Protein–RNA interactions for Protein: P60709

ACTB, Actin, cytoplasmic 1, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTBP60709 SNORA8.1-201ENST00000384250 140 ntBASIC-2.39□□□□□ -2.79
ACTBP60709 AC074348.1-201ENST00000426503 132 ntBASIC-2.39□□□□□ -2.79
ACTBP60709 SNORD63.2-201ENST00000516303 64 ntBASIC-2.39□□□□□ -2.79
ACTBP60709 RNU6-182P-201ENST00000516970 105 ntBASIC-2.39□□□□□ -2.79
ACTBP60709 Y_RNA.818-201ENST00000618813 71 ntBASIC-2.4□□□□□ -2.79
ACTBP60709 MIR7978-201ENST00000636158 59 ntBASIC-2.4□□□□□ -2.79
ACTBP60709 Y_RNA.204-201ENST00000364112 102 ntBASIC-2.41□□□□□ -2.8
ACTBP60709 Y_RNA.218-201ENST00000364218 104 ntBASIC-2.41□□□□□ -2.8
ACTBP60709 MIR1302-5-201ENST00000408164 150 ntBASIC-2.41□□□□□ -2.8
ACTBP60709 RNU6-303P-201ENST00000517091 106 ntBASIC-2.41□□□□□ -2.8
ACTBP60709 MIR466-201ENST00000580653 84 ntBASIC-2.41□□□□□ -2.8
ACTBP60709 RNU6-1094P-201ENST00000362416 104 ntBASIC-2.42□□□□□ -2.8
ACTBP60709 RNU6-974P-201ENST00000384099 108 ntBASIC-2.42□□□□□ -2.8
ACTBP60709 Y_RNA.532-201ENST00000384590 113 ntBASIC-2.42□□□□□ -2.8
ACTBP60709 MIR581-201ENST00000384895 96 ntBASIC-2.42□□□□□ -2.8
ACTBP60709 RNU6-633P-201ENST00000362612 103 ntBASIC-2.43□□□□□ -2.8
ACTBP60709 RNA5SP215-201ENST00000363440 122 ntBASIC-2.43□□□□□ -2.8
ACTBP60709 MIR579-201ENST00000385221 98 ntBASIC-2.43□□□□□ -2.8
ACTBP60709 MIR125B1-201ENST00000385236 88 ntBASIC-2.43□□□□□ -2.8
ACTBP60709 RNU6-523P-201ENST00000516304 54 ntBASIC-2.43□□□□□ -2.8
ACTBP60709 VTRNA2-1-201ENST00000602301 127 ntBASIC-2.43□□□□□ -2.8
ACTBP60709 SNORD115-37-201ENST00000363768 82 ntBASIC-2.44□□□□□ -2.8
ACTBP60709 Y_RNA.71-201ENST00000362892 104 ntBASIC-2.45□□□□□ -2.8
ACTBP60709 Y_RNA.257-201ENST00000364596 102 ntBASIC-2.45□□□□□ -2.8
ACTBP60709 RNY1P5-201ENST00000383890 115 ntBASIC-2.45□□□□□ -2.8
ACTBP60709 RNU6-995P-201ENST00000391244 107 ntBASIC-2.45□□□□□ -2.8
ACTBP60709 RNU6-557P-201ENST00000516842 110 ntBASIC-2.45□□□□□ -2.8
ACTBP60709 RNU6-1212P-201ENST00000517023 104 ntBASIC-2.45□□□□□ -2.8
ACTBP60709 FTX_4.1-201ENST00000616291 147 ntBASIC-2.45□□□□□ -2.8
ACTBP60709 RNA5SP93-201ENST00000362525 114 ntBASIC-2.46□□□□□ -2.8
ACTBP60709 SNORD18C-201ENST00000362704 69 ntBASIC-2.46□□□□□ -2.8
ACTBP60709 Y_RNA.53-201ENST00000362765 102 ntBASIC-2.46□□□□□ -2.8
ACTBP60709 RNU6-109P-201ENST00000516364 107 ntBASIC-2.46□□□□□ -2.8
ACTBP60709 RNU6-184P-201ENST00000516514 107 ntBASIC-2.46□□□□□ -2.8
ACTBP60709 MT-TM-201ENST00000387377 68 ntBASIC-2.47□□□□□ -2.8
ACTBP60709 RNY4P18-201ENST00000391107 89 ntBASIC-2.47□□□□□ -2.8
ACTBP60709 AC097484.2-201ENST00000509147 251 ntBASIC-2.47□□□□□ -2.8
ACTBP60709 TARS-215ENST00000626210 201 ntTSL 5 BASIC-2.47□□□□□ -2.8
ACTBP60709 Y_RNA.506-201ENST00000384494 102 ntBASIC-2.48□□□□□ -2.81
ACTBP60709 RNU6-1011P-201ENST00000384668 107 ntBASIC-2.48□□□□□ -2.81
ACTBP60709 RNU6-172P-201ENST00000411000 93 ntBASIC-2.48□□□□□ -2.81
ACTBP60709 MTND4LP1-201ENST00000446263 157 ntBASIC-2.48□□□□□ -2.81
ACTBP60709 AC093729.1-201ENST00000513074 128 ntBASIC-2.48□□□□□ -2.81
ACTBP60709 Y_RNA.290-201ENST00000364879 114 ntBASIC-2.49□□□□□ -2.81
ACTBP60709 Y_RNA.464-201ENST00000384282 110 ntBASIC-2.49□□□□□ -2.81
ACTBP60709 TRAJ33-201ENST00000390504 57 ntAPPRIS P1 BASIC-2.5□□□□□ -2.81
ACTBP60709 RNU6-554P-201ENST00000410466 106 ntBASIC-2.5□□□□□ -2.81
