Protein–RNA interactions for Protein: P23468

PTPRD, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRDP23468 RNU6-598P-201ENST00000364017 105 ntBASIC-2.38□□□□□ -2.79
PTPRDP23468 SNORD77.2-201ENST00000391045 68 ntBASIC-2.38□□□□□ -2.79
PTPRDP23468 AC072026.1-201ENST00000605023 201 ntBASIC-2.38□□□□□ -2.79
PTPRDP23468 RNU6-1081P-201ENST00000384537 107 ntBASIC-2.39□□□□□ -2.79
PTPRDP23468 AC020661.2-201ENST00000560114 134 ntBASIC-2.39□□□□□ -2.79
PTPRDP23468 Y_RNA.519-201ENST00000384553 102 ntBASIC-2.4□□□□□ -2.79
PTPRDP23468 Y_RNA.216-201ENST00000364205 93 ntBASIC-2.4□□□□□ -2.79
PTPRDP23468 RNY1P1-201ENST00000364372 112 ntBASIC-2.4□□□□□ -2.79
PTPRDP23468 Y_RNA.257-201ENST00000364596 102 ntBASIC-2.4□□□□□ -2.79
PTPRDP23468 Y_RNA.264-201ENST00000364665 102 ntBASIC-2.4□□□□□ -2.79
PTPRDP23468 Y_RNA.420-201ENST00000384043 110 ntBASIC-2.4□□□□□ -2.79
PTPRDP23468 RNU6-795P-201ENST00000516323 103 ntBASIC-2.4□□□□□ -2.79
PTPRDP23468 Y_RNA.47-201ENST00000362697 108 ntBASIC-2.41□□□□□ -2.8
PTPRDP23468 Y_RNA.291-201ENST00000364886 113 ntBASIC-2.41□□□□□ -2.8
PTPRDP23468 SNX3P1Y-201ENST00000615757 176 ntBASIC-2.41□□□□□ -2.8
PTPRDP23468 RNU6-982P-201ENST00000516216 102 ntBASIC-2.42□□□□□ -2.8
PTPRDP23468 Y_RNA.566-201ENST00000384735 101 ntBASIC-2.42□□□□□ -2.8
PTPRDP23468 MIR548C-201ENST00000384815 97 ntBASIC-2.42□□□□□ -2.8
PTPRDP23468 RNY3P8-201ENST00000411366 126 ntBASIC-2.42□□□□□ -2.8
PTPRDP23468 SNORD1B-201ENST00000363091 84 ntBASIC-2.43□□□□□ -2.8
PTPRDP23468 Y_RNA.109-201ENST00000363215 102 ntBASIC-2.43□□□□□ -2.8
PTPRDP23468 MIR519C-201ENST00000385053 87 ntBASIC-2.43□□□□□ -2.8
PTPRDP23468 TRAJ61-201ENST00000390479 60 ntAPPRIS P1 BASIC-2.43□□□□□ -2.8
PTPRDP23468 RNU7-61P-201ENST00000515897 61 ntBASIC-2.43□□□□□ -2.8
PTPRDP23468 RNU6-803P-201ENST00000516034 102 ntBASIC-2.43□□□□□ -2.8
PTPRDP23468 AC012531.4-201ENST00000616509 177 ntBASIC-2.43□□□□□ -2.8
PTPRDP23468 Y_RNA.321-201ENST00000365149 102 ntBASIC-2.44□□□□□ -2.8
PTPRDP23468 Y_RNA.8-201ENST00000362353 102 ntBASIC-2.44□□□□□ -2.8
PTPRDP23468 MIR548N-201ENST00000408742 75 ntBASIC-2.44□□□□□ -2.8
PTPRDP23468 SCARNA23-201ENST00000516060 130 ntBASIC-2.44□□□□□ -2.8
PTPRDP23468 MTRNR2L9-201ENST00000622562 75 ntBASIC-2.44□□□□□ -2.8
PTPRDP23468 AL035470.1-201ENST00000622571 220 ntBASIC-2.44□□□□□ -2.8
PTPRDP23468 Y_RNA.202-201ENST00000364083 110 ntBASIC-2.45□□□□□ -2.8
