Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 RNU6-1174P-201ENST00000517278 101 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
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PGGT1BP53609 MIR4645-201ENST00000583158 77 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
PGGT1BP53609 MIR429-201ENST00000362106 83 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
PGGT1BP53609 Y_RNA.696-201ENST00000516725 107 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
PGGT1BP53609 MIR4802-201ENST00000581881 80 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
PGGT1BP53609 MIR633-201ENST00000384821 98 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
PGGT1BP53609 MIR579-201ENST00000385221 98 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
PGGT1BP53609 RNU6-721P-201ENST00000410155 105 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
PGGT1BP53609 Y_RNA.613-201ENST00000410726 97 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
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PGGT1BP53609 RNU6-1238P-201ENST00000517215 102 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
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PGGT1BP53609 MIR3179-3-201ENST00000579566 84 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
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PGGT1BP53609 RNU6-696P-201ENST00000390834 107 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
PGGT1BP53609 SNORD116.2-201ENST00000391251 93 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
PGGT1BP53609 SNORD75.1-201ENST00000408373 60 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
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PGGT1BP53609 AP001180.6-201ENST00000584918 159 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
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PGGT1BP53609 SNORD114-14-201ENST00000362723 75 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
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PGGT1BP53609 SNORD95.1-201ENST00000364099 68 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
PGGT1BP53609 MIR507-201ENST00000385234 94 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
PGGT1BP53609 MIR125B1-201ENST00000385236 88 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
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