Protein–RNA interactions for Protein: Q1ED39

KNOP1, Lysine-rich nucleolar protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNOP1Q1ED39 U2.7-201ENST00000619197 100 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
KNOP1Q1ED39 RNU6-315P-201ENST00000362666 107 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
KNOP1Q1ED39 RNU6-924P-201ENST00000362926 108 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
KNOP1Q1ED39 MT-TQ-201ENST00000387372 72 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
KNOP1Q1ED39 RNU6-604P-201ENST00000390917 100 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
KNOP1Q1ED39 RNU4-63P-201ENST00000411313 118 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
KNOP1Q1ED39 MIR4484-201ENST00000582855 83 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.81-201ENST00000362997 102 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
KNOP1Q1ED39 SNORD45.1-201ENST00000363181 77 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.316-201ENST00000365118 111 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
KNOP1Q1ED39 RNU7-171P-201ENST00000459581 62 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.244-201ENST00000364484 109 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
KNOP1Q1ED39 SNORD114-17-201ENST00000364699 75 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
KNOP1Q1ED39 TRAJ57-201ENST00000390482 63 ntAPPRIS P1 BASIC-0.91□□□□□ -2.56
KNOP1Q1ED39 SCARNA20.2-201ENST00000516052 116 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
KNOP1Q1ED39 RNU6-30P-201ENST00000384561 107 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
KNOP1Q1ED39 RNU6-982P-201ENST00000516216 102 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
KNOP1Q1ED39 RNU6-294P-201ENST00000364999 102 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
KNOP1Q1ED39 TRAJ53-201ENST00000390485 66 ntAPPRIS P1 BASIC-0.93□□□□□ -2.56
KNOP1Q1ED39 RNU6-1094P-201ENST00000362416 104 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
KNOP1Q1ED39 SNORD114-25-201ENST00000363742 72 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
KNOP1Q1ED39 MIR548C-201ENST00000384815 97 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
KNOP1Q1ED39 MIR450A2-201ENST00000385022 100 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
KNOP1Q1ED39 MIR147A-201ENST00000385079 72 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.613-201ENST00000410726 97 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
KNOP1Q1ED39 RNU6ATAC17P-201ENST00000516074 71 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
KNOP1Q1ED39 MIR3681-201ENST00000580089 72 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.313-201ENST00000365095 103 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
KNOP1Q1ED39 MIR196A1-201ENST00000388006 70 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
KNOP1Q1ED39 RNU6-1089P-201ENST00000516473 104 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
KNOP1Q1ED39 MIR548AG1-201ENST00000579932 66 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
KNOP1Q1ED39 FAS-AS1.1-201ENST00000615327 126 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
KNOP1Q1ED39 MIR494-201ENST00000349529 81 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
KNOP1Q1ED39 SNORD115-22-201ENST00000364456 82 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.369-201ENST00000365568 117 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
KNOP1Q1ED39 RNU6-431P-201ENST00000383874 107 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
KNOP1Q1ED39 RNU7-174P-201ENST00000516248 59 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
KNOP1Q1ED39 MIR548AX-201ENST00000580117 73 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
KNOP1Q1ED39 MIR8053-201ENST00000613344 75 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
KNOP1Q1ED39 SNORD64-201ENST00000386683 67 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
KNOP1Q1ED39 MIR5582-201ENST00000579697 68 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
KNOP1Q1ED39 MIR4712-201ENST00000583750 82 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
KNOP1Q1ED39 MIR1245B-201ENST00000636115 69 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
KNOP1Q1ED39 RNU6-242P-201ENST00000384359 107 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
KNOP1Q1ED39 RNU6-1233P-201ENST00000362922 102 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
KNOP1Q1ED39 SNORA26.4-201ENST00000391188 123 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
KNOP1Q1ED39 MTND4LP1-201ENST00000446263 157 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
KNOP1Q1ED39 RNU6-1236P-201ENST00000517080 99 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
KNOP1Q1ED39 SNORD115-33-201ENST00000363723 82 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
KNOP1Q1ED39 RNU6-1276P-201ENST00000365372 104 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