PTPRDP23468 RNU7-153P-201ENST00000516455 62 ntBASIC-2.45□□□□□ -2.8
PTPRDP23468 RNU6-182P-201ENST00000516970 105 ntBASIC-2.45□□□□□ -2.8
PTPRDP23468 MIR7978-201ENST00000636158 59 ntBASIC-2.45□□□□□ -2.8
PTPRDP23468 Y_RNA.574-201ENST00000384766 95 ntBASIC-2.46□□□□□ -2.8
PTPRDP23468 MIR581-201ENST00000384895 96 ntBASIC-2.46□□□□□ -2.8
PTPRDP23468 MIR3128-201ENST00000581957 66 ntBASIC-2.46□□□□□ -2.8
PTPRDP23468 RNU6-694P-201ENST00000364071 147 ntBASIC-2.46□□□□□ -2.8
PTPRDP23468 RNU6-772P-201ENST00000516042 105 ntBASIC-2.46□□□□□ -2.8
PTPRDP23468 SNORD115-37-201ENST00000363768 82 ntBASIC-2.47□□□□□ -2.8
PTPRDP23468 RNU6-649P-201ENST00000384463 107 ntBASIC-2.47□□□□□ -2.8
PTPRDP23468 RNU6-129P-201ENST00000391022 107 ntBASIC-2.47□□□□□ -2.8
PTPRDP23468 RNU6-523P-201ENST00000516304 54 ntBASIC-2.47□□□□□ -2.8
PTPRDP23468 RNU6-1283P-201ENST00000365314 105 ntBASIC-2.48□□□□□ -2.81
PTPRDP23468 RNU6-106P-201ENST00000384405 107 ntBASIC-2.48□□□□□ -2.81
PTPRDP23468 Y_RNA.609-201ENST00000410669 89 ntBASIC-2.48□□□□□ -2.81
PTPRDP23468 MTND4LP1-201ENST00000446263 157 ntBASIC-2.48□□□□□ -2.81
PTPRDP23468 SNORD63.2-201ENST00000516303 64 ntBASIC-2.48□□□□□ -2.81
PTPRDP23468 Y_RNA.11-201ENST00000362375 109 ntBASIC-2.48□□□□□ -2.81
PTPRDP23468 RNU6-974P-201ENST00000384099 108 ntBASIC-2.48□□□□□ -2.81
PTPRDP23468 AL158147.1-201ENST00000443970 75 ntBASIC-2.48□□□□□ -2.81
PTPRDP23468 Y_RNA.139-201ENST00000363464 102 ntBASIC-2.49□□□□□ -2.81
PTPRDP23468 RNU4-40P-201ENST00000364351 143 ntBASIC-2.49□□□□□ -2.81
PTPRDP23468 Y_RNA.240-201ENST00000364469 95 ntBASIC-2.49□□□□□ -2.81
PTPRDP23468 Y_RNA.398-201ENST00000383952 99 ntBASIC-2.49□□□□□ -2.81
PTPRDP23468 Y_RNA.460-201ENST00000384255 102 ntBASIC-2.49□□□□□ -2.81
PTPRDP23468 RNU6-912P-201ENST00000363800 104 ntBASIC-2.5□□□□□ -2.81
PTPRDP23468 SNORA41B-201ENST00000384785 128 ntBASIC-2.5□□□□□ -2.81
PTPRDP23468 Y_RNA.586-201ENST00000391146 98 ntBASIC-2.5□□□□□ -2.81
PTPRDP23468 Y_RNA.59-201ENST00000362828 102 ntBASIC-2.5□□□□□ -2.81
PTPRDP23468 Y_RNA.629-201ENST00000411368 105 ntBASIC-2.5□□□□□ -2.81
PTPRDP23468 Y_RNA.509-201ENST00000384506 99 ntBASIC-2.51□□□□□ -2.81
PTPRDP23468 SNORD113-3-201ENST00000364830 72 ntBASIC-2.52□□□□□ -2.81
PTPRDP23468 Y_RNA.680-201ENST00000516441 93 ntBASIC-2.52□□□□□ -2.81
PTPRDP23468 SNORD45.1-201ENST00000363181 77 ntBASIC-2.52□□□□□ -2.81
