Protein–RNA interactions for Protein: A7XYQ1

SOBP, Sine oculis-binding protein homolog, humanhuman

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Length 873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOBPA7XYQ1 MIR373-201ENST00000362273 69 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SOBPA7XYQ1 Y_RNA.139-201ENST00000363464 102 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SOBPA7XYQ1 SNORA40.8-201ENST00000411034 126 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SOBPA7XYQ1 MIR6857-201ENST00000613267 93 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SOBPA7XYQ1 MTRNR2L9-201ENST00000622562 75 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SOBPA7XYQ1 ZNF518A-210ENST00000624776 7994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.1□□□□□ -2.23
SOBPA7XYQ1 MIR1197-201ENST00000408818 88 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
SOBPA7XYQ1 RNU6-1232P-201ENST00000516299 86 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
SOBPA7XYQ1 SNORA25.18-201ENST00000607153 114 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
SOBPA7XYQ1 RN7SL660P-201ENST00000614852 299 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
SOBPA7XYQ1 AC084368.1-201ENST00000620935 65 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
SOBPA7XYQ1 ACA64.5-201ENST00000516207 127 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SOBPA7XYQ1 AC103810.9-201ENST00000606688 112 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SOBPA7XYQ1 CALCRL-202ENST00000409998 5223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.07□□□□□ -2.24
SOBPA7XYQ1 RNU6-59P-201ENST00000384787 107 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SOBPA7XYQ1 MIR936-201ENST00000401264 98 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SOBPA7XYQ1 MIR548H4-201ENST00000408689 111 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SOBPA7XYQ1 RNA5SP285-201ENST00000516619 119 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SOBPA7XYQ1 MIR4464-201ENST00000580818 92 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SOBPA7XYQ1 MIR4432-201ENST00000581823 84 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SOBPA7XYQ1 MIR6755-201ENST00000619993 66 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SOBPA7XYQ1 RNU4-38P-201ENST00000364472 129 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SOBPA7XYQ1 MIR532-201ENST00000385025 91 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SOBPA7XYQ1 RNU6-721P-201ENST00000410155 105 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SOBPA7XYQ1 SNORD114-21-201ENST00000606412 72 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SOBPA7XYQ1 RNU6ATAC4P-201ENST00000387446 126 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
SOBPA7XYQ1 MIR518A1-201ENST00000385068 85 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
SOBPA7XYQ1 AC008883.1-201ENST00000506562 193 ntTSL 3 BASIC1.04□□□□□ -2.24
SOBPA7XYQ1 SNORD63.1-201ENST00000516178 80 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
SOBPA7XYQ1 U7.5-201ENST00000517224 61 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
SOBPA7XYQ1 RNU6-1174P-201ENST00000517278 101 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
SOBPA7XYQ1 AC104408.1-201ENST00000605241 170 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
SOBPA7XYQ1 IL6ST-203ENST00000381287 8667 ntTSL 5 BASIC1.03□□□□□ -2.24
SOBPA7XYQ1 Y_RNA.321-201ENST00000365149 102 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
SOBPA7XYQ1 Y_RNA.423-201ENST00000384057 113 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
SOBPA7XYQ1 MIR3925-201ENST00000584674 77 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
SOBPA7XYQ1 MIR6888-201ENST00000621977 67 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
SOBPA7XYQ1 RNA5SP331-201ENST00000364986 107 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
SOBPA7XYQ1 SNORA62.4-201ENST00000365504 151 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
SOBPA7XYQ1 SNORA36.2-201ENST00000384004 127 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
SOBPA7XYQ1 SNORD71-201ENST00000411292 86 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
SOBPA7XYQ1 snoU13.19-201ENST00000459148 104 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
SOBPA7XYQ1 MIR4714-201ENST00000580728 77 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
SOBPA7XYQ1 AL445584.3-201ENST00000617173 78 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
SOBPA7XYQ1 RNU6-974P-201ENST00000384099 108 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
SOBPA7XYQ1 RNU6-863P-201ENST00000515989 104 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
SOBPA7XYQ1 RNA5SP128-201ENST00000365305 116 ntBASIC1□□□□□ -2.25
SOBPA7XYQ1 OR2A41P-201ENST00000473586 105 ntBASIC1□□□□□ -2.25
SOBPA7XYQ1 MIR608-201ENST00000384820 100 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
SOBPA7XYQ1 MIR760-201ENST00000390220 80 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
