Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZZ0

HOXD1, Homeobox protein Hox-D1, humanhuman

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD1Q9GZZ0 MIR5588-201ENST00000581890 63 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-979P-201ENST00000383896 107 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-1162P-201ENST00000384443 104 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
HOXD1Q9GZZ0 Y_RNA.532-201ENST00000384590 113 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-284P-201ENST00000411105 106 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
HOXD1Q9GZZ0 MIR6854-201ENST00000614935 69 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
HOXD1Q9GZZ0 MIR8068-201ENST00000618032 68 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-330P-201ENST00000363015 107 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
HOXD1Q9GZZ0 SNORD114-31-201ENST00000363219 75 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
HOXD1Q9GZZ0 Y_RNA.426-201ENST00000384068 113 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
HOXD1Q9GZZ0 AC074348.1-201ENST00000426503 132 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
HOXD1Q9GZZ0 IGLVI-20-201ENST00000519296 130 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
HOXD1Q9GZZ0 RNA5SP285-201ENST00000516619 119 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
HOXD1Q9GZZ0 CYP3A54P-201ENST00000566950 75 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
HOXD1Q9GZZ0 MIR5582-201ENST00000579697 68 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
HOXD1Q9GZZ0 MIR6759-201ENST00000638110 65 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-294P-201ENST00000364999 102 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
HOXD1Q9GZZ0 SNORA8.1-201ENST00000384250 140 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
HOXD1Q9GZZ0 MIR204-201ENST00000385200 110 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
HOXD1Q9GZZ0 MIR1255B2-201ENST00000408618 67 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
HOXD1Q9GZZ0 MIR4645-201ENST00000583158 77 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
HOXD1Q9GZZ0 SNORD114-28-201ENST00000363610 72 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
HOXD1Q9GZZ0 Y_RNA.219-201ENST00000364232 113 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
HOXD1Q9GZZ0 Y_RNA.316-201ENST00000365118 111 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
HOXD1Q9GZZ0 Y_RNA.369-201ENST00000365568 117 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
HOXD1Q9GZZ0 RNU7-171P-201ENST00000459581 62 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
HOXD1Q9GZZ0 AC022137.1-201ENST00000483735 151 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
HOXD1Q9GZZ0 RNU6ATAC17P-201ENST00000516074 71 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-656P-201ENST00000516785 107 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
HOXD1Q9GZZ0 MIR3675-201ENST00000583661 73 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
HOXD1Q9GZZ0 AL353803.5-201ENST00000599815 141 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
HOXD1Q9GZZ0 MIR494-201ENST00000349529 81 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-315P-201ENST00000362666 107 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
HOXD1Q9GZZ0 MIR450A2-201ENST00000385022 100 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
HOXD1Q9GZZ0 MIR518B-201ENST00000385127 83 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
HOXD1Q9GZZ0 SNORA13-201ENST00000458790 133 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
HOXD1Q9GZZ0 RNA5SP470-201ENST00000516463 106 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
HOXD1Q9GZZ0 SNORD114-14-201ENST00000362723 75 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
HOXD1Q9GZZ0 SNORA62.4-201ENST00000365504 151 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-1184P-201ENST00000384588 108 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
HOXD1Q9GZZ0 MIR4464-201ENST00000580818 92 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
HOXD1Q9GZZ0 MIR4484-201ENST00000582855 83 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
HOXD1Q9GZZ0 MIR8064-201ENST00000612863 90 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
HOXD1Q9GZZ0 MIR548AZ-201ENST00000616567 95 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
HOXD1Q9GZZ0 MIR1297-201ENST00000637311 77 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-1298P-201ENST00000362456 101 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
HOXD1Q9GZZ0 Y_RNA.185-201ENST00000363894 100 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-645P-201ENST00000364649 106 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
HOXD1Q9GZZ0 SNORA3B-201ENST00000391305 131 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
HOXD1Q9GZZ0 RNU6ATAC29P-201ENST00000408088 125 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
HOXD1Q9GZZ0 SNORD22.1-201ENST00000516331 125 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-807P-201ENST00000516805 107 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
HOXD1Q9GZZ0 hsa-mir-3130-1.1-201ENST00000579223 75 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
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HOXD1Q9GZZ0 RNU6-380P-201ENST00000410207 107 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
HOXD1Q9GZZ0 AC021146.6-201ENST00000514659 117 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
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HOXD1Q9GZZ0 MIR3179-2-201ENST00000579107 84 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
HOXD1Q9GZZ0 MIR3179-3-201ENST00000579566 84 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
HOXD1Q9GZZ0 MIR3179-4-201ENST00000617599 84 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
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HOXD1Q9GZZ0 RNU7-154P-201ENST00000516194 62 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
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HOXD1Q9GZZ0 U2.7-201ENST00000619197 100 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
HOXD1Q9GZZ0 HOTAIRM1_3.1-201ENST00000619974 59 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
HOXD1Q9GZZ0 MIR6888-201ENST00000621977 67 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
HOXD1Q9GZZ0 MIR1245B-201ENST00000636115 69 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
HOXD1Q9GZZ0 SNORD45.1-201ENST00000363181 77 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
HOXD1Q9GZZ0 Y_RNA.313-201ENST00000365095 103 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
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HOXD1Q9GZZ0 RNU6-1250P-201ENST00000391218 107 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
HOXD1Q9GZZ0 AL021921.1-201ENST00000442774 93 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-881P-201ENST00000516813 102 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
HOXD1Q9GZZ0 AP001180.6-201ENST00000584918 159 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
HOXD1Q9GZZ0 AL445584.3-201ENST00000617173 78 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-1094P-201ENST00000362416 104 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
HOXD1Q9GZZ0 RPS29P8-201ENST00000445109 171 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
HOXD1Q9GZZ0 MIR4802-201ENST00000581881 80 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
HOXD1Q9GZZ0 AC062037.1-201ENST00000605302 128 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
HOXD1Q9GZZ0 Y_RNA.189-201ENST00000363959 112 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-820P-201ENST00000384273 107 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
HOXD1Q9GZZ0 SNORA32.3-201ENST00000384772 121 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
HOXD1Q9GZZ0 TRAJ53-201ENST00000390485 66 ntAPPRIS P1 BASIC-0.56□□□□□ -2.5
HOXD1Q9GZZ0 AP000533.3-201ENST00000447704 118 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-982P-201ENST00000516216 102 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
HOXD1Q9GZZ0 Y_RNA.698-201ENST00000516798 118 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
HOXD1Q9GZZ0 MIR4666B-201ENST00000578142 81 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
HOXD1Q9GZZ0 Y_RNA.30-201ENST00000362572 97 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
HOXD1Q9GZZ0 Y_RNA.94-201ENST00000363068 106 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
HOXD1Q9GZZ0 SCARNA18B-201ENST00000458806 135 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
HOXD1Q9GZZ0 SNORD115-22-201ENST00000364456 82 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-787P-201ENST00000384032 107 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
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