Protein–RNA interactions for Protein: Q16799

RTN1, Reticulon-1, humanhuman

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Length 776 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN1Q16799 MIR429-201ENST00000362106 83 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
RTN1Q16799 RNA5SP499-201ENST00000363982 119 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
RTN1Q16799 RNA5SP62-201ENST00000363457 110 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
RTN1Q16799 AL391099.1-201ENST00000624635 187 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
RTN1Q16799 RNU6-1174P-201ENST00000517278 101 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
RTN1Q16799 AL445584.3-201ENST00000617173 78 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
RTN1Q16799 MIR6514-201ENST00000622549 70 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
RTN1Q16799 RNU6-986P-201ENST00000363133 102 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
RTN1Q16799 RNA5SP98-201ENST00000363158 137 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
RTN1Q16799 CPEB3_ribozyme.1-201ENST00000408115 78 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
RTN1Q16799 AC108740.1-201ENST00000498629 225 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
RTN1Q16799 RNA5SP220-201ENST00000516298 104 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
RTN1Q16799 RNU6-1206P-201ENST00000516339 103 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
RTN1Q16799 uc_338.17-201ENST00000619633 179 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
RTN1Q16799 RNA5SP347-201ENST00000362445 119 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
RTN1Q16799 Y_RNA.139-201ENST00000363464 102 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
RTN1Q16799 MIR216A-201ENST00000385063 110 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
RTN1Q16799 RNU6-696P-201ENST00000390834 107 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
RTN1Q16799 RNU6-1133P-201ENST00000410963 100 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
RTN1Q16799 MIR329-2-201ENST00000385029 84 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
RTN1Q16799 RNA5SP163-201ENST00000410304 99 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
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RTN1Q16799 MIR548AA1-201ENST00000384971 97 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
RTN1Q16799 RNU6-995P-201ENST00000391244 107 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
RTN1Q16799 RNA5SP325-201ENST00000363756 130 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
RTN1Q16799 MIR548H2-201ENST00000408874 88 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
RTN1Q16799 AC069113.3-201ENST00000521019 150 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
RTN1Q16799 AC022709.1-201ENST00000615967 87 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
RTN1Q16799 MIR6734-201ENST00000621166 68 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
RTN1Q16799 MIR6513-201ENST00000621188 64 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
RTN1Q16799 KIF20B-201ENST00000260753 6306 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC0.54□□□□□ -2.32
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RTN1Q16799 AC114737.2-201ENST00000421583 173 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
RTN1Q16799 SNORD57-201ENST00000448188 72 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
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RTN1Q16799 SAMD9-203ENST00000620985 6754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.53□□□□□ -2.33
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RTN1Q16799 RNU6-42P-201ENST00000384165 107 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
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RTN1Q16799 Y_RNA.613-201ENST00000410726 97 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
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RTN1Q16799 Y_RNA.355-201ENST00000365462 98 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
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RTN1Q16799 SNORA42.1-201ENST00000363515 137 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
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RTN1Q16799 SNORD38.3-201ENST00000516599 73 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
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RTN1Q16799 RNA5SP134-201ENST00000516492 96 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
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RTN1Q16799 RNU6-1111P-201ENST00000391118 107 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
RTN1Q16799 MIR4280-201ENST00000582178 76 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
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