SOBPA7XYQ1 MIR3170-201ENST00000582699 77 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
SOBPA7XYQ1 snoR1.1-201ENST00000628177 80 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
SOBPA7XYQ1 Y_RNA.613-201ENST00000410726 97 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
SOBPA7XYQ1 RNU7-55P-201ENST00000459426 62 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
SOBPA7XYQ1 AP000676.1-201ENST00000533307 52 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
SOBPA7XYQ1 RNU6-110P-201ENST00000384508 104 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SOBPA7XYQ1 RNU4-54P-201ENST00000516428 129 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SOBPA7XYQ1 MIR3973-201ENST00000579824 107 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SOBPA7XYQ1 RNA5SP98-201ENST00000363158 137 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SOBPA7XYQ1 RNU6-973P-201ENST00000364690 107 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SOBPA7XYQ1 RNU7-88P-201ENST00000458752 63 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SOBPA7XYQ1 SNORD63.2-201ENST00000516303 64 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SOBPA7XYQ1 MIR2909-201ENST00000617113 69 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SOBPA7XYQ1 AL391099.1-201ENST00000624635 187 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SOBPA7XYQ1 AC096531.1-201ENST00000419107 107 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
SOBPA7XYQ1 SCARNA11.2-201ENST00000517183 154 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
SOBPA7XYQ1 MIR4711-201ENST00000578274 70 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
SOBPA7XYQ1 RNU6-30P-201ENST00000384561 107 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
SOBPA7XYQ1 RNU6-530P-201ENST00000391180 107 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
SOBPA7XYQ1 MIR1468-201ENST00000410600 86 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
SOBPA7XYQ1 RNU6-900P-201ENST00000384498 102 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
SOBPA7XYQ1 RNA5SP193-201ENST00000410353 107 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
SOBPA7XYQ1 RPL39P28-201ENST00000465655 155 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
SOBPA7XYQ1 MIR4636-201ENST00000582271 80 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
SOBPA7XYQ1 ZNF518A-209ENST00000614149 7911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.89□□□□□ -2.27
SOBPA7XYQ1 RNU6-1111P-201ENST00000391118 107 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
SOBPA7XYQ1 RNU6-1238P-201ENST00000517215 102 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
SOBPA7XYQ1 RNU6-1326P-201ENST00000391262 107 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
SOBPA7XYQ1 RNU6-732P-201ENST00000516033 103 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
SOBPA7XYQ1 uc_338.17-201ENST00000619633 179 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
SOBPA7XYQ1 MIR499B-201ENST00000636498 73 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
SOBPA7XYQ1 ZBTB41-201ENST00000367405 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.88□□□□□ -2.27
SOBPA7XYQ1 RNU6-1008P-201ENST00000384160 104 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
SOBPA7XYQ1 RNU6-1133P-201ENST00000410963 100 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
SOBPA7XYQ1 RNU6-894P-201ENST00000517094 105 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
SOBPA7XYQ1 AC108740.1-201ENST00000498629 225 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
SOBPA7XYQ1 RNU6-351P-201ENST00000516097 100 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
SOBPA7XYQ1 MIR6507-201ENST00000613630 70 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
SOBPA7XYQ1 SNORA27.2-201ENST00000363365 126 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
SOBPA7XYQ1 RNA5SP347-201ENST00000362445 119 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
SOBPA7XYQ1 SNORD44.1-201ENST00000363202 61 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
SOBPA7XYQ1 RNU6-1047P-201ENST00000364418 107 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
SOBPA7XYQ1 Y_RNA.345-201ENST00000365384 92 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
SOBPA7XYQ1 MIR146A-201ENST00000385201 99 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
SOBPA7XYQ1 RNU6-258P-201ENST00000390884 101 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
SOBPA7XYQ1 SNORA62.5-201ENST00000516634 120 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
SOBPA7XYQ1 MIR4698-201ENST00000577795 80 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
SOBPA7XYQ1 MIR4317-201ENST00000637586 65 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
SOBPA7XYQ1 MIR6759-201ENST00000638110 65 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
SOBPA7XYQ1 SNORA42.1-201ENST00000363515 137 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
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