PTPRDP23468 Y_RNA.281-201ENST00000364774 94 ntBASIC-2.52□□□□□ -2.81
PTPRDP23468 Y_RNA.580-201ENST00000391004 95 ntBASIC-2.52□□□□□ -2.81
PTPRDP23468 RNU6-1023P-201ENST00000516137 106 ntBASIC-2.52□□□□□ -2.81
PTPRDP23468 SPRY4-IT1_2.1-201ENST00000612613 121 ntBASIC-2.52□□□□□ -2.81
PTPRDP23468 MIR8053-201ENST00000613344 75 ntBASIC-2.52□□□□□ -2.81
PTPRDP23468 RNU6-361P-201ENST00000364454 107 ntBASIC-2.53□□□□□ -2.81
PTPRDP23468 RNU6-1108P-201ENST00000516308 104 ntBASIC-2.53□□□□□ -2.81
PTPRDP23468 MIR548X2-201ENST00000579776 100 ntBASIC-2.53□□□□□ -2.81
PTPRDP23468 AC062037.2-201ENST00000610137 73 ntBASIC-2.53□□□□□ -2.81
PTPRDP23468 MIR1297-201ENST00000637311 77 ntBASIC-2.53□□□□□ -2.81
PTPRDP23468 SNORA20.1-201ENST00000364790 130 ntBASIC-2.54□□□□□ -2.82
PTPRDP23468 MIR579-201ENST00000385221 98 ntBASIC-2.54□□□□□ -2.82
PTPRDP23468 SNORD113.1-201ENST00000363280 73 ntBASIC-2.54□□□□□ -2.82
PTPRDP23468 Y_RNA.478-201ENST00000384358 107 ntBASIC-2.54□□□□□ -2.82
PTPRDP23468 RNU6-303P-201ENST00000517091 106 ntBASIC-2.54□□□□□ -2.82
PTPRDP23468 Y_RNA.307-201ENST00000365022 117 ntBASIC-2.55□□□□□ -2.82
PTPRDP23468 RNU6-1160P-201ENST00000384546 104 ntBASIC-2.55□□□□□ -2.82
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PTPRDP23468 Y_RNA.658-201ENST00000515990 97 ntBASIC-2.55□□□□□ -2.82
PTPRDP23468 RNU6-1107P-201ENST00000364817 104 ntBASIC-2.56□□□□□ -2.82
PTPRDP23468 AL157777.2-201ENST00000258070 137 ntBASIC-2.56□□□□□ -2.82
PTPRDP23468 RNU6-111P-201ENST00000517179 105 ntBASIC-2.56□□□□□ -2.82
PTPRDP23468 RNU6-755P-201ENST00000364400 103 ntBASIC-2.57□□□□□ -2.82
PTPRDP23468 RNU7-120P-201ENST00000459334 63 ntBASIC-2.57□□□□□ -2.82
PTPRDP23468 RNU6-834P-201ENST00000362367 110 ntBASIC-2.58□□□□□ -2.82
PTPRDP23468 TRAJ33-201ENST00000390504 57 ntAPPRIS P1 BASIC-2.58□□□□□ -2.82
PTPRDP23468 MIR548F4-201ENST00000408515 105 ntBASIC-2.58□□□□□ -2.82
PTPRDP23468 SNORA8.1-201ENST00000384250 140 ntBASIC-2.58□□□□□ -2.82
PTPRDP23468 AP001318.4-201ENST00000616637 121 ntBASIC-2.58□□□□□ -2.82
PTPRDP23468 MIRLET7A2-201ENST00000362105 72 ntBASIC-2.59□□□□□ -2.82
PTPRDP23468 Y_RNA.422-201ENST00000384054 114 ntBASIC-2.59□□□□□ -2.82
PTPRDP23468 RNU6-554P-201ENST00000410466 106 ntBASIC-2.59□□□□□ -2.82
PTPRDP23468 RNU6-426P-201ENST00000516464 97 ntBASIC-2.59□□□□□ -2.82
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