Protein–RNA interactions for Protein: Q4KMQ1

TPRN, Taperin, humanhuman

Predictions only

Length 711 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPRNQ4KMQ1 MIR371B-201ENST00000638082 66 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
TPRNQ4KMQ1 MIR3657-201ENST00000584818 117 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
TPRNQ4KMQ1 MIR3675-201ENST00000583661 73 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
TPRNQ4KMQ1 U4.2-201ENST00000618561 85 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
TPRNQ4KMQ1 Clostridiales-1.4-201ENST00000636807 150 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
TPRNQ4KMQ1 SNX3P1X-201ENST00000414887 175 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
TPRNQ4KMQ1 MIR4768-201ENST00000585270 74 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
TPRNQ4KMQ1 SYCP2-202ENST00000371001 5479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC0.12□□□□□ -2.39
TPRNQ4KMQ1 Y_RNA.94-201ENST00000363068 106 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
TPRNQ4KMQ1 RNU7-165P-201ENST00000458864 60 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
TPRNQ4KMQ1 RNU6-990P-201ENST00000364385 104 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
TPRNQ4KMQ1 SNORD49B-201ENST00000365172 72 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
TPRNQ4KMQ1 RNU6-1124P-201ENST00000384169 107 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
TPRNQ4KMQ1 Y_RNA.610-201ENST00000410681 103 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
TPRNQ4KMQ1 AC104692.1-201ENST00000472406 90 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
TPRNQ4KMQ1 RNY1P9-201ENST00000532431 109 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
TPRNQ4KMQ1 SNORD95.1-201ENST00000364099 68 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
TPRNQ4KMQ1 MIR582-201ENST00000365731 98 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
TPRNQ4KMQ1 SNORA15B-2-201ENST00000384058 135 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
TPRNQ4KMQ1 SNORA15B-1-201ENST00000384334 135 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
TPRNQ4KMQ1 RNU6-1184P-201ENST00000384588 108 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
TPRNQ4KMQ1 AC021146.9-201ENST00000512503 156 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
TPRNQ4KMQ1 SNORD78.1-201ENST00000390866 65 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
TPRNQ4KMQ1 MIR101-1-201ENST00000362265 75 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
TPRNQ4KMQ1 RNU6-1036P-201ENST00000383959 104 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
TPRNQ4KMQ1 Y_RNA.468-201ENST00000384298 102 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
TPRNQ4KMQ1 Y_RNA.514-201ENST00000384528 112 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
TPRNQ4KMQ1 SNORD114-16-201ENST00000363044 70 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
TPRNQ4KMQ1 SNORA8.1-201ENST00000384250 140 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
TPRNQ4KMQ1 MIR203A-201ENST00000384836 110 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
TPRNQ4KMQ1 MIR224-201ENST00000384889 81 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
TPRNQ4KMQ1 RPS29P8-201ENST00000445109 171 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
TPRNQ4KMQ1 UBL4A-207ENST00000630530 102 ntTSL 5 BASIC0.07□□□□□ -2.4
TPRNQ4KMQ1 Y_RNA.532-201ENST00000384590 113 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
TPRNQ4KMQ1 MIR4290-201ENST00000583807 95 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
TPRNQ4KMQ1 MIR1295B-201ENST00000636144 60 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
TPRNQ4KMQ1 MIR214-201ENST00000385214 110 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
TPRNQ4KMQ1 MIR601-201ENST00000385256 79 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
TPRNQ4KMQ1 RNU4-63P-201ENST00000411313 118 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
TPRNQ4KMQ1 MIR4667-201ENST00000578933 66 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
TPRNQ4KMQ1 SNORD114-28-201ENST00000363610 72 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
TPRNQ4KMQ1 Y_RNA.413-201ENST00000384007 102 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
TPRNQ4KMQ1 Y_RNA.633-201ENST00000459107 95 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
TPRNQ4KMQ1 Y_RNA.754-201ENST00000476024 102 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
TPRNQ4KMQ1 SNORA40.17-201ENST00000517256 115 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
TPRNQ4KMQ1 MIR548AX-201ENST00000580117 73 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
TPRNQ4KMQ1 MIR4645-201ENST00000583158 77 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
TPRNQ4KMQ1 MIR8064-201ENST00000612863 90 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
