Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 SNORD63.2-201ENST00000516303 64 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
MKRN3Q13064 RN7SL793P-201ENST00000583259 296 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
MKRN3Q13064 AL445584.3-201ENST00000617173 78 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
MKRN3Q13064 IL6ST-203ENST00000381287 8667 ntTSL 5 BASIC1.34□□□□□ -2.2
MKRN3Q13064 RNA5SP128-201ENST00000365305 116 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
MKRN3Q13064 MIR5000-201ENST00000577717 103 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
MKRN3Q13064 G3BP1-214ENST00000627077 114 ntTSL 5 BASIC1.33□□□□□ -2.2
MKRN3Q13064 MIR3170-201ENST00000582699 77 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
MKRN3Q13064 MGAT4C-209ENST00000611864 25116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.31□□□□□ -2.2
MKRN3Q13064 MIR216A-201ENST00000385063 110 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
MKRN3Q13064 MIR548H4-201ENST00000408689 111 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
MKRN3Q13064 AC211469.2-201ENST00000605461 205 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
MKRN3Q13064 MIR373-201ENST00000362273 69 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
MKRN3Q13064 RNU6-59P-201ENST00000384787 107 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
MKRN3Q13064 RNU6-530P-201ENST00000391180 107 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
MKRN3Q13064 AC098934.3-201ENST00000430450 190 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
MKRN3Q13064 SCARNA11.2-201ENST00000517183 154 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
MKRN3Q13064 uc_338.36-201ENST00000622331 158 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
MKRN3Q13064 RNU7-129P-201ENST00000516128 62 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
MKRN3Q13064 AL391099.1-201ENST00000624635 187 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
MKRN3Q13064 SNORA62.4-201ENST00000365504 151 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
MKRN3Q13064 MIR3973-201ENST00000579824 107 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
MKRN3Q13064 CALCRL-202ENST00000409998 5223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.25□□□□□ -2.21
MKRN3Q13064 RNA5SP98-201ENST00000363158 137 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
MKRN3Q13064 MIR1285-1-201ENST00000408593 84 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
MKRN3Q13064 SNORD114-21-201ENST00000606412 72 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
MKRN3Q13064 Y_RNA.613-201ENST00000410726 97 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
MKRN3Q13064 RNU6-1133P-201ENST00000410963 100 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
MKRN3Q13064 CYP3A137P-201ENST00000562436 69 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
MKRN3Q13064 Y_RNA.321-201ENST00000365149 102 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
MKRN3Q13064 AL590095.2-201ENST00000604136 117 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
MKRN3Q13064 RNU7-55P-201ENST00000459426 62 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
MKRN3Q13064 PSMC1P5-201ENST00000512850 177 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
MKRN3Q13064 MIR4698-201ENST00000577795 80 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
MKRN3Q13064 TRAJ22-201ENST00000390515 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.2□□□□□ -2.22
MKRN3Q13064 RNU6-1111P-201ENST00000391118 107 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
MKRN3Q13064 RNU6-973P-201ENST00000364690 107 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
MKRN3Q13064 RNU6-1238P-201ENST00000517215 102 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
MKRN3Q13064 AC104408.1-201ENST00000605241 170 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
MKRN3Q13064 ZBTB41-201ENST00000367405 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.18□□□□□ -2.22
MKRN3Q13064 RNU6-258P-201ENST00000390884 101 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
MKRN3Q13064 MIR4653-201ENST00000585107 83 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
MKRN3Q13064 AC138207.3-201ENST00000585289 166 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
MKRN3Q13064 RNU4-38P-201ENST00000364472 129 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
MKRN3Q13064 RNU6-732P-201ENST00000516033 103 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
MKRN3Q13064 MIR4714-201ENST00000580728 77 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
MKRN3Q13064 MIR193B-201ENST00000384907 83 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
MKRN3Q13064 AC108740.1-201ENST00000498629 225 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
MKRN3Q13064 MIR1468-201ENST00000410600 86 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
