Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULT6

ZNRF3, E3 ubiquitin-protein ligase ZNRF3, humanhuman

Predictions only

Length 936 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNRF3Q9ULT6 MIR610-201ENST00000385139 96 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
ZNRF3Q9ULT6 SNORD115-22-201ENST00000364456 82 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
ZNRF3Q9ULT6 Y_RNA.565-201ENST00000384719 101 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
ZNRF3Q9ULT6 RNA5SP299-201ENST00000391203 116 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
ZNRF3Q9ULT6 RNU6-687P-201ENST00000516443 89 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
ZNRF3Q9ULT6 RNU6-175P-201ENST00000516896 107 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
ZNRF3Q9ULT6 RN7SL660P-201ENST00000614852 299 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
ZNRF3Q9ULT6 RNU6-1036P-201ENST00000383959 104 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
ZNRF3Q9ULT6 SNORD45A-201ENST00000384512 84 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
ZNRF3Q9ULT6 RNU6ATAC22P-201ENST00000516794 89 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
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ZNRF3Q9ULT6 MIR4636-201ENST00000582271 80 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
ZNRF3Q9ULT6 HOTAIR_3.1-201ENST00000611352 97 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
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ZNRF3Q9ULT6 MTND4LP1-201ENST00000446263 157 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
ZNRF3Q9ULT6 MIR5190-201ENST00000581537 80 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
ZNRF3Q9ULT6 MIR6514-201ENST00000622549 70 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
ZNRF3Q9ULT6 SNORD113.1-201ENST00000363280 73 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
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ZNRF3Q9ULT6 SNORA42.1-201ENST00000363515 137 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
ZNRF3Q9ULT6 RNA5SP163-201ENST00000410304 99 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
ZNRF3Q9ULT6 RNA5SP98-201ENST00000363158 137 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
ZNRF3Q9ULT6 MIR593-201ENST00000384856 100 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
ZNRF3Q9ULT6 MIR106A-201ENST00000384870 81 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
ZNRF3Q9ULT6 RNU6-982P-201ENST00000516216 102 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
ZNRF3Q9ULT6 MIR4743-201ENST00000584576 69 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
ZNRF3Q9ULT6 SNORD115-25-201ENST00000362619 82 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
ZNRF3Q9ULT6 RNA5SP214-201ENST00000363378 118 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
ZNRF3Q9ULT6 SNORA33.1-201ENST00000364957 130 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
ZNRF3Q9ULT6 MIR1265-201ENST00000408444 86 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
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ZNRF3Q9ULT6 SNORD115-31-201ENST00000365318 82 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
ZNRF3Q9ULT6 SNORA49-201ENST00000386157 136 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
ZNRF3Q9ULT6 RNU6ATAC11P-201ENST00000408541 125 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
ZNRF3Q9ULT6 CR383656.4-201ENST00000546909 122 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
ZNRF3Q9ULT6 RNU6-1216P-201ENST00000362590 107 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
ZNRF3Q9ULT6 RNU6-656P-201ENST00000516785 107 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
ZNRF3Q9ULT6 MIR4802-201ENST00000581881 80 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
ZNRF3Q9ULT6 MIR148A-201ENST00000362215 68 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
ZNRF3Q9ULT6 RNU6-668P-201ENST00000364180 107 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
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ZNRF3Q9ULT6 RNU6-1089P-201ENST00000516473 104 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
ZNRF3Q9ULT6 MIR4768-201ENST00000585270 74 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
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ZNRF3Q9ULT6 SNORD116-24-201ENST00000384549 92 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
ZNRF3Q9ULT6 RNU6-337P-201ENST00000391243 106 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
ZNRF3Q9ULT6 MIR1255B2-201ENST00000408618 67 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
ZNRF3Q9ULT6 MIR4667-201ENST00000578933 66 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
ZNRF3Q9ULT6 AC090617.8-201ENST00000623339 167 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
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ZNRF3Q9ULT6 RNA5SP215-201ENST00000363440 122 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
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ZNRF3Q9ULT6 AC114801.3-201ENST00000510231 177 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
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ZNRF3Q9ULT6 U6.111-201ENST00000636093 83 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
ZNRF3Q9ULT6 RNU6-46P-201ENST00000383860 107 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
ZNRF3Q9ULT6 RNU6-1133P-201ENST00000410963 100 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
ZNRF3Q9ULT6 AC104692.1-201ENST00000472406 90 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
ZNRF3Q9ULT6 RNU6-518P-201ENST00000516056 96 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
ZNRF3Q9ULT6 RNA5SP470-201ENST00000516463 106 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
ZNRF3Q9ULT6 MIR4290-201ENST00000583807 95 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
ZNRF3Q9ULT6 Clostridiales-1.4-201ENST00000636807 150 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
ZNRF3Q9ULT6 MIR371B-201ENST00000638082 66 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
ZNRF3Q9ULT6 SNORD114-16-201ENST00000363044 70 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
ZNRF3Q9ULT6 SNORA25.4-201ENST00000363666 124 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
ZNRF3Q9ULT6 RNU6-302P-201ENST00000365249 107 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
ZNRF3Q9ULT6 MIR517B-201ENST00000385102 67 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
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