TPRNQ4KMQ1 Y_RNA.790-201ENST00000614282 102 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
TPRNQ4KMQ1 Y_RNA.782-201ENST00000614695 102 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
TPRNQ4KMQ1 RNU6-228P-201ENST00000362700 106 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
TPRNQ4KMQ1 RNU6-929P-201ENST00000384429 107 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
TPRNQ4KMQ1 MIR1207-201ENST00000408249 87 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
TPRNQ4KMQ1 RNA5SP451-201ENST00000410588 110 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
TPRNQ4KMQ1 MIR4484-201ENST00000582855 83 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
TPRNQ4KMQ1 RNU6-1162P-201ENST00000384443 104 ntBASIC0□□□□□ -2.41
TPRNQ4KMQ1 RNU6-279P-201ENST00000391297 101 ntBASIC0□□□□□ -2.41
TPRNQ4KMQ1 MIR4320-201ENST00000636981 65 ntBASIC0□□□□□ -2.41
TPRNQ4KMQ1 SNORD115-25-201ENST00000362619 82 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
TPRNQ4KMQ1 SNORA49-201ENST00000386157 136 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
TPRNQ4KMQ1 SNORA32.1-201ENST00000364514 115 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
TPRNQ4KMQ1 RNU6-24P-201ENST00000384440 107 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
TPRNQ4KMQ1 TRAJ53-201ENST00000390485 66 ntAPPRIS P1 BASIC-0.02□□□□□ -2.41
TPRNQ4KMQ1 MIR1255A-201ENST00000408338 113 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
TPRNQ4KMQ1 Y_RNA.685-201ENST00000516532 108 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
TPRNQ4KMQ1 MIR6739-201ENST00000622461 75 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
TPRNQ4KMQ1 RNU6-330P-201ENST00000363015 107 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
TPRNQ4KMQ1 RNA5SP147-201ENST00000516493 109 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
TPRNQ4KMQ1 MIR198-201ENST00000637333 62 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
TPRNQ4KMQ1 AC145423.2-201ENST00000610631 239 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
TPRNQ4KMQ1 MIR8053-201ENST00000613344 75 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
TPRNQ4KMQ1 MIR6507-201ENST00000613630 70 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
TPRNQ4KMQ1 MIR521-2-201ENST00000384818 87 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
TPRNQ4KMQ1 TRAJ54-201ENST00000390484 60 ntAPPRIS P1 BASIC-0.06□□□□□ -2.42
TPRNQ4KMQ1 Y_RNA.583-201ENST00000391033 113 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
TPRNQ4KMQ1 MIR3681-201ENST00000580089 72 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
TPRNQ4KMQ1 AC020913.3-201ENST00000594678 125 ntTSL 3 BASIC-0.06□□□□□ -2.42
TPRNQ4KMQ1 RNU6-1216P-201ENST00000362590 107 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
TPRNQ4KMQ1 snoU13.13-201ENST00000458842 104 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
TPRNQ4KMQ1 U7.4-201ENST00000614961 63 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
TPRNQ4KMQ1 RNU6-857P-201ENST00000515893 110 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
TPRNQ4KMQ1 U6.96-201ENST00000636425 70 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
TPRNQ4KMQ1 MIR655-201ENST00000362159 97 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
TPRNQ4KMQ1 SNORD114-3-201ENST00000364969 75 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
TPRNQ4KMQ1 MIR587-201ENST00000384845 96 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
TPRNQ4KMQ1 Y_RNA.684-201ENST00000516510 99 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
TPRNQ4KMQ1 AP000676.1-201ENST00000533307 52 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
TPRNQ4KMQ1 RNU6-502P-201ENST00000362419 108 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
TPRNQ4KMQ1 SNORD75.1-201ENST00000408373 60 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
TPRNQ4KMQ1 SNORD45.1-201ENST00000363181 77 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
TPRNQ4KMQ1 AC244250.2-201ENST00000418731 148 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
TPRNQ4KMQ1 SCARNA18B-201ENST00000458806 135 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
TPRNQ4KMQ1 Y_RNA.55-201ENST00000362797 102 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
TPRNQ4KMQ1 MIR6773-201ENST00000612812 74 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
TPRNQ4KMQ1 SNORA18.1-201ENST00000363418 128 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
TPRNQ4KMQ1 SNORD114-12-201ENST00000365400 75 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
TPRNQ4KMQ1 RNU6-900P-201ENST00000384498 102 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
TPRNQ4KMQ1 SNORA32.3-201ENST00000384772 121 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
TPRNQ4KMQ1 RNU6-337P-201ENST00000391243 106 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
TPRNQ4KMQ1 RNA5SP461-201ENST00000516451 104 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 275.1 ms