Protein–RNA interactions for Protein: Q16204

CCDC6, Coiled-coil domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC6Q16204 MIR4768-201ENST00000585270 74 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
CCDC6Q16204 snoR1.1-201ENST00000628177 80 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
CCDC6Q16204 Y_RNA.386-201ENST00000383913 105 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
CCDC6Q16204 MIRLET7B-201ENST00000385140 83 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
CCDC6Q16204 MIR4667-201ENST00000578933 66 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
CCDC6Q16204 U4.4-201ENST00000620626 117 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
CCDC6Q16204 MIR4315-1-201ENST00000636800 73 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
CCDC6Q16204 MIR4315-2-201ENST00000640925 73 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
CCDC6Q16204 RNA5SP192-201ENST00000364404 120 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
CCDC6Q16204 RNU6-901P-201ENST00000384593 106 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
CCDC6Q16204 RNU6-1133P-201ENST00000410963 100 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
CCDC6Q16204 AC244250.2-201ENST00000418731 148 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
CCDC6Q16204 RNU7-88P-201ENST00000458752 63 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
CCDC6Q16204 RNU7-159P-201ENST00000459284 62 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
CCDC6Q16204 AL353803.5-201ENST00000599815 141 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
CCDC6Q16204 MIR101-1-201ENST00000362265 75 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
CCDC6Q16204 Y_RNA.246-201ENST00000364495 108 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
CCDC6Q16204 RNU7-174P-201ENST00000516248 59 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
CCDC6Q16204 MIR4432-201ENST00000581823 84 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
CCDC6Q16204 Clostridiales-1.4-201ENST00000636807 150 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
CCDC6Q16204 SNORA25.4-201ENST00000363666 124 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
CCDC6Q16204 MIR124-2-201ENST00000385081 109 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
CCDC6Q16204 RNU6-539P-201ENST00000516665 103 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
CCDC6Q16204 RNU6-180P-201ENST00000516697 61 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
CCDC6Q16204 AL391099.1-201ENST00000624635 187 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
CCDC6Q16204 MIR371B-201ENST00000638082 66 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
CCDC6Q16204 SNORA42.1-201ENST00000363515 137 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
CCDC6Q16204 Y_RNA.250-201ENST00000364542 110 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
CCDC6Q16204 SNORD114-12-201ENST00000365400 75 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
CCDC6Q16204 MIR527-201ENST00000385244 85 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
CCDC6Q16204 SNORD113-2-201ENST00000391082 72 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
CCDC6Q16204 RNU6-848P-201ENST00000515948 107 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
CCDC6Q16204 RNU6-617P-201ENST00000516147 107 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
CCDC6Q16204 RNU6-473P-201ENST00000516164 107 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
CCDC6Q16204 RNU6-1049P-201ENST00000516414 107 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
CCDC6Q16204 RNU6ATAC22P-201ENST00000516794 89 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
CCDC6Q16204 Y_RNA.375-201ENST00000365625 101 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
CCDC6Q16204 SNORA41B-201ENST00000384785 128 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
CCDC6Q16204 AC125388.1-201ENST00000459631 156 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
CCDC6Q16204 SNORD38.3-201ENST00000516599 73 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
CCDC6Q16204 SNORD114-16-201ENST00000363044 70 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
CCDC6Q16204 Y_RNA.457-201ENST00000384237 111 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
CCDC6Q16204 SNORD56B-201ENST00000384713 71 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
CCDC6Q16204 CR383656.4-201ENST00000546909 122 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
CCDC6Q16204 Y_RNA.610-201ENST00000410681 103 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
CCDC6Q16204 RNU7-165P-201ENST00000458864 60 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
CCDC6Q16204 Y_RNA.236-201ENST00000364427 111 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