ACTBP60709 SCARNA15.1-201ENST00000516384 125 ntBASIC-2.5□□□□□ -2.81
ACTBP60709 MIRLET7A1-201ENST00000362295 80 ntBASIC-2.51□□□□□ -2.81
ACTBP60709 SNORD113.1-201ENST00000363280 73 ntBASIC-2.51□□□□□ -2.81
ACTBP60709 RNU6-668P-201ENST00000364180 107 ntBASIC-2.51□□□□□ -2.81
ACTBP60709 RNU6-686P-201ENST00000364839 107 ntBASIC-2.51□□□□□ -2.81
ACTBP60709 SNORD116-14-201ENST00000383894 92 ntBASIC-2.51□□□□□ -2.81
ACTBP60709 SNORD116-17-201ENST00000383929 92 ntBASIC-2.51□□□□□ -2.81
ACTBP60709 RNU6-106P-201ENST00000384405 107 ntBASIC-2.51□□□□□ -2.81
ACTBP60709 SNORD116-15-201ENST00000384445 92 ntBASIC-2.51□□□□□ -2.81
ACTBP60709 SNORD116-19-201ENST00000384729 92 ntBASIC-2.51□□□□□ -2.81
ACTBP60709 RNU6-346P-201ENST00000516288 111 ntBASIC-2.51□□□□□ -2.81
ACTBP60709 MIR4668-201ENST00000582284 70 ntBASIC-2.51□□□□□ -2.81
ACTBP60709 Y_RNA.139-201ENST00000363464 102 ntBASIC-2.52□□□□□ -2.81
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ACTBP60709 Y_RNA.803-201ENST00000614432 112 ntBASIC-2.52□□□□□ -2.81
ACTBP60709 Y_RNA.815-201ENST00000616655 112 ntBASIC-2.52□□□□□ -2.81
ACTBP60709 Y_RNA.795-201ENST00000619475 112 ntBASIC-2.52□□□□□ -2.81
ACTBP60709 Y_RNA.827-201ENST00000638104 112 ntBASIC-2.52□□□□□ -2.81
ACTBP60709 Y_RNA.349-201ENST00000365406 102 ntBASIC-2.53□□□□□ -2.81
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ACTBP60709 SNORA19-201ENST00000384737 128 ntBASIC-2.54□□□□□ -2.82
ACTBP60709 Y_RNA.620-201ENST00000411009 88 ntBASIC-2.54□□□□□ -2.82
ACTBP60709 RNY1P1-201ENST00000364372 112 ntBASIC-2.55□□□□□ -2.82
ACTBP60709 Y_RNA.421-201ENST00000384052 101 ntBASIC-2.55□□□□□ -2.82
ACTBP60709 MIR548N-201ENST00000408742 75 ntBASIC-2.55□□□□□ -2.82
ACTBP60709 Y_RNA.629-201ENST00000411368 105 ntBASIC-2.55□□□□□ -2.82
ACTBP60709 RNY4-201ENST00000516507 96 ntBASIC-2.55□□□□□ -2.82
ACTBP60709 RNU6-694P-201ENST00000364071 147 ntBASIC-2.56□□□□□ -2.82
ACTBP60709 RNA5SP173-201ENST00000364857 136 ntBASIC-2.56□□□□□ -2.82
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ACTBP60709 RNU6-402P-201ENST00000410678 103 ntBASIC-2.56□□□□□ -2.82
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ACTBP60709 RNU6-1306P-201ENST00000365219 99 ntBASIC-2.57□□□□□ -2.82
ACTBP60709 SNORD45A-201ENST00000384512 84 ntBASIC-2.57□□□□□ -2.82
ACTBP60709 RNU6-520P-201ENST00000384717 104 ntBASIC-2.57□□□□□ -2.82
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ACTBP60709 MIR202-201ENST00000362219 110 ntBASIC-2.58□□□□□ -2.82
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ACTBP60709 TRAJ53-201ENST00000390485 66 ntAPPRIS P1 BASIC-2.58□□□□□ -2.82
ACTBP60709 MIR8053-201ENST00000613344 75 ntBASIC-2.58□□□□□ -2.82
ACTBP60709 Y_RNA.544-201ENST00000384650 113 ntBASIC-2.59□□□□□ -2.82
ACTBP60709 Y_RNA.291-201ENST00000364886 113 ntBASIC-2.6□□□□□ -2.83
ACTBP60709 SNORD60-201ENST00000383903 83 ntBASIC-2.6□□□□□ -2.83
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ACTBP60709 MIRLET7A2-201ENST00000362105 72 ntBASIC-2.61□□□□□ -2.83
ACTBP60709 Y_RNA.69-201ENST00000362885 109 ntBASIC-2.61□□□□□ -2.83
ACTBP60709 RNY4P9-201ENST00000363194 97 ntBASIC-2.61□□□□□ -2.83
ACTBP60709 SNORD113-3-201ENST00000364830 72 ntBASIC-2.61□□□□□ -2.83
ACTBP60709 RNU6-649P-201ENST00000384463 107 ntBASIC-2.61□□□□□ -2.83
ACTBP60709 RNU6-267P-201ENST00000516714 103 ntBASIC-2.61□□□□□ -2.83
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