MKRN3Q13064 AC096531.1-201ENST00000419107 107 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
MKRN3Q13064 AC103810.9-201ENST00000606688 112 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
MKRN3Q13064 RNU6-863P-201ENST00000515989 104 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
MKRN3Q13064 SNORD44.1-201ENST00000363202 61 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
MKRN3Q13064 RNU6-900P-201ENST00000384498 102 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
MKRN3Q13064 RNU6-1326P-201ENST00000391262 107 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
MKRN3Q13064 MIR1273G-201ENST00000577677 100 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
MKRN3Q13064 Y_RNA.178-201ENST00000363832 102 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
MKRN3Q13064 MIR532-201ENST00000385025 91 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
MKRN3Q13064 MIR5704-201ENST00000584029 77 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
MKRN3Q13064 MIR548Q-201ENST00000408404 100 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
MKRN3Q13064 MIR8068-201ENST00000618032 68 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
MKRN3Q13064 uc_338.17-201ENST00000619633 179 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
MKRN3Q13064 MIR520D-201ENST00000385002 87 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
MKRN3Q13064 RPL39P28-201ENST00000465655 155 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
MKRN3Q13064 MIR6857-201ENST00000613267 93 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
MKRN3Q13064 Y_RNA.345-201ENST00000365384 92 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
MKRN3Q13064 MIR6507-201ENST00000613630 70 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
MKRN3Q13064 Y_RNA.115-201ENST00000363272 98 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
MKRN3Q13064 MIR4317-201ENST00000637586 65 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
MKRN3Q13064 SNORD19-201ENST00000391191 68 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
MKRN3Q13064 RNU6-127P-201ENST00000390897 107 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
MKRN3Q13064 Y_RNA.699-201ENST00000516803 93 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
MKRN3Q13064 SNORA27.2-201ENST00000363365 126 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
MKRN3Q13064 Y_RNA.206-201ENST00000364136 102 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
MKRN3Q13064 RNU6-455P-201ENST00000384681 107 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
MKRN3Q13064 MIR124-2-201ENST00000385081 109 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
MKRN3Q13064 SNORA42.1-201ENST00000363515 137 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
MKRN3Q13064 RNU6-1047P-201ENST00000364418 107 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
MKRN3Q13064 MIR6514-201ENST00000622549 70 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
MKRN3Q13064 MIR4426-201ENST00000640330 63 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
MKRN3Q13064 MIR6854-201ENST00000614935 69 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
MKRN3Q13064 MIR6513-201ENST00000621188 64 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
MKRN3Q13064 CEP290-203ENST00000547691 5968 ntTSL 1 (best) BASIC1.02□□□□□ -2.25
MKRN3Q13064 ZNF518A-209ENST00000614149 7911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1□□□□□ -2.25
MKRN3Q13064 MIR103A1-201ENST00000362165 78 ntBASIC1□□□□□ -2.25
MKRN3Q13064 MIR936-201ENST00000401264 98 ntBASIC1□□□□□ -2.25
MKRN3Q13064 RNA5SP330-201ENST00000517096 96 ntBASIC1□□□□□ -2.25
MKRN3Q13064 SNORD114-23-201ENST00000363536 72 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
MKRN3Q13064 RNA5SP457-201ENST00000363657 124 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
MKRN3Q13064 RNU6ATAC27P-201ENST00000408289 119 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
MKRN3Q13064 RNU6-894P-201ENST00000517094 105 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
MKRN3Q13064 MIR508-201ENST00000384857 115 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
MKRN3Q13064 MIR643-201ENST00000385267 97 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
MKRN3Q13064 RNA5SP121-201ENST00000516537 101 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
MKRN3Q13064 RNU6-1233P-201ENST00000362922 102 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
MKRN3Q13064 SNORA68.3-201ENST00000515906 83 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
MKRN3Q13064 RNU6ATAC22P-201ENST00000516794 89 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
MKRN3Q13064 MIR6835-201ENST00000621552 64 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
MKRN3Q13064 Y_RNA.68-201ENST00000362881 102 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
MKRN3Q13064 RNU6-815P-201ENST00000384080 113 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
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