Q12789 RNU7-134P-201ENST00000458997 64 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
GTF3C1Q12789 MIR3170-201ENST00000582699 77 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
GTF3C1Q12789 RNU6-247P-201ENST00000362636 107 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
GTF3C1Q12789 MIR3134-201ENST00000579433 74 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
GTF3C1Q12789 RNA5SP225-201ENST00000410874 135 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 244.6 ms