Protein–RNA interactions for Protein: Q16676

FOXD1, Forkhead box protein D1, humanhuman

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Length 465 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD1Q16676 RNU6ATAC38P-201ENST00000408119 126 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
FOXD1Q16676 MIR1276-201ENST00000408707 83 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
FOXD1Q16676 AP000676.1-201ENST00000533307 52 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
FOXD1Q16676 AP1B1P2-201ENST00000416196 106 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
FOXD1Q16676 LIFR-201ENST00000263409 10089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
FOXD1Q16676 KCNIP4-IT1-201ENST00000627566 9848 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
FOXD1Q16676 BX248123.2-201ENST00000606318 124 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
FOXD1Q16676 AC084368.1-201ENST00000620935 65 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
FOXD1Q16676 TRAJ11-201ENST00000390526 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.92□□□□□ -1.94
FOXD1Q16676 SACS-201ENST00000382292 15324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.94
FOXD1Q16676 SNORD60-201ENST00000383903 83 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
FOXD1Q16676 UHMK1-204ENST00000545294 8117 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
FOXD1Q16676 SNORA2A-201ENST00000383885 135 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
FOXD1Q16676 MIR4452-201ENST00000583004 71 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
FOXD1Q16676 IL6ST-202ENST00000381286 201 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
FOXD1Q16676 SNORA25-201ENST00000384384 134 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
FOXD1Q16676 RNA5SP61-201ENST00000516453 100 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
FOXD1Q16676 MIR6895-201ENST00000613497 78 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
FOXD1Q16676 FSD1L-201ENST00000374707 7062 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
FOXD1Q16676 MIR17-201ENST00000385012 84 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
FOXD1Q16676 SNORA67.5-201ENST00000391036 107 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
FOXD1Q16676 MIR4677-201ENST00000584153 80 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
FOXD1Q16676 AC069271.1-201ENST00000445577 156 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
FOXD1Q16676 RN7SL660P-201ENST00000614852 299 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
FOXD1Q16676 MIRLET7G-201ENST00000362280 84 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
FOXD1Q16676 RNA5SP190-201ENST00000365222 118 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
FOXD1Q16676 MIR200A-201ENST00000384875 90 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
FOXD1Q16676 SNORD19-201ENST00000391191 68 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
FOXD1Q16676 RNU6-229P-201ENST00000516614 102 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
FOXD1Q16676 AC011195.1-201ENST00000578177 177 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
FOXD1Q16676 Y_RNA.260-201ENST00000364628 101 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
FOXD1Q16676 RNA5SP224-201ENST00000365069 126 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
FOXD1Q16676 RNA5SP338-201ENST00000410495 85 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
FOXD1Q16676 RNU6-1133P-201ENST00000410963 100 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
FOXD1Q16676 SNORA25.15-201ENST00000516487 89 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
FOXD1Q16676 CALCRL-202ENST00000409998 5223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
FOXD1Q16676 Y_RNA.30-201ENST00000362572 97 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
FOXD1Q16676 MIR548N-201ENST00000408742 75 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
FOXD1Q16676 AL391099.1-201ENST00000624635 187 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
FOXD1Q16676 Y_RNA.320-201ENST00000365144 102 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
FOXD1Q16676 TRAJ3-201ENST00000390534 62 ntAPPRIS P1 BASIC2.81□□□□□ -1.96
FOXD1Q16676 MIR9-3-201ENST00000385084 90 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
FOXD1Q16676 RNU6-68P-201ENST00000516576 104 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
FOXD1Q16676 Y_RNA.129-201ENST00000363392 110 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
FOXD1Q16676 RNU6-717P-201ENST00000459076 104 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
FOXD1Q16676 MIR8081-201ENST00000611533 95 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
FOXD1Q16676 Y_RNA.327-201ENST00000365201 102 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
FOXD1Q16676 MIR4448-201ENST00000584360 86 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
FOXD1Q16676 MIR19B1-201ENST00000384829 87 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
