Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZR4

VSX1, Visual system homeobox 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 365 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSX1Q9NZR4 MIR8087-201ENST00000612745 78 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
VSX1Q9NZR4 U6.96-201ENST00000636425 70 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
VSX1Q9NZR4 RNU6-46P-201ENST00000383860 107 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
VSX1Q9NZR4 RNU6-604P-201ENST00000390917 100 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
VSX1Q9NZR4 RNU6-687P-201ENST00000516443 89 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
VSX1Q9NZR4 Y_RNA.205-201ENST00000364128 113 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
VSX1Q9NZR4 Y_RNA.540-201ENST00000384638 111 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
VSX1Q9NZR4 MIR593-201ENST00000384856 100 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
VSX1Q9NZR4 MIR4768-201ENST00000585270 74 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
VSX1Q9NZR4 SNORD115-22-201ENST00000364456 82 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
VSX1Q9NZR4 RNU6-1296P-201ENST00000383879 107 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
VSX1Q9NZR4 RNU6-645P-201ENST00000364649 106 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
VSX1Q9NZR4 RNU6-302P-201ENST00000365249 107 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
VSX1Q9NZR4 RNU6-895P-201ENST00000384125 103 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
VSX1Q9NZR4 RNU6-634P-201ENST00000459134 106 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
VSX1Q9NZR4 MIR4290-201ENST00000583807 95 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
VSX1Q9NZR4 Y_RNA.788-201ENST00000622394 112 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
VSX1Q9NZR4 SNORD113.1-201ENST00000363280 73 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
VSX1Q9NZR4 SNORA49-201ENST00000386157 136 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
VSX1Q9NZR4 RNA5SP63-201ENST00000391225 112 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
VSX1Q9NZR4 snoU13.13-201ENST00000458842 104 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
VSX1Q9NZR4 MIR4667-201ENST00000578933 66 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
VSX1Q9NZR4 MIR664A-201ENST00000626086 82 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
VSX1Q9NZR4 RNU6-1216P-201ENST00000362590 107 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
VSX1Q9NZR4 SNORD114-16-201ENST00000363044 70 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
VSX1Q9NZR4 RNA5SP470-201ENST00000516463 106 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
VSX1Q9NZR4 RNU6-656P-201ENST00000516785 107 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
VSX1Q9NZR4 RNU6-881P-201ENST00000516813 102 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
VSX1Q9NZR4 MIR6773-201ENST00000612812 74 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
VSX1Q9NZR4 RNU6-502P-201ENST00000362419 108 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
VSX1Q9NZR4 RNU6-1015P-201ENST00000517121 99 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
VSX1Q9NZR4 MIR6779-201ENST00000617283 64 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
VSX1Q9NZR4 SNORD114-5-201ENST00000362928 70 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
VSX1Q9NZR4 RNA5SP457-201ENST00000363657 124 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
VSX1Q9NZR4 SNORA33.1-201ENST00000364957 130 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
VSX1Q9NZR4 RNU6-900P-201ENST00000384498 102 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
VSX1Q9NZR4 RNU6-668P-201ENST00000364180 107 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
VSX1Q9NZR4 MIR1197-201ENST00000408818 88 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
VSX1Q9NZR4 RNA5SP330-201ENST00000517096 96 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
VSX1Q9NZR4 AP000676.1-201ENST00000533307 52 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
VSX1Q9NZR4 Y_RNA.115-201ENST00000363272 98 ntBASIC0□□□□□ -2.41
VSX1Q9NZR4 RNA5SP215-201ENST00000363440 122 ntBASIC0□□□□□ -2.41
VSX1Q9NZR4 Y_RNA.185-201ENST00000363894 100 ntBASIC0□□□□□ -2.41
VSX1Q9NZR4 SNORD45A-201ENST00000384512 84 ntBASIC0□□□□□ -2.41
VSX1Q9NZR4 RNU6-523P-201ENST00000516304 54 ntBASIC0□□□□□ -2.41
VSX1Q9NZR4 CYP3A54P-201ENST00000566950 75 ntBASIC0□□□□□ -2.41
VSX1Q9NZR4 MIR6507-201ENST00000613630 70 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
VSX1Q9NZR4 SNORA18.1-201ENST00000363418 128 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
VSX1Q9NZR4 MIRLET7B-201ENST00000385140 83 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
VSX1Q9NZR4 TRAJ54-201ENST00000390484 60 ntAPPRIS P1 BASIC-0.02□□□□□ -2.41
VSX1Q9NZR4 RNU6-337P-201ENST00000391243 106 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
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VSX1Q9NZR4 RNU7-55P-201ENST00000459426 62 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
VSX1Q9NZR4 AC008883.1-201ENST00000506562 193 ntTSL 3 BASIC-0.02□□□□□ -2.41
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VSX1Q9NZR4 AL109933.3-201ENST00000619095 188 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
VSX1Q9NZR4 RNU6-1089P-201ENST00000516473 104 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
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VSX1Q9NZR4 RNA5SP257-201ENST00000363023 116 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
VSX1Q9NZR4 SNORD115-31-201ENST00000365318 82 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
VSX1Q9NZR4 RNU6-455P-201ENST00000384681 107 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
VSX1Q9NZR4 Y_RNA.565-201ENST00000384719 101 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
VSX1Q9NZR4 MIR329-2-201ENST00000385029 84 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
VSX1Q9NZR4 MIR889-201ENST00000401280 79 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
VSX1Q9NZR4 RNU6ATAC11P-201ENST00000408541 125 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
VSX1Q9NZR4 RNA5SP285-201ENST00000516619 119 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
VSX1Q9NZR4 MIR4263-201ENST00000584745 83 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
VSX1Q9NZR4 snoR1.1-201ENST00000628177 80 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
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VSX1Q9NZR4 RNU6-929P-201ENST00000384429 107 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
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VSX1Q9NZR4 MIR5190-201ENST00000581537 80 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
VSX1Q9NZR4 SNORD114-31-201ENST00000363219 75 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
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VSX1Q9NZR4 MIR1255B2-201ENST00000408618 67 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
VSX1Q9NZR4 AC244250.2-201ENST00000418731 148 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
VSX1Q9NZR4 IGLVI-20-201ENST00000519296 130 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
VSX1Q9NZR4 U2.7-201ENST00000619197 100 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
VSX1Q9NZR4 SNORD115-23-201ENST00000364461 82 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
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VSX1Q9NZR4 SNORD30.1-201ENST00000391309 70 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
VSX1Q9NZR4 MIR4432-201ENST00000581823 84 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
VSX1Q9NZR4 MIR3666-201ENST00000607845 111 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
VSX1Q9NZR4 MIR8064-201ENST00000612863 90 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
VSX1Q9NZR4 AL391099.1-201ENST00000624635 187 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
VSX1Q9NZR4 MIR655-201ENST00000362159 97 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
VSX1Q9NZR4 SNORD116-24-201ENST00000384549 92 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
VSX1Q9NZR4 MIR548C-201ENST00000384815 97 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
VSX1Q9NZR4 RNU6-542P-201ENST00000516405 103 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
VSX1Q9NZR4 Y_RNA.375-201ENST00000365625 101 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
VSX1Q9NZR4 RNU6-1184P-201ENST00000384588 108 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
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