Protein–RNA interactions for Protein: Q70EL1

USP54, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 54, humanhuman

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Length 1,684 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP54Q70EL1 MIR548AA1-201ENST00000384971 97 ntBASIC-2.81□□□□□ -2.86
USP54Q70EL1 SNORD58.1-201ENST00000391313 66 ntBASIC-2.81□□□□□ -2.86
USP54Q70EL1 MIR513C-201ENST00000401352 84 ntBASIC-2.81□□□□□ -2.86
USP54Q70EL1 RNU6-1137P-201ENST00000517073 99 ntBASIC-2.81□□□□□ -2.86
USP54Q70EL1 MIR4680-201ENST00000580906 66 ntBASIC-2.81□□□□□ -2.86
USP54Q70EL1 SNORD19B.1-201ENST00000630615 80 ntBASIC-2.81□□□□□ -2.86
USP54Q70EL1 Y_RNA.356-201ENST00000365475 113 ntBASIC-2.82□□□□□ -2.86
USP54Q70EL1 RNU6-639P-201ENST00000384074 107 ntBASIC-2.82□□□□□ -2.86
USP54Q70EL1 RNU6-460P-201ENST00000391158 108 ntBASIC-2.82□□□□□ -2.86
USP54Q70EL1 AC026407.1-201ENST00000518369 204 ntBASIC-2.82□□□□□ -2.86
USP54Q70EL1 U6atac.1-201ENST00000616025 117 ntBASIC-2.82□□□□□ -2.86
USP54Q70EL1 RNU6-972P-201ENST00000391208 107 ntBASIC-2.82□□□□□ -2.86
USP54Q70EL1 RNU6-1089P-201ENST00000516473 104 ntBASIC-2.82□□□□□ -2.86
USP54Q70EL1 RNU6-635P-201ENST00000516651 102 ntBASIC-2.82□□□□□ -2.86
USP54Q70EL1 Y_RNA.325-201ENST00000365171 122 ntBASIC-2.83□□□□□ -2.86
USP54Q70EL1 RNU6-1267P-201ENST00000410747 107 ntBASIC-2.83□□□□□ -2.86
USP54Q70EL1 AL035461.1-201ENST00000421490 332 ntBASIC-2.83□□□□□ -2.86
USP54Q70EL1 MIR4795-201ENST00000584182 89 ntBASIC-2.83□□□□□ -2.86
USP54Q70EL1 Y_RNA.419-201ENST00000384041 102 ntBASIC-2.84□□□□□ -2.86
USP54Q70EL1 RNU6-587P-201ENST00000391282 106 ntBASIC-2.84□□□□□ -2.86
USP54Q70EL1 AL589823.1-201ENST00000429577 183 ntBASIC-2.84□□□□□ -2.86
USP54Q70EL1 ST7-OT3_3.1-201ENST00000611709 115 ntBASIC-2.84□□□□□ -2.86
USP54Q70EL1 AC134503.1-201ENST00000633048 54 ntBASIC-2.84□□□□□ -2.86
USP54Q70EL1 RNU7-197P-201ENST00000458836 62 ntBASIC-2.85□□□□□ -2.87
USP54Q70EL1 RNU6-803P-201ENST00000516034 102 ntBASIC-2.85□□□□□ -2.87
USP54Q70EL1 RNU6-781P-201ENST00000516377 101 ntBASIC-2.85□□□□□ -2.87
USP54Q70EL1 MIR520D-201ENST00000385002 87 ntBASIC-2.85□□□□□ -2.87
USP54Q70EL1 RNU7-174P-201ENST00000516248 59 ntBASIC-2.85□□□□□ -2.87
USP54Q70EL1 MIR4777-201ENST00000583710 86 ntBASIC-2.85□□□□□ -2.87
USP54Q70EL1 Y_RNA.233-201ENST00000364407 101 ntBASIC-2.86□□□□□ -2.87
USP54Q70EL1 RNU6-563P-201ENST00000364872 108 ntBASIC-2.86□□□□□ -2.87
USP54Q70EL1 RNU6-1111P-201ENST00000391118 107 ntBASIC-2.86□□□□□ -2.87
USP54Q70EL1 ST7-OT3_1.1-201ENST00000619607 74 ntBASIC-2.86□□□□□ -2.87
USP54Q70EL1 RNU6-1219P-201ENST00000516143 112 ntBASIC-2.87□□□□□ -2.87
USP54Q70EL1 MIR548W-201ENST00000581970 74 ntBASIC-2.87□□□□□ -2.87
USP54Q70EL1 MIR3170-201ENST00000582699 77 ntBASIC-2.87□□□□□ -2.87
USP54Q70EL1 FTX_4.1-201ENST00000616291 147 ntBASIC-2.87□□□□□ -2.87
USP54Q70EL1 AL158147.1-201ENST00000443970 75 ntBASIC-2.88□□□□□ -2.87