CCDC6Q16204 MIR214-201ENST00000385214 110 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
CCDC6Q16204 MIR892B-201ENST00000401279 77 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
CCDC6Q16204 AL021921.1-201ENST00000442774 93 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
CCDC6Q16204 MIR6888-201ENST00000621977 67 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
CCDC6Q16204 Y_RNA.109-201ENST00000363215 102 ntBASIC0□□□□□ -2.41
CCDC6Q16204 RNU6-698P-201ENST00000363523 107 ntBASIC0□□□□□ -2.41
CCDC6Q16204 RNU6-34P-201ENST00000364874 107 ntBASIC0□□□□□ -2.41
CCDC6Q16204 SNORD49B-201ENST00000365172 72 ntBASIC0□□□□□ -2.41
CCDC6Q16204 MIR633-201ENST00000384821 98 ntBASIC0□□□□□ -2.41
CCDC6Q16204 SCARNA21.1-201ENST00000515996 128 ntBASIC0□□□□□ -2.41
CCDC6Q16204 RNU6-542P-201ENST00000516405 103 ntBASIC0□□□□□ -2.41
CCDC6Q16204 RNA5SP67-201ENST00000516422 131 ntBASIC0□□□□□ -2.41
CCDC6Q16204 MIR4723-201ENST00000585070 81 ntBASIC0□□□□□ -2.41
CCDC6Q16204 RNU6-302P-201ENST00000365249 107 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
CCDC6Q16204 RNA5SP215-201ENST00000363440 122 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
CCDC6Q16204 SNORA25.5-201ENST00000363782 126 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
CCDC6Q16204 Y_RNA.282-201ENST00000364793 102 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
CCDC6Q16204 MIR579-201ENST00000385221 98 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
CCDC6Q16204 RNU6ATAC29P-201ENST00000408088 125 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
CCDC6Q16204 SNORD2-201ENST00000459163 69 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
CCDC6Q16204 RNA5SP169-201ENST00000517268 117 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
CCDC6Q16204 MIR548AX-201ENST00000580117 73 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
CCDC6Q16204 MIR466-201ENST00000580653 84 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
CCDC6Q16204 MIR655-201ENST00000362159 97 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
CCDC6Q16204 SNORD60.1-201ENST00000362451 73 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
CCDC6Q16204 RNU6-1079P-201ENST00000362861 110 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
CCDC6Q16204 RNU6-900P-201ENST00000384498 102 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
CCDC6Q16204 MIR1468-201ENST00000410600 86 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
CCDC6Q16204 U7.5-201ENST00000517224 61 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
CCDC6Q16204 MIR4464-201ENST00000580818 92 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
CCDC6Q16204 MIR4511-201ENST00000582784 87 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
CCDC6Q16204 U2.18-201ENST00000622185 84 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
CCDC6Q16204 SNORD115-23-201ENST00000364461 82 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
CCDC6Q16204 RNU7-55P-201ENST00000459426 62 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
CCDC6Q16204 Y_RNA.698-201ENST00000516798 118 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
CCDC6Q16204 RNU6-92P-201ENST00000605893 104 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
CCDC6Q16204 SNORD114-11-201ENST00000363738 75 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
CCDC6Q16204 RNU6-458P-201ENST00000384179 107 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
CCDC6Q16204 TRAJ28-201ENST00000390509 66 ntAPPRIS P1 BASIC-0.05□□□□□ -2.42
CCDC6Q16204 MIR4645-201ENST00000583158 77 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
CCDC6Q16204 U6.58-201ENST00000613107 107 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
CCDC6Q16204 MIR6854-201ENST00000614935 69 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
CCDC6Q16204 Y_RNA.74-201ENST00000362911 99 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
CCDC6Q16204 RNU6-973P-201ENST00000364690 107 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
CCDC6Q16204 RNU6-246P-201ENST00000384702 107 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
CCDC6Q16204 TRAJ54-201ENST00000390484 60 ntAPPRIS P1 BASIC-0.06□□□□□ -2.42
CCDC6Q16204 RNU6-788P-201ENST00000390967 104 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
CCDC6Q16204 SNORD116.2-201ENST00000391251 93 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
CCDC6Q16204 AC114755.3-201ENST00000481111 251 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
CCDC6Q16204 MIR4280-201ENST00000582178 76 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
CCDC6Q16204 MIR4290-201ENST00000583807 95 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
CCDC6Q16204 AL445584.3-201ENST00000617173 78 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
CCDC6Q16204 RPS29P8-201ENST00000445109 171 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 230.2 ms