Protein–RNA interactions for Protein: Q08ER8

ZNF543, Zinc finger protein 543, humanhuman

Predictions only

Length 600 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF543Q08ER8 TRAJ53-201ENST00000390485 66 ntAPPRIS P1 BASIC-0.59□□□□□ -2.5
ZNF543Q08ER8 RNA5SP451-201ENST00000410588 110 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
ZNF543Q08ER8 SCARNA18B-201ENST00000458806 135 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
ZNF543Q08ER8 MIR4636-201ENST00000582271 80 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
ZNF543Q08ER8 MIR548AZ-201ENST00000616567 95 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
ZNF543Q08ER8 Y_RNA.189-201ENST00000363959 112 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
ZNF543Q08ER8 MIR124-2-201ENST00000385081 109 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
ZNF543Q08ER8 MIR664A-201ENST00000626086 82 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
ZNF543Q08ER8 SNORD73B-201ENST00000364394 72 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
ZNF543Q08ER8 AP000533.3-201ENST00000447704 118 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
ZNF543Q08ER8 RNU6-1255P-201ENST00000363434 112 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
ZNF543Q08ER8 Y_RNA.433-201ENST00000384089 102 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
ZNF543Q08ER8 Y_RNA.484-201ENST00000384389 103 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
ZNF543Q08ER8 MIR604-201ENST00000384880 94 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
ZNF543Q08ER8 MIR8053-201ENST00000613344 75 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
ZNF543Q08ER8 Y_RNA.43-201ENST00000362670 111 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
ZNF543Q08ER8 RNU6-1246P-201ENST00000391064 107 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
ZNF543Q08ER8 SNORD18.2-201ENST00000459604 70 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
ZNF543Q08ER8 RNU6-1089P-201ENST00000516473 104 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
ZNF543Q08ER8 AL078612.1-201ENST00000533009 150 ntTSL 5 BASIC-0.64□□□□□ -2.51
ZNF543Q08ER8 MIR548AG1-201ENST00000579932 66 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
ZNF543Q08ER8 AC108676.2-201ENST00000605225 163 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
ZNF543Q08ER8 Y_RNA.788-201ENST00000622394 112 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
ZNF543Q08ER8 SNORD113.1-201ENST00000363280 73 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
ZNF543Q08ER8 SNORD45A-201ENST00000384512 84 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
ZNF543Q08ER8 MIR548C-201ENST00000384815 97 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
ZNF543Q08ER8 MIR517B-201ENST00000385102 67 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
ZNF543Q08ER8 RNU7-174P-201ENST00000516248 59 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
ZNF543Q08ER8 RNU6-758P-201ENST00000516292 89 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
ZNF543Q08ER8 RNY4P29-201ENST00000410801 97 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
ZNF543Q08ER8 Z95118.1-201ENST00000421372 247 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
ZNF543Q08ER8 MTND4LP1-201ENST00000446263 157 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
ZNF543Q08ER8 RNU6-924P-201ENST00000362926 108 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
ZNF543Q08ER8 RNU6-1241P-201ENST00000384536 107 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
ZNF543Q08ER8 RPS29P8-201ENST00000445109 171 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
ZNF543Q08ER8 RNU6-70P-201ENST00000516438 60 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
ZNF543Q08ER8 Y_RNA.388-201ENST00000383919 113 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
ZNF543Q08ER8 RNU6-35P-201ENST00000384530 107 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
ZNF543Q08ER8 MIR224-201ENST00000384889 81 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
ZNF543Q08ER8 SNORA26.2-201ENST00000390922 122 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
ZNF543Q08ER8 MIR3134-201ENST00000579433 74 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
ZNF543Q08ER8 FAS-AS1.1-201ENST00000615327 126 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
ZNF543Q08ER8 MIR3202-2-201ENST00000635980 79 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
ZNF543Q08ER8 Y_RNA.246-201ENST00000364495 108 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
ZNF543Q08ER8 RNA5SP173-201ENST00000364857 136 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
ZNF543Q08ER8 RNU6-246P-201ENST00000384702 107 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
ZNF543Q08ER8 RNU6-587P-201ENST00000391282 106 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
ZNF543Q08ER8 RNU6-698P-201ENST00000363523 107 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
ZNF543Q08ER8 RNU6-668P-201ENST00000364180 107 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
