Protein–RNA interactions for Protein: Q16558

KCNMB1, Calcium-activated potassium channel subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMB1Q16558 AC098934.3-201ENST00000430450 190 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
KCNMB1Q16558 RNU6-351P-201ENST00000516097 100 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
KCNMB1Q16558 MIR499B-201ENST00000636498 73 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
KCNMB1Q16558 RNU6-598P-201ENST00000364017 105 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
KCNMB1Q16558 SNORD115-23-201ENST00000364461 82 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
KCNMB1Q16558 MIR548F3-201ENST00000408509 87 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
KCNMB1Q16558 AL353803.5-201ENST00000599815 141 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
KCNMB1Q16558 U2.18-201ENST00000622185 84 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
KCNMB1Q16558 C18orf54-201ENST00000300091 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.74□□□□□ -2.29
KCNMB1Q16558 CCDC7-215ENST00000639629 4158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC0.74□□□□□ -2.29
KCNMB1Q16558 SNORD114-2-201ENST00000363953 78 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
KCNMB1Q16558 RNA5SP128-201ENST00000365305 116 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
KCNMB1Q16558 MIR579-201ENST00000385221 98 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
KCNMB1Q16558 RNU6-930P-201ENST00000390938 100 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
KCNMB1Q16558 HOTAIRM1_3.1-201ENST00000619974 59 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
KCNMB1Q16558 Y_RNA.164-201ENST00000363709 102 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
KCNMB1Q16558 RNU6-848P-201ENST00000515948 107 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
KCNMB1Q16558 RNU6-617P-201ENST00000516147 107 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
KCNMB1Q16558 RNU6-473P-201ENST00000516164 107 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
KCNMB1Q16558 RNU6-1049P-201ENST00000516414 107 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
KCNMB1Q16558 Y_RNA.698-201ENST00000516798 118 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
KCNMB1Q16558 AL590095.2-201ENST00000604136 117 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
KCNMB1Q16558 MIR3973-201ENST00000579824 107 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
KCNMB1Q16558 MIR373-201ENST00000362273 69 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
KCNMB1Q16558 SNORD114-27-201ENST00000363766 70 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
KCNMB1Q16558 RNU6-110P-201ENST00000384508 104 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
KCNMB1Q16558 PSMC1P5-201ENST00000512850 177 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
KCNMB1Q16558 RNA5SP102-201ENST00000516865 106 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
KCNMB1Q16558 MIR6767-201ENST00000637302 66 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
KCNMB1Q16558 RNU6-924P-201ENST00000362926 108 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
KCNMB1Q16558 RNU7-129P-201ENST00000516128 62 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
KCNMB1Q16558 RNU6-419P-201ENST00000517030 63 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
KCNMB1Q16558 AP000676.1-201ENST00000533307 52 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
KCNMB1Q16558 MIR4698-201ENST00000577795 80 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
KCNMB1Q16558 TEX15-201ENST00000256246 10110 ntTSL 1 (best) BASIC0.69□□□□□ -2.3
KCNMB1Q16558 ZBTB41-201ENST00000367405 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.69□□□□□ -2.3
KCNMB1Q16558 MIR106A-201ENST00000384870 81 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
KCNMB1Q16558 RNU7-151P-201ENST00000516930 53 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
KCNMB1Q16558 SCARNA11.2-201ENST00000517183 154 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
KCNMB1Q16558 MIR429-201ENST00000362106 83 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
KCNMB1Q16558 SNORD44.1-201ENST00000363202 61 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
KCNMB1Q16558 RNU6ATAC27P-201ENST00000408289 119 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
KCNMB1Q16558 MIR4464-201ENST00000580818 92 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
KCNMB1Q16558 MIR4432-201ENST00000581823 84 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
KCNMB1Q16558 AC008883.1-201ENST00000506562 193 ntTSL 3 BASIC0.66□□□□□ -2.3
KCNMB1Q16558 MIR6866-201ENST00000638146 69 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
KCNMB1Q16558 MIR96-201ENST00000362288 78 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
KCNMB1Q16558 Y_RNA.69-201ENST00000362885 109 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
KCNMB1Q16558 RNU1-93P-201ENST00000364704 169 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