FOXD1Q16676 MIR144-201ENST00000384886 86 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
FOXD1Q16676 HMGN2P19-201ENST00000425149 265 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
FOXD1Q16676 MIR5694-201ENST00000581190 76 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
FOXD1Q16676 AP000553.5-201ENST00000641933 54 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
FOXD1Q16676 RNU6-1233P-201ENST00000362922 102 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
FOXD1Q16676 MIR106A-201ENST00000384870 81 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
FOXD1Q16676 Y_RNA.335-201ENST00000365299 96 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
FOXD1Q16676 SNORD13-201ENST00000459299 104 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
FOXD1Q16676 MIR6515-201ENST00000619843 57 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
FOXD1Q16676 MIR1197-201ENST00000408818 88 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
FOXD1Q16676 LINC00345-201ENST00000443679 285 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
FOXD1Q16676 RNA5SP233-201ENST00000459153 113 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
FOXD1Q16676 uc_338.36-201ENST00000622331 158 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
FOXD1Q16676 hsa-mir-3158-1.1-201ENST00000637571 81 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
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FOXD1Q16676 RNU6-973P-201ENST00000364690 107 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
FOXD1Q16676 MIR501-201ENST00000390204 84 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
FOXD1Q16676 SNORD124-201ENST00000459577 104 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
FOXD1Q16676 SMAD5-AS1_3.1-201ENST00000614187 124 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
FOXD1Q16676 MIR876-201ENST00000401147 81 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
FOXD1Q16676 RNU6-1232P-201ENST00000516299 86 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
FOXD1Q16676 MIR4285-201ENST00000581001 85 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
FOXD1Q16676 SNORD45C-201ENST00000383893 79 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
FOXD1Q16676 RNA5SP489-201ENST00000410986 109 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
FOXD1Q16676 RNU7-55P-201ENST00000459426 62 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
FOXD1Q16676 RNU4-54P-201ENST00000516428 129 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
FOXD1Q16676 MIR6755-201ENST00000619993 66 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
FOXD1Q16676 G3BP1-214ENST00000627077 114 ntTSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
FOXD1Q16676 FSIP2-202ENST00000424728 20788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
FOXD1Q16676 RNA5SP327-201ENST00000362494 101 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
FOXD1Q16676 RNA5SP255-201ENST00000516370 107 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
FOXD1Q16676 AC022709.1-201ENST00000615967 87 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
FOXD1Q16676 RNU6-608P-201ENST00000383927 104 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
FOXD1Q16676 Y_RNA.423-201ENST00000384057 113 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
FOXD1Q16676 MIR598-201ENST00000384868 97 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
FOXD1Q16676 MIR518A1-201ENST00000385068 85 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
FOXD1Q16676 RNU7-95P-201ENST00000459222 64 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
FOXD1Q16676 RNA5SP37-201ENST00000365420 130 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
FOXD1Q16676 AC096531.1-201ENST00000419107 107 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
FOXD1Q16676 RNA5SP98-201ENST00000363158 137 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
FOXD1Q16676 RNA5SP517-201ENST00000364724 117 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
FOXD1Q16676 RNU6-848P-201ENST00000515948 107 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
FOXD1Q16676 RNU6-617P-201ENST00000516147 107 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
FOXD1Q16676 RNU6-473P-201ENST00000516164 107 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
FOXD1Q16676 RNU6-1049P-201ENST00000516414 107 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
FOXD1Q16676 RNU6-620P-201ENST00000384017 96 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
FOXD1Q16676 RNA5SP222-201ENST00000411039 105 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
FOXD1Q16676 MIR4303-201ENST00000581299 66 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
FOXD1Q16676 PVT1_3.1-201ENST00000620853 95 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
FOXD1Q16676 SNORA42.1-201ENST00000363515 137 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
FOXD1Q16676 SNORA16.1-201ENST00000364597 132 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
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