ZNF543Q08ER8 Y_RNA.244-201ENST00000364484 109 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
ZNF543Q08ER8 SNORD114-17-201ENST00000364699 75 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
ZNF543Q08ER8 RNU6-34P-201ENST00000364874 107 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
ZNF543Q08ER8 MIR1265-201ENST00000408444 86 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
ZNF543Q08ER8 Y_RNA.613-201ENST00000410726 97 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
ZNF543Q08ER8 RNA5SP395-201ENST00000516567 118 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
ZNF543Q08ER8 U4.4-201ENST00000620626 117 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
ZNF543Q08ER8 RNA5SP368-201ENST00000364298 116 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
ZNF543Q08ER8 RNU6-573P-201ENST00000383938 106 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
ZNF543Q08ER8 MIR154-201ENST00000385243 84 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
ZNF543Q08ER8 TRAJ57-201ENST00000390482 63 ntAPPRIS P1 BASIC-0.73□□□□□ -2.53
ZNF543Q08ER8 Y_RNA.74-201ENST00000362911 99 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
ZNF543Q08ER8 RNA5SP215-201ENST00000363440 122 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
ZNF543Q08ER8 Y_RNA.325-201ENST00000365171 122 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
ZNF543Q08ER8 SNORD115-31-201ENST00000365318 82 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
ZNF543Q08ER8 RNU6-687P-201ENST00000516443 89 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
ZNF543Q08ER8 RNU6-228P-201ENST00000362700 106 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
ZNF543Q08ER8 SNORD95.1-201ENST00000364099 68 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
ZNF543Q08ER8 RNU6-1124P-201ENST00000384169 107 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
ZNF543Q08ER8 SNORD116-24-201ENST00000384549 92 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
ZNF543Q08ER8 MIR548V-201ENST00000584165 80 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
ZNF543Q08ER8 RNU6-1216P-201ENST00000362590 107 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
ZNF543Q08ER8 MIR147A-201ENST00000385079 72 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
ZNF543Q08ER8 MIR1302-4-201ENST00000408701 150 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
ZNF543Q08ER8 RNA5SP25-201ENST00000410815 110 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
ZNF543Q08ER8 RNU6-1233P-201ENST00000362922 102 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
ZNF543Q08ER8 Y_RNA.282-201ENST00000364793 102 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
ZNF543Q08ER8 RNU6-431P-201ENST00000383874 107 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
ZNF543Q08ER8 MT-TQ-201ENST00000387372 72 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
ZNF543Q08ER8 SNORA26.4-201ENST00000391188 123 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
ZNF543Q08ER8 U7.5-201ENST00000517224 61 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
ZNF543Q08ER8 U7.4-201ENST00000614961 63 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
ZNF543Q08ER8 RNU6-895P-201ENST00000384125 103 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
ZNF543Q08ER8 RNU6-458P-201ENST00000384179 107 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
ZNF543Q08ER8 RNU6-411P-201ENST00000384451 107 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
ZNF543Q08ER8 MIR630-201ENST00000384957 97 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
ZNF543Q08ER8 MIR1255A-201ENST00000408338 113 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
ZNF543Q08ER8 U6.58-201ENST00000613107 107 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
ZNF543Q08ER8 MIR4679-1-201ENST00000637619 75 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
ZNF543Q08ER8 RNU6-279P-201ENST00000391297 101 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
ZNF543Q08ER8 RNU7-88P-201ENST00000458752 63 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
ZNF543Q08ER8 RNU6-732P-201ENST00000516033 103 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
ZNF543Q08ER8 SCARNA20.2-201ENST00000516052 116 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
ZNF543Q08ER8 RNU6-1015P-201ENST00000517121 99 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
ZNF543Q08ER8 RNU6-1238P-201ENST00000517215 102 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
ZNF543Q08ER8 SNORD115-33-201ENST00000363723 82 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
ZNF543Q08ER8 SNORD114-25-201ENST00000363742 72 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
ZNF543Q08ER8 Y_RNA.236-201ENST00000364427 111 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
ZNF543Q08ER8 Y_RNA.375-201ENST00000365625 101 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
ZNF543Q08ER8 MIR527-201ENST00000385244 85 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
ZNF543Q08ER8 SNORD64-201ENST00000386683 67 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.6 ms