USP54Q70EL1 MIR3675-201ENST00000583661 73 ntBASIC-2.88□□□□□ -2.87
USP54Q70EL1 RNU6-645P-201ENST00000364649 106 ntBASIC-2.88□□□□□ -2.87
USP54Q70EL1 MIR548C-201ENST00000384815 97 ntBASIC-2.88□□□□□ -2.87
USP54Q70EL1 Y_RNA.699-201ENST00000516803 93 ntBASIC-2.88□□□□□ -2.87
USP54Q70EL1 Y_RNA.705-201ENST00000516862 110 ntBASIC-2.88□□□□□ -2.87
USP54Q70EL1 RNU6-698P-201ENST00000363523 107 ntBASIC-2.89□□□□□ -2.87
USP54Q70EL1 RNU6-34P-201ENST00000364874 107 ntBASIC-2.89□□□□□ -2.87
USP54Q70EL1 RNU4-11P-201ENST00000365287 132 ntBASIC-2.89□□□□□ -2.87
USP54Q70EL1 SNORD115-31-201ENST00000365318 82 ntBASIC-2.89□□□□□ -2.87
USP54Q70EL1 RNU4-71P-201ENST00000516258 113 ntBASIC-2.89□□□□□ -2.87
USP54Q70EL1 RNU6-861P-201ENST00000516745 106 ntBASIC-2.89□□□□□ -2.87
USP54Q70EL1 RNU6-1283P-201ENST00000365314 105 ntBASIC-2.9□□□□□ -2.87
USP54Q70EL1 RNU6-887P-201ENST00000410660 100 ntBASIC-2.9□□□□□ -2.87
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USP54Q70EL1 Y_RNA.96-201ENST00000363092 109 ntBASIC-2.91□□□□□ -2.87
USP54Q70EL1 Y_RNA.701-201ENST00000516812 110 ntBASIC-2.91□□□□□ -2.87
USP54Q70EL1 Y_RNA.20-201ENST00000362479 113 ntBASIC-2.92□□□□□ -2.88
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USP54Q70EL1 RNU6-598P-201ENST00000364017 105 ntBASIC-2.92□□□□□ -2.88
USP54Q70EL1 RNU6-1135P-201ENST00000411083 103 ntBASIC-2.92□□□□□ -2.88
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USP54Q70EL1 RNU6-682P-201ENST00000363843 106 ntBASIC-2.92□□□□□ -2.88
USP54Q70EL1 TRAJ33-201ENST00000390504 57 ntAPPRIS P1 BASIC-2.92□□□□□ -2.88
USP54Q70EL1 Y_RNA.109-201ENST00000363215 102 ntBASIC-2.93□□□□□ -2.88
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USP54Q70EL1 Y_RNA.8-201ENST00000362353 102 ntBASIC-2.95□□□□□ -2.88
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USP54Q70EL1 Y_RNA.459-201ENST00000384251 102 ntBASIC-2.95□□□□□ -2.88
USP54Q70EL1 RNU6-1061P-201ENST00000516530 99 ntBASIC-2.95□□□□□ -2.88
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USP54Q70EL1 Y_RNA.784-201ENST00000613803 101 ntBASIC-2.97□□□□□ -2.88
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USP54Q70EL1 Y_RNA.200-201ENST00000364018 102 ntBASIC-2.98□□□□□ -2.89
USP54Q70EL1 SNORD58C-201ENST00000365223 64 ntBASIC-2.98□□□□□ -2.89
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USP54Q70EL1 U4.4-201ENST00000620626 117 ntBASIC-2.98□□□□□ -2.89
USP54Q70EL1 SNORD113-2-201ENST00000391082 72 ntBASIC-2.98□□□□□ -2.89
USP54Q70EL1 MTND5P20-201ENST00000448677 143 ntBASIC-2.98□□□□□ -2.89
USP54Q70EL1 MIR548V-201ENST00000584165 80 ntBASIC-2.98□□□□□ -2.89
USP54Q70EL1 U6.97-201ENST00000636904 101 ntBASIC-2.98□□□□□ -2.89
USP54Q70EL1 Y_RNA.202-201ENST00000364083 110 ntBASIC-2.99□□□□□ -2.89
USP54Q70EL1 SNORA81.3-201ENST00000517283 198 ntBASIC-2.99□□□□□ -2.89
USP54Q70EL1 U7.2-201ENST00000607576 63 ntBASIC-2.99□□□□□ -2.89
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