Protein–RNA interactions for Protein: Q99687

MEIS3, Homeobox protein Meis3, humanhuman

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Length 375 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEIS3Q99687 U2.7-201ENST00000619197 100 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
MEIS3Q99687 Y_RNA.250-201ENST00000364542 110 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
MEIS3Q99687 RNU6-1327P-201ENST00000365302 105 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
MEIS3Q99687 SNORA15B-2-201ENST00000384058 135 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
MEIS3Q99687 SNORA15B-1-201ENST00000384334 135 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
MEIS3Q99687 RNU6ATAC4P-201ENST00000387446 126 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
MEIS3Q99687 MIR5093-201ENST00000583199 100 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
MEIS3Q99687 MIR6773-201ENST00000612812 74 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
MEIS3Q99687 MIR630-201ENST00000384957 97 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
MEIS3Q99687 RNU6-1246P-201ENST00000391064 107 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
MEIS3Q99687 MIR1255B2-201ENST00000408618 67 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
MEIS3Q99687 RNA5SP163-201ENST00000410304 99 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
MEIS3Q99687 RNU6-782P-201ENST00000516852 104 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
MEIS3Q99687 MIR6514-201ENST00000622549 70 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
MEIS3Q99687 MIR924-201ENST00000638017 53 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
MEIS3Q99687 TRAJ42-201ENST00000390495 66 ntAPPRIS P1 BASIC0.22□□□□□ -2.37
MEIS3Q99687 MIR548AG1-201ENST00000579932 66 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
MEIS3Q99687 AC104408.1-201ENST00000605241 170 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
MEIS3Q99687 AC010487.4-201ENST00000637027 61 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
MEIS3Q99687 RNU6-502P-201ENST00000362419 108 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
MEIS3Q99687 SNORD115-25-201ENST00000362619 82 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
MEIS3Q99687 SNORA75.1-201ENST00000391130 148 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
MEIS3Q99687 RNA5SP299-201ENST00000391203 116 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
MEIS3Q99687 uc_338.36-201ENST00000622331 158 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
MEIS3Q99687 SNORD114-5-201ENST00000362928 70 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
MEIS3Q99687 SNORA25.4-201ENST00000363666 124 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
MEIS3Q99687 MIR9-2-201ENST00000384838 87 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
MEIS3Q99687 MIR6718-201ENST00000616153 80 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
MEIS3Q99687 RNA5SP214-201ENST00000363378 118 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
MEIS3Q99687 Y_RNA.340-201ENST00000365330 92 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
MEIS3Q99687 MIR1265-201ENST00000408444 86 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
MEIS3Q99687 RNU6-518P-201ENST00000516056 96 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
MEIS3Q99687 MIR4514-201ENST00000581410 57 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
MEIS3Q99687 Y_RNA.375-201ENST00000365625 101 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
MEIS3Q99687 MIR519A2-201ENST00000384990 87 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
MEIS3Q99687 TRAJ9-201ENST00000390528 61 ntAPPRIS P1 BASIC0.18□□□□□ -2.38
MEIS3Q99687 RNU7-174P-201ENST00000516248 59 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
MEIS3Q99687 HOTAIR_3.1-201ENST00000611352 97 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
MEIS3Q99687 U4.4-201ENST00000620626 117 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
MEIS3Q99687 Y_RNA.325-201ENST00000365171 122 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
MEIS3Q99687 MIR145-201ENST00000384967 88 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
MEIS3Q99687 MIRLET7B-201ENST00000385140 83 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
MEIS3Q99687 MIR1295A-201ENST00000408463 79 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
MEIS3Q99687 MIR4315-1-201ENST00000636800 73 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
MEIS3Q99687 MIR4315-2-201ENST00000640925 73 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
MEIS3Q99687 MIR517B-201ENST00000385102 67 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
MEIS3Q99687 MIR6507-201ENST00000613630 70 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
MEIS3Q99687 KIF20B-201ENST00000260753 6306 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC0.16□□□□□ -2.38
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MEIS3Q99687 AC008883.1-201ENST00000506562 193 ntTSL 3 BASIC0.15□□□□□ -2.39
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MEIS3Q99687 Y_RNA.205-201ENST00000364128 113 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
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MEIS3Q99687 AC125388.1-201ENST00000459631 156 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
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MEIS3Q99687 MIR4511-201ENST00000582784 87 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
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MEIS3Q99687 SNORA41B-201ENST00000384785 128 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
MEIS3Q99687 AL021921.1-201ENST00000442774 93 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
MEIS3Q99687 RNU7-165P-201ENST00000458864 60 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
MEIS3Q99687 SYCP2-202ENST00000371001 5479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC0.1□□□□□ -2.39
MEIS3Q99687 SNORD115-23-201ENST00000364461 82 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
MEIS3Q99687 RNU7-159P-201ENST00000459284 62 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
MEIS3Q99687 RNU6ATAC22P-201ENST00000516794 89 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
MEIS3Q99687 RNA5SP480-201ENST00000516840 109 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
MEIS3Q99687 MIR8068-201ENST00000618032 68 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
MEIS3Q99687 AC103706.3-201ENST00000636297 85 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
MEIS3Q99687 MIR330-201ENST00000362196 94 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
MEIS3Q99687 SNORA25.5-201ENST00000363782 126 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
MEIS3Q99687 SNORD56B-201ENST00000384713 71 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
MEIS3Q99687 AL445193.1-201ENST00000441183 141 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
MEIS3Q99687 RNU7-55P-201ENST00000459426 62 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
MEIS3Q99687 MIR4432-201ENST00000581823 84 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
MEIS3Q99687 AL391099.1-201ENST00000624635 187 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
MEIS3Q99687 snoR1.1-201ENST00000628177 80 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
MEIS3Q99687 SNORD114-26-201ENST00000363543 72 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
MEIS3Q99687 Y_RNA.282-201ENST00000364793 102 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
MEIS3Q99687 MIR892B-201ENST00000401279 77 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
MEIS3Q99687 RNU6ATAC29P-201ENST00000408088 125 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
MEIS3Q99687 RNU6-1133P-201ENST00000410963 100 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
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