Protein–RNA interactions for Protein: Q13835

PKP1, Plakophilin-1, humanhuman

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Length 747 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP1Q13835 SNORD38.3-201ENST00000516599 73 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
PKP1Q13835 MIR4436A-201ENST00000585278 85 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
PKP1Q13835 MIR6851-201ENST00000617060 67 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
PKP1Q13835 RNU6-668P-201ENST00000364180 107 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
PKP1Q13835 RNA5SP368-201ENST00000364298 116 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
PKP1Q13835 SNORD115-22-201ENST00000364456 82 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
PKP1Q13835 RNU6-895P-201ENST00000384125 103 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
PKP1Q13835 RNU6-411P-201ENST00000384451 107 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
PKP1Q13835 MIR604-201ENST00000384880 94 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
PKP1Q13835 Z95118.1-201ENST00000421372 247 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
PKP1Q13835 SNORA72.7-201ENST00000516349 94 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
PKP1Q13835 HOTAIRM1_3.1-201ENST00000619974 59 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
PKP1Q13835 RNU6-228P-201ENST00000362700 106 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
PKP1Q13835 RNU6-1241P-201ENST00000384536 107 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
PKP1Q13835 RNU6-587P-201ENST00000391282 106 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
PKP1Q13835 RNU6-279P-201ENST00000391297 101 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
PKP1Q13835 MIR5704-201ENST00000584029 77 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
PKP1Q13835 MIR8068-201ENST00000618032 68 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
PKP1Q13835 MIR664A-201ENST00000626086 82 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
PKP1Q13835 SNORD113.1-201ENST00000363280 73 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
PKP1Q13835 SNORD74.6-201ENST00000364796 70 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
PKP1Q13835 SNORA32.3-201ENST00000384772 121 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
PKP1Q13835 RNA5SP451-201ENST00000410588 110 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
PKP1Q13835 RNU6-982P-201ENST00000516216 102 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
PKP1Q13835 RNU6-881P-201ENST00000516813 102 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
PKP1Q13835 U2.7-201ENST00000619197 100 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
PKP1Q13835 MIR518B-201ENST00000385127 83 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
PKP1Q13835 AC021146.6-201ENST00000514659 117 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
PKP1Q13835 RNU6-857P-201ENST00000515893 110 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
PKP1Q13835 RNU6-1089P-201ENST00000516473 104 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
PKP1Q13835 SNORD45A-201ENST00000384512 84 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
PKP1Q13835 RNU6ATAC29P-201ENST00000408088 125 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
PKP1Q13835 AC108676.2-201ENST00000605225 163 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
PKP1Q13835 MIR6086-201ENST00000638065 55 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
PKP1Q13835 MIR519A2-201ENST00000384990 87 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
PKP1Q13835 MIR517B-201ENST00000385102 67 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
PKP1Q13835 SNORA3B-201ENST00000391305 131 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
PKP1Q13835 MIR3134-201ENST00000579433 74 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
PKP1Q13835 FAS-AS1.1-201ENST00000615327 126 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
PKP1Q13835 RNU6-1216P-201ENST00000362590 107 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
PKP1Q13835 RNA5SP215-201ENST00000363440 122 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
PKP1Q13835 Y_RNA.178-201ENST00000363832 102 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
PKP1Q13835 RNU6-721P-201ENST00000410155 105 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
PKP1Q13835 MIR548AZ-201ENST00000616567 95 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
PKP1Q13835 Y_RNA.685-201ENST00000516532 108 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
PKP1Q13835 SNORD114-14-201ENST00000362723 75 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
PKP1Q13835 RNA5SP25-201ENST00000410815 110 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
PKP1Q13835 Y_RNA.788-201ENST00000622394 112 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
PKP1Q13835 RPS29P8-201ENST00000445109 171 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
PKP1Q13835 SNORD22.1-201ENST00000516331 125 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
PKP1Q13835 RNU6-924P-201ENST00000362926 108 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
PKP1Q13835 MIR224-201ENST00000384889 81 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
PKP1Q13835 RNU6-871P-201ENST00000516122 100 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
PKP1Q13835 RNU6-687P-201ENST00000516443 89 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
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PKP1Q13835 MIR3179-3-201ENST00000579566 84 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
PKP1Q13835 MIR3179-4-201ENST00000617599 84 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
PKP1Q13835 MIR4662A-201ENST00000637499 67 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
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PKP1Q13835 MIR124-2-201ENST00000385081 109 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
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PKP1Q13835 SNORD75.1-201ENST00000408373 60 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
PKP1Q13835 RNA5SP225-201ENST00000410874 135 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
PKP1Q13835 AL445584.3-201ENST00000617173 78 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
PKP1Q13835 Y_RNA.189-201ENST00000363959 112 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
PKP1Q13835 SNORD113-2-201ENST00000391082 72 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
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PKP1Q13835 RNU6-1015P-201ENST00000517121 99 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
PKP1Q13835 MIR4464-201ENST00000580818 92 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
PKP1Q13835 MIR548V-201ENST00000584165 80 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
PKP1Q13835 MIR6888-201ENST00000621977 67 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
PKP1Q13835 Y_RNA.74-201ENST00000362911 99 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
PKP1Q13835 TRAJ57-201ENST00000390482 63 ntAPPRIS P1 BASIC-0.6□□□□□ -2.51
PKP1Q13835 RNU6-1246P-201ENST00000391064 107 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
PKP1Q13835 RNU6-1250P-201ENST00000391218 107 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
PKP1Q13835 RNU4-63P-201ENST00000411313 118 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
PKP1Q13835 SNORD115-31-201ENST00000365318 82 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
PKP1Q13835 MT-TQ-201ENST00000387372 72 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
PKP1Q13835 Y_RNA.610-201ENST00000410681 103 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
PKP1Q13835 SNORD114-25-201ENST00000363742 72 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
PKP1Q13835 snoU13.19-201ENST00000459148 104 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
PKP1Q13835 RNU6-30P-201ENST00000384561 107 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
PKP1Q13835 MIR527-201ENST00000385244 85 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
PKP1Q13835 Y_RNA.375-201ENST00000365625 101 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
PKP1Q13835 HAR1A.1-201ENST00000459583 118 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
PKP1Q13835 Y_RNA.244-201ENST00000364484 109 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
PKP1Q13835 RNU6-431P-201ENST00000383874 107 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
PKP1Q13835 SNORD116-24-201ENST00000384549 92 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
PKP1Q13835 MIR630-201ENST00000384957 97 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
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