Protein–RNA interactions for Protein: Q15003

NCAPH, Condensin complex subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 741 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPHQ15003 MIR9-2-201ENST00000384838 87 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
NCAPHQ15003 RNU6-1133P-201ENST00000410963 100 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
NCAPHQ15003 AC104692.1-201ENST00000472406 90 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
NCAPHQ15003 RNU6-649P-201ENST00000384463 107 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
NCAPHQ15003 TRAJ54-201ENST00000390484 60 ntAPPRIS P1 BASIC-0.07□□□□□ -2.42
NCAPHQ15003 RNU6-518P-201ENST00000516056 96 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
NCAPHQ15003 AC108676.2-201ENST00000605225 163 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
NCAPHQ15003 RNA5SP331-201ENST00000364986 107 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
NCAPHQ15003 SNORD49B-201ENST00000365172 72 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
NCAPHQ15003 MIR214-201ENST00000385214 110 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
NCAPHQ15003 AL021921.1-201ENST00000442774 93 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
NCAPHQ15003 RNU7-55P-201ENST00000459426 62 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
NCAPHQ15003 MIR548V-201ENST00000584165 80 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
NCAPHQ15003 MIR1295B-201ENST00000636144 60 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
NCAPHQ15003 RNU6-901P-201ENST00000384593 106 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
NCAPHQ15003 RNA5SP67-201ENST00000516422 131 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
NCAPHQ15003 RNA5SP470-201ENST00000516463 106 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
NCAPHQ15003 AL391099.1-201ENST00000624635 187 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
NCAPHQ15003 SNORA32.1-201ENST00000364514 115 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
NCAPHQ15003 RNU6-630P-201ENST00000391258 106 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
NCAPHQ15003 SNORD114-12-201ENST00000365400 75 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
NCAPHQ15003 MIR517B-201ENST00000385102 67 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
NCAPHQ15003 MIR4432-201ENST00000581823 84 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
NCAPHQ15003 MIR4645-201ENST00000583158 77 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
NCAPHQ15003 MIR101-1-201ENST00000362265 75 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
NCAPHQ15003 RNA5SP215-201ENST00000363440 122 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
NCAPHQ15003 SNORD95.1-201ENST00000364099 68 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
NCAPHQ15003 RNU6-973P-201ENST00000364690 107 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
NCAPHQ15003 Y_RNA.443-201ENST00000384135 111 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
NCAPHQ15003 MIR519A2-201ENST00000384990 87 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
NCAPHQ15003 MIR655-201ENST00000362159 97 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
NCAPHQ15003 SNORD115-23-201ENST00000364461 82 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
NCAPHQ15003 MIR409-201ENST00000362237 79 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
NCAPHQ15003 RNU7-174P-201ENST00000516248 59 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
NCAPHQ15003 RNU6-539P-201ENST00000516665 103 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
NCAPHQ15003 AL353803.5-201ENST00000599815 141 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
NCAPHQ15003 AL445193.1-201ENST00000441183 141 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
NCAPHQ15003 U6.111-201ENST00000636093 83 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
NCAPHQ15003 SNORA18.1-201ENST00000363418 128 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
NCAPHQ15003 SNORD114-28-201ENST00000363610 72 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
NCAPHQ15003 Y_RNA.375-201ENST00000365625 101 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
NCAPHQ15003 SNORD56B-201ENST00000384713 71 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
NCAPHQ15003 MIR630-201ENST00000384957 97 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
NCAPHQ15003 AC114801.3-201ENST00000510231 177 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
NCAPHQ15003 RNU7-154P-201ENST00000516194 62 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
NCAPHQ15003 Y_RNA.610-201ENST00000410681 103 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
NCAPHQ15003 RNU6-698P-201ENST00000363523 107 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
NCAPHQ15003 SNORA25.4-201ENST00000363666 124 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
NCAPHQ15003 RNU6-34P-201ENST00000364874 107 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
