Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

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Length 700 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 SCARNA11.2-201ENST00000517183 154 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
PTPREP23469 MIR3973-201ENST00000579824 107 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
PTPREP23469 AC103810.9-201ENST00000606688 112 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
PTPREP23469 AL445584.3-201ENST00000617173 78 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
PTPREP23469 MTRNR2L9-201ENST00000622562 75 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
PTPREP23469 MIR532-201ENST00000385025 91 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
PTPREP23469 MIR5000-201ENST00000577717 103 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
PTPREP23469 MIR6857-201ENST00000613267 93 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
PTPREP23469 MIR6779-201ENST00000617283 64 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
PTPREP23469 U6.103-201ENST00000637085 61 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
PTPREP23469 IL6ST-203ENST00000381287 8667 ntTSL 5 BASIC1.13□□□□□ -2.23
PTPREP23469 OR2A41P-201ENST00000473586 105 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
PTPREP23469 uc_338.36-201ENST00000622331 158 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
PTPREP23469 SNORD63.2-201ENST00000516303 64 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
PTPREP23469 CYP3A137P-201ENST00000562436 69 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
PTPREP23469 AL590095.2-201ENST00000604136 117 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
PTPREP23469 RNU6-1008P-201ENST00000384160 104 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
PTPREP23469 AL391099.1-201ENST00000624635 187 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
PTPREP23469 RNA5SP98-201ENST00000363158 137 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
PTPREP23469 SNORA62.4-201ENST00000365504 151 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
PTPREP23469 TRAJ22-201ENST00000390515 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.09□□□□□ -2.23
PTPREP23469 MIR3170-201ENST00000582699 77 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
PTPREP23469 RNU6-1133P-201ENST00000410963 100 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
PTPREP23469 RNU6-110P-201ENST00000384508 104 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
PTPREP23469 ZBTB41-201ENST00000367405 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.07□□□□□ -2.24
PTPREP23469 RNU6-530P-201ENST00000391180 107 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
PTPREP23469 MIR4698-201ENST00000577795 80 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
PTPREP23469 RNA5SP325-201ENST00000363756 130 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
PTPREP23469 Y_RNA.613-201ENST00000410726 97 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
PTPREP23469 RNU7-55P-201ENST00000459426 62 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
PTPREP23469 RNU6-973P-201ENST00000364690 107 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
PTPREP23469 Y_RNA.321-201ENST00000365149 102 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
PTPREP23469 RNU6-1111P-201ENST00000391118 107 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
PTPREP23469 MIR548H4-201ENST00000408689 111 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
PTPREP23469 AC108740.1-201ENST00000498629 225 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
PTPREP23469 RNU6-863P-201ENST00000515989 104 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
PTPREP23469 RNU6-59P-201ENST00000384787 107 ntBASIC1□□□□□ -2.25
PTPREP23469 SNORD44.1-201ENST00000363202 61 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
PTPREP23469 PSMC1P5-201ENST00000512850 177 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
PTPREP23469 RN7SL793P-201ENST00000583259 296 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
PTPREP23469 CALCRL-202ENST00000409998 5223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.98□□□□□ -2.25
PTPREP23469 RNU6-732P-201ENST00000516033 103 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
PTPREP23469 RNU6-1238P-201ENST00000517215 102 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
PTPREP23469 MIR4714-201ENST00000580728 77 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
PTPREP23469 AC104408.1-201ENST00000605241 170 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
PTPREP23469 uc_338.17-201ENST00000619633 179 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
PTPREP23469 AC096531.1-201ENST00000419107 107 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
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PTPREP23469 MIR5704-201ENST00000584029 77 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
PTPREP23469 RNU6-258P-201ENST00000390884 101 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
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PTPREP23469 SNORD114-2-201ENST00000363953 78 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
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PTPREP23469 MIR6513-201ENST00000621188 64 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
PTPREP23469 MIR520D-201ENST00000385002 87 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
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PTPREP23469 RNU6-1326P-201ENST00000391262 107 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
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PTPREP23469 MIR6854-201ENST00000614935 69 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
PTPREP23469 SNORA68.3-201ENST00000515906 83 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
PTPREP23469 RNU6ATAC22P-201ENST00000516794 89 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
PTPREP23469 AC138207.3-201ENST00000585289 166 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
PTPREP23469 MIR6507-201ENST00000613630 70 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
PTPREP23469 MIR4317-201ENST00000637586 65 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
PTPREP23469 CEP290-203ENST00000547691 5968 ntTSL 1 (best) BASIC0.86□□□□□ -2.27
PTPREP23469 SNORA27.2-201ENST00000363365 126 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
PTPREP23469 SNORA42.1-201ENST00000363515 137 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
PTPREP23469 MIR508-201ENST00000384857 115 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
PTPREP23469 MIR936-201ENST00000401264 98 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
PTPREP23469 MIR6866-201ENST00000638146 69 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
PTPREP23469 Y_RNA.345-201ENST00000365384 92 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
PTPREP23469 RNU6-815P-201ENST00000384080 113 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
PTPREP23469 LINC00345-201ENST00000443679 285 ntTSL 5 BASIC0.84□□□□□ -2.27
PTPREP23469 CR383656.4-201ENST00000546909 122 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
PTPREP23469 MIR4653-201ENST00000585107 83 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
PTPREP23469 MIR4426-201ENST00000640330 63 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
PTPREP23469 TEX15-201ENST00000256246 10110 ntTSL 1 (best) BASIC0.82□□□□□ -2.28
PTPREP23469 RNU6-1233P-201ENST00000362922 102 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
PTPREP23469 RNU6-1047P-201ENST00000364418 107 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
PTPREP23469 MIR193B-201ENST00000384907 83 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
PTPREP23469 MIR146A-201ENST00000385201 99 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
PTPREP23469 RNU6ATAC31P-201ENST00000408513 126 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
PTPREP23469 RNA5SP163-201ENST00000410304 99 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
PTPREP23469 RNU6-901P-201ENST00000384593 106 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
PTPREP23469 RNA5SP193-201ENST00000410353 107 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
PTPREP23469 MIR1273G-201ENST00000577677 100 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
PTPREP23469 Y_RNA.206-201ENST00000364136 102 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
PTPREP23469 SNORD56B-201ENST00000384713 71 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
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