KCNMB1Q16558 RNU6-945P-201ENST00000383947 107 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
KCNMB1Q16558 RNU6ATAC31P-201ENST00000408513 126 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
KCNMB1Q16558 RNU6-863P-201ENST00000515989 104 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
KCNMB1Q16558 RNU6-1262P-201ENST00000516217 96 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
KCNMB1Q16558 AC108676.2-201ENST00000605225 163 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
KCNMB1Q16558 MIR6504-201ENST00000613520 61 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
KCNMB1Q16558 MIR8070-201ENST00000616510 88 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
KCNMB1Q16558 ZNF518A-209ENST00000614149 7911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.65□□□□□ -2.31
KCNMB1Q16558 SYCP2-202ENST00000371001 5479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC0.65□□□□□ -2.31
KCNMB1Q16558 RNU6-838P-201ENST00000363399 108 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
KCNMB1Q16558 MIR6888-201ENST00000621977 67 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
KCNMB1Q16558 MIR103A1-201ENST00000362165 78 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
KCNMB1Q16558 MIR1276-201ENST00000408707 83 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
KCNMB1Q16558 SNORA68.3-201ENST00000515906 83 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
KCNMB1Q16558 RNU6-1206P-201ENST00000516339 103 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
KCNMB1Q16558 Y_RNA.676-201ENST00000516393 96 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
KCNMB1Q16558 RNU7-160P-201ENST00000516660 62 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
KCNMB1Q16558 MIR499A-201ENST00000384903 122 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
KCNMB1Q16558 MIR545-201ENST00000385085 106 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
KCNMB1Q16558 MIR125B1-201ENST00000385236 88 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
KCNMB1Q16558 RNU6-127P-201ENST00000390897 107 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
KCNMB1Q16558 RNU6-1267P-201ENST00000410747 107 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
KCNMB1Q16558 LINC00345-201ENST00000443679 285 ntTSL 5 BASIC0.61□□□□□ -2.31
KCNMB1Q16558 U7.5-201ENST00000517224 61 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
KCNMB1Q16558 MIR4452-201ENST00000583004 71 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
KCNMB1Q16558 uc_338.36-201ENST00000622331 158 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
KCNMB1Q16558 CEP290-203ENST00000547691 5968 ntTSL 1 (best) BASIC0.6□□□□□ -2.31
KCNMB1Q16558 SNORD114-22-201ENST00000365423 72 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
KCNMB1Q16558 RNU7-88P-201ENST00000458752 63 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
KCNMB1Q16558 RNA5SP98-201ENST00000363158 137 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
KCNMB1Q16558 RNU6-696P-201ENST00000390834 107 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
KCNMB1Q16558 AL445584.3-201ENST00000617173 78 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
KCNMB1Q16558 MIR6835-201ENST00000621552 64 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
KCNMB1Q16558 RNU7-55P-201ENST00000459426 62 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
KCNMB1Q16558 snoR1.1-201ENST00000628177 80 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
KCNMB1Q16558 Y_RNA.224-201ENST00000364308 111 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
KCNMB1Q16558 RNU6-815P-201ENST00000384080 113 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
KCNMB1Q16558 MIR520E-201ENST00000384867 87 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
KCNMB1Q16558 MIR548AA1-201ENST00000384971 97 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
KCNMB1Q16558 SNORD57-201ENST00000448188 72 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
KCNMB1Q16558 AC108740.1-201ENST00000498629 225 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
KCNMB1Q16558 AL391099.1-201ENST00000624635 187 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
KCNMB1Q16558 RNU6-974P-201ENST00000384099 108 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
KCNMB1Q16558 MIR548H2-201ENST00000408874 88 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
KCNMB1Q16558 RPS29P1-201ENST00000465274 159 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
KCNMB1Q16558 RNU6-1174P-201ENST00000517278 101 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
KCNMB1Q16558 CYP3A137P-201ENST00000562436 69 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
KCNMB1Q16558 uc_338.17-201ENST00000619633 179 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
KCNMB1Q16558 MIRLET7D-201ENST00000362263 87 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
KCNMB1Q16558 RNU6-247P-201ENST00000362636 107 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
KCNMB1Q16558 MIR329-2-201ENST00000385029 84 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 184.3 ms