NCAPHQ15003 AC096531.1-201ENST00000419107 107 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
NCAPHQ15003 MIR5704-201ENST00000584029 77 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
NCAPHQ15003 MIR4263-201ENST00000584745 83 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
NCAPHQ15003 Y_RNA.246-201ENST00000364495 108 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
NCAPHQ15003 RPS29P8-201ENST00000445109 171 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
NCAPHQ15003 HOTAIRM1_3.1-201ENST00000619974 59 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
NCAPHQ15003 RNU6-1184P-201ENST00000384588 108 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
NCAPHQ15003 RNU6ATAC29P-201ENST00000408088 125 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
NCAPHQ15003 RNA5SP451-201ENST00000410588 110 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
NCAPHQ15003 SNORD4A-201ENST00000459174 72 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
NCAPHQ15003 RNA5SP266-201ENST00000410273 108 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
NCAPHQ15003 RNU6-542P-201ENST00000516405 103 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
NCAPHQ15003 AC005520.4-201ENST00000604337 90 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
NCAPHQ15003 AL590491.3-201ENST00000610731 82 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
NCAPHQ15003 RNU6-800P-201ENST00000384473 103 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
NCAPHQ15003 MIR224-201ENST00000384889 81 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
NCAPHQ15003 RNU6-1246P-201ENST00000391064 107 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
NCAPHQ15003 SNORD113-2-201ENST00000391082 72 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
NCAPHQ15003 Y_RNA.696-201ENST00000516725 107 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
NCAPHQ15003 MIR3666-201ENST00000607845 111 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
NCAPHQ15003 SNORD114-11-201ENST00000363738 75 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
NCAPHQ15003 SNORA62.4-201ENST00000365504 151 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
NCAPHQ15003 MIR8064-201ENST00000612863 90 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
NCAPHQ15003 U4.4-201ENST00000620626 117 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
NCAPHQ15003 Y_RNA.325-201ENST00000365171 122 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
NCAPHQ15003 RNA5SP66-201ENST00000517178 101 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
NCAPHQ15003 MIR6854-201ENST00000614935 69 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
NCAPHQ15003 TRAJ28-201ENST00000390509 66 ntAPPRIS P1 BASIC-0.27□□□□□ -2.45
NCAPHQ15003 MIR196A2-201ENST00000385189 110 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
NCAPHQ15003 RNA5SP169-201ENST00000517268 117 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
NCAPHQ15003 MIR8068-201ENST00000618032 68 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
NCAPHQ15003 MIR4788-201ENST00000639104 80 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
NCAPHQ15003 Y_RNA.457-201ENST00000384237 111 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
NCAPHQ15003 RNA5SP300-201ENST00000391197 107 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
NCAPHQ15003 MIR4280-201ENST00000582178 76 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
NCAPHQ15003 MIR4436A-201ENST00000585278 85 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
NCAPHQ15003 MIR548AG1-201ENST00000579932 66 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
NCAPHQ15003 Y_RNA.74-201ENST00000362911 99 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
NCAPHQ15003 MIR527-201ENST00000385244 85 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
NCAPHQ15003 SCARNA21.1-201ENST00000515996 128 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
NCAPHQ15003 RNU6-320P-201ENST00000516511 106 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
NCAPHQ15003 SNORD57-201ENST00000448188 72 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
NCAPHQ15003 SNORD38.3-201ENST00000516599 73 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
NCAPHQ15003 AC093726.3-201ENST00000637588 150 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
NCAPHQ15003 TRAJ9-201ENST00000390528 61 ntAPPRIS P1 BASIC-0.33□□□□□ -2.46
NCAPHQ15003 MIR4464-201ENST00000580818 92 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
NCAPHQ15003 MIR6888-201ENST00000621977 67 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
NCAPHQ15003 RNA5SP275-201ENST00000363936 118 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
NCAPHQ15003 Y_RNA.391-201ENST00000383933 94 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
NCAPHQ15003 AC114755.3-201ENST00000481111 251 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
NCAPHQ15003 MIR6851-201ENST00000617060 67 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 221.6 ms