Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 RNU6-675P-201ENST00000384236 104 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
VPREB1P12018 SNORD63.1-201ENST00000516178 80 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
VPREB1P12018 HOTAIRM1_3.1-201ENST00000619974 59 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
VPREB1P12018 MIR409-201ENST00000362237 79 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
VPREB1P12018 SNORD115-22-201ENST00000364456 82 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
VPREB1P12018 RNA5SP266-201ENST00000410273 108 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
VPREB1P12018 RNU6-168P-201ENST00000516189 101 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
VPREB1P12018 RNA5SP461-201ENST00000516451 104 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
VPREB1P12018 snoU83B.1-201ENST00000517136 88 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
VPREB1P12018 RNU6-1131P-201ENST00000364955 107 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
VPREB1P12018 RNU6-1134P-201ENST00000365156 101 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
VPREB1P12018 Y_RNA.468-201ENST00000384298 102 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
VPREB1P12018 RNA5SP89-201ENST00000410300 108 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
VPREB1P12018 RNU7-134P-201ENST00000458997 64 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
VPREB1P12018 RNU7-154P-201ENST00000516194 62 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
VPREB1P12018 RNU6-557P-201ENST00000516842 110 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
VPREB1P12018 RNU6-478P-201ENST00000363904 110 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
VPREB1P12018 RNU6-656P-201ENST00000516785 107 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
VPREB1P12018 MIR3165-201ENST00000579874 75 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
VPREB1P12018 Y_RNA.17-201ENST00000362433 111 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
VPREB1P12018 RNU6-924P-201ENST00000362926 108 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
VPREB1P12018 RNU6-330P-201ENST00000363015 107 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
VPREB1P12018 RNU6-49P-201ENST00000384256 107 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
VPREB1P12018 Y_RNA.593-201ENST00000410292 98 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
VPREB1P12018 RNU7-88P-201ENST00000458752 63 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
VPREB1P12018 SNORA8.1-201ENST00000384250 140 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
VPREB1P12018 SNORA26.4-201ENST00000391188 123 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
VPREB1P12018 RNU6-303P-201ENST00000517091 106 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
VPREB1P12018 FAS-AS1.1-201ENST00000615327 126 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
VPREB1P12018 U2.7-201ENST00000619197 100 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
VPREB1P12018 RNU6-1216P-201ENST00000362590 107 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
VPREB1P12018 RNU6-686P-201ENST00000364839 107 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
VPREB1P12018 Y_RNA.532-201ENST00000384590 113 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
VPREB1P12018 RNU6-246P-201ENST00000384702 107 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
VPREB1P12018 snoMBII-202.2-201ENST00000517263 86 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
VPREB1P12018 AC006160.2-201ENST00000637708 154 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
VPREB1P12018 RNU6-1233P-201ENST00000362922 102 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
VPREB1P12018 RNU6-129P-201ENST00000391022 107 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
VPREB1P12018 AP002795.1-201ENST00000534879 84 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
VPREB1P12018 MIR4306-201ENST00000583390 91 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
VPREB1P12018 MIRLET7A1-201ENST00000362295 80 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
VPREB1P12018 Y_RNA.73-201ENST00000362910 113 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
VPREB1P12018 AL021921.1-201ENST00000442774 93 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
VPREB1P12018 RNU6-1238P-201ENST00000517215 102 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
VPREB1P12018 U7.5-201ENST00000517224 61 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
VPREB1P12018 SNORD115-33-201ENST00000363723 82 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
VPREB1P12018 RNU6-645P-201ENST00000364649 106 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
VPREB1P12018 Y_RNA.457-201ENST00000384237 111 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
VPREB1P12018 MIR548C-201ENST00000384815 97 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
VPREB1P12018 Y_RNA.613-201ENST00000410726 97 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
VPREB1P12018 RNU6-732P-201ENST00000516033 103 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
VPREB1P12018 RNU6-604P-201ENST00000390917 100 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
VPREB1P12018 SNORD19-201ENST00000391191 68 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
VPREB1P12018 AC074348.1-201ENST00000426503 132 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
VPREB1P12018 MIR3675-201ENST00000583661 73 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
VPREB1P12018 Y_RNA.219-201ENST00000364232 113 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
VPREB1P12018 RNU6-153P-201ENST00000364422 104 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
VPREB1P12018 MIR507-201ENST00000385234 94 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
VPREB1P12018 MIR4484-201ENST00000582855 83 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
VPREB1P12018 MIR6818-201ENST00000621576 65 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
VPREB1P12018 RNA5SP26-201ENST00000362406 119 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
VPREB1P12018 SNX3P1X-201ENST00000414887 175 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
VPREB1P12018 RNU6-982P-201ENST00000516216 102 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
VPREB1P12018 hsa-mir-3607.1-201ENST00000637229 79 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
VPREB1P12018 AL353691.2-201ENST00000443795 59 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
VPREB1P12018 Y_RNA.181-201ENST00000363872 101 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
VPREB1P12018 RNY1P1-201ENST00000364372 112 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
VPREB1P12018 MIR8485-201ENST00000401372 91 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
VPREB1P12018 RNY4P30-201ENST00000410216 95 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
VPREB1P12018 Y_RNA.607-201ENST00000410597 98 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
VPREB1P12018 RPL35AP4-201ENST00000412007 102 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
VPREB1P12018 IGLL4P-201ENST00000614590 133 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
VPREB1P12018 RNU6-807P-201ENST00000516805 107 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
VPREB1P12018 RNU6-706P-201ENST00000517229 104 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
VPREB1P12018 RNU6-1174P-201ENST00000517278 101 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
VPREB1P12018 MIR29B1-201ENST00000385015 81 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
VPREB1P12018 RNA5SP180-201ENST00000516181 101 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
VPREB1P12018 RNU7-174P-201ENST00000516248 59 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
VPREB1P12018 MIR5588-201ENST00000581890 63 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
VPREB1P12018 MIR5683-201ENST00000636514 76 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
VPREB1P12018 Y_RNA.426-201ENST00000384068 113 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
VPREB1P12018 MIR601-201ENST00000385256 79 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
VPREB1P12018 SNORD45.1-201ENST00000363181 77 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
VPREB1P12018 Y_RNA.236-201ENST00000364427 111 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
VPREB1P12018 RNA5SP331-201ENST00000364986 107 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
VPREB1P12018 Y_RNA.325-201ENST00000365171 122 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
VPREB1P12018 RNU6-458P-201ENST00000384179 107 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
VPREB1P12018 U6.58-201ENST00000613107 107 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
VPREB1P12018 hsa-mir-4536-1.1-201ENST00000636519 88 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
VPREB1P12018 RNU6-979P-201ENST00000383896 107 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
VPREB1P12018 MIR1297-201ENST00000637311 77 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
VPREB1P12018 Y_RNA.316-201ENST00000365118 111 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
VPREB1P12018 MIR889-201ENST00000401280 79 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
VPREB1P12018 MIR1285-2-201ENST00000408311 88 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
VPREB1P12018 MIR548Q-201ENST00000408404 100 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
VPREB1P12018 RNU6-1089P-201ENST00000516473 104 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
VPREB1P12018 U4.4-201ENST00000620626 117 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
VPREB1P12018 ULK3-223ENST00000631115 126 ntTSL 5 BASIC-1.19□□□□□ -2.6
VPREB1P12018 MIR6874-201ENST00000635894 71 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
VPREB1P12018 Y_RNA.109-201ENST00000363215 102 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms