Protein–RNA interactions for Protein: Q9P219

CCDC88C, Protein Daple, humanhuman

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Length 2,028 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC88CQ9P219 LEKR1-212ENST00000640869 237 ntTSL 5 BASIC-0.81□□□□□ -2.54
CCDC88CQ9P219 RNU6-880P-201ENST00000384526 107 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
CCDC88CQ9P219 MIR29B1-201ENST00000385015 81 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
CCDC88CQ9P219 RNU6-109P-201ENST00000516364 107 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
CCDC88CQ9P219 RNU6-589P-201ENST00000516485 107 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
CCDC88CQ9P219 RNU6-184P-201ENST00000516514 107 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
CCDC88CQ9P219 Y_RNA.464-201ENST00000384282 110 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
CCDC88CQ9P219 RNU6-696P-201ENST00000390834 107 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
CCDC88CQ9P219 SNORD113-2-201ENST00000391082 72 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
CCDC88CQ9P219 RNU6-630P-201ENST00000391258 106 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
CCDC88CQ9P219 MIR1207-201ENST00000408249 87 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
CCDC88CQ9P219 Y_RNA.620-201ENST00000411009 88 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
CCDC88CQ9P219 MIR4770-201ENST00000579149 58 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
CCDC88CQ9P219 MIR4441-201ENST00000582623 100 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
CCDC88CQ9P219 Y_RNA.74-201ENST00000362911 99 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
CCDC88CQ9P219 RNU6-698P-201ENST00000363523 107 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
CCDC88CQ9P219 Y_RNA.236-201ENST00000364427 111 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
CCDC88CQ9P219 RNU6-34P-201ENST00000364874 107 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
CCDC88CQ9P219 AC090616.4-201ENST00000448026 115 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
CCDC88CQ9P219 Y_RNA.709-201ENST00000516952 92 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
CCDC88CQ9P219 MIR1297-201ENST00000637311 77 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
CCDC88CQ9P219 SNORD113.1-201ENST00000363280 73 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
CCDC88CQ9P219 RNU6-303P-201ENST00000517091 106 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
CCDC88CQ9P219 AC132825.6-201ENST00000638861 357 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
CCDC88CQ9P219 MIR450A1-201ENST00000362262 91 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
CCDC88CQ9P219 SNORD116-14-201ENST00000383894 92 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
CCDC88CQ9P219 SNORD116-17-201ENST00000383929 92 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
CCDC88CQ9P219 SNORD116-15-201ENST00000384445 92 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
CCDC88CQ9P219 SNORD116-19-201ENST00000384729 92 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
CCDC88CQ9P219 MIR548M-201ENST00000408260 86 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
CCDC88CQ9P219 RNU4-61P-201ENST00000411243 107 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
CCDC88CQ9P219 AC008267.6-201ENST00000441664 139 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
CCDC88CQ9P219 Y_RNA.649-201ENST00000459077 103 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
CCDC88CQ9P219 RNU6-158P-201ENST00000517104 100 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
CCDC88CQ9P219 MIR664A-201ENST00000626086 82 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
CCDC88CQ9P219 RNU6-1216P-201ENST00000362590 107 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
CCDC88CQ9P219 RNU6-458P-201ENST00000384179 107 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
CCDC88CQ9P219 Y_RNA.611-201ENST00000410682 108 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
CCDC88CQ9P219 AC120024.2-201ENST00000576526 175 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
CCDC88CQ9P219 MIR3671-201ENST00000580455 88 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
CCDC88CQ9P219 U6.58-201ENST00000613107 107 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
CCDC88CQ9P219 TRAJ53-201ENST00000390485 66 ntAPPRIS P1 BASIC-0.86□□□□□ -2.55
CCDC88CQ9P219 snosnR66.1-201ENST00000391095 99 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
CCDC88CQ9P219 RNU7-151P-201ENST00000516930 53 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
CCDC88CQ9P219 RNU6-1174P-201ENST00000517278 101 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
CCDC88CQ9P219 MIR548V-201ENST00000584165 80 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
CCDC88CQ9P219 hsa-mir-3607.1-201ENST00000637229 79 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
CCDC88CQ9P219 Y_RNA.703-201ENST00000516846 111 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
CCDC88CQ9P219 MIR5683-201ENST00000636514 76 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
CCDC88CQ9P219 SNORD45.1-201ENST00000363181 77 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
CCDC88CQ9P219 RNA5SP215-201ENST00000363440 122 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
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CCDC88CQ9P219 MIR6502-201ENST00000617296 76 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
CCDC88CQ9P219 RNU6-766P-201ENST00000362478 107 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
CCDC88CQ9P219 RNU6-79P-201ENST00000362511 107 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
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CCDC88CQ9P219 RNU6-478P-201ENST00000363904 110 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
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CCDC88CQ9P219 RNU6-608P-201ENST00000383927 104 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
CCDC88CQ9P219 RNU6-675P-201ENST00000384236 104 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
CCDC88CQ9P219 RNU6-1154P-201ENST00000391001 104 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
CCDC88CQ9P219 MIR1302-5-201ENST00000408164 150 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
CCDC88CQ9P219 Y_RNA.603-201ENST00000410571 108 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
CCDC88CQ9P219 MTND4LP1-201ENST00000446263 157 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
CCDC88CQ9P219 AL031737.1-201ENST00000450125 223 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
CCDC88CQ9P219 RNU6-168P-201ENST00000516189 101 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
CCDC88CQ9P219 Y_RNA.678-201ENST00000516408 96 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
CCDC88CQ9P219 RNU6-755P-201ENST00000364400 103 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
CCDC88CQ9P219 Y_RNA.261-201ENST00000364631 102 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
CCDC88CQ9P219 SNORD45A-201ENST00000384512 84 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
CCDC88CQ9P219 MIR154-201ENST00000385243 84 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
CCDC88CQ9P219 Y_RNA.616-201ENST00000410835 95 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
CCDC88CQ9P219 RNA5SP180-201ENST00000516181 101 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
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