KNOP1Q1ED39 RNU6-246P-201ENST00000384702 107 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
KNOP1Q1ED39 SCARNA18B-201ENST00000458806 135 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
KNOP1Q1ED39 MIR664A-201ENST00000626086 82 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
KNOP1Q1ED39 SNORD113.1-201ENST00000363280 73 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.246-201ENST00000364495 108 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
KNOP1Q1ED39 RNA5SP67-201ENST00000516422 131 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
KNOP1Q1ED39 MIR4666B-201ENST00000578142 81 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
KNOP1Q1ED39 RNU6-820P-201ENST00000384273 107 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
KNOP1Q1ED39 AL500527.2-201ENST00000454105 95 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
KNOP1Q1ED39 MIR382-201ENST00000637119 76 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.74-201ENST00000362911 99 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.94-201ENST00000363068 106 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
KNOP1Q1ED39 RNU6-698P-201ENST00000363523 107 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
KNOP1Q1ED39 RNU6-34P-201ENST00000364874 107 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
KNOP1Q1ED39 SNORD83B-201ENST00000386745 93 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
KNOP1Q1ED39 SNORD63.1-201ENST00000516178 80 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
KNOP1Q1ED39 SNORD45A-201ENST00000384512 84 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
KNOP1Q1ED39 RNU6-587P-201ENST00000391282 106 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
KNOP1Q1ED39 U7.5-201ENST00000517224 61 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
KNOP1Q1ED39 RNA5SP215-201ENST00000363440 122 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
KNOP1Q1ED39 RNU6-668P-201ENST00000364180 107 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.325-201ENST00000365171 122 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
KNOP1Q1ED39 RNU6-732P-201ENST00000516033 103 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
KNOP1Q1ED39 RNU6-1238P-201ENST00000517215 102 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
KNOP1Q1ED39 RNU7-88P-201ENST00000458752 63 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
KNOP1Q1ED39 U4.4-201ENST00000620626 117 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.282-201ENST00000364793 102 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
KNOP1Q1ED39 RNU6-787P-201ENST00000384032 107 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
KNOP1Q1ED39 RNU6-458P-201ENST00000384179 107 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
KNOP1Q1ED39 RNU6-1241P-201ENST00000384536 107 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
KNOP1Q1ED39 RNU6-70P-201ENST00000516438 60 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
KNOP1Q1ED39 snoU83B.1-201ENST00000517136 88 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
KNOP1Q1ED39 MIR548V-201ENST00000584165 80 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
KNOP1Q1ED39 U6.58-201ENST00000613107 107 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.236-201ENST00000364427 111 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
KNOP1Q1ED39 AL353691.2-201ENST00000443795 59 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
KNOP1Q1ED39 AC062037.1-201ENST00000605302 128 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
KNOP1Q1ED39 MIR527-201ENST00000385244 85 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
KNOP1Q1ED39 RNA5SP170-201ENST00000517150 101 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
KNOP1Q1ED39 RNU6-1174P-201ENST00000517278 101 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
KNOP1Q1ED39 RNU6-1298P-201ENST00000362456 101 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
KNOP1Q1ED39 RNU6-1152P-201ENST00000384576 107 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
KNOP1Q1ED39 AL078612.1-201ENST00000533009 150 ntTSL 5 BASIC-1.1□□□□□ -2.59
KNOP1Q1ED39 MIR429-201ENST00000362106 83 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
KNOP1Q1ED39 MIR154-201ENST00000385243 84 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
KNOP1Q1ED39 MIR4499-201ENST00000584834 69 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
KNOP1Q1ED39 uc_338.19-201ENST00000616808 99 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.788-201ENST00000622394 112 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
KNOP1Q1ED39 RNU6-1216P-201ENST00000362590 107 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
KNOP1Q1ED39 MIR630-201ENST00000384957 97 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
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