Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 976 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 MIR4756-201ENST00000577874 78 ntBASIC-2.55□□□□□ -2.82
SYCP1Q15431 MIR3123-201ENST00000583417 75 ntBASIC-2.55□□□□□ -2.82
SYCP1Q15431 AC141273.2-201ENST00000618989 130 ntBASIC-2.55□□□□□ -2.82
SYCP1Q15431 Y_RNA.47-201ENST00000362697 108 ntBASIC-2.56□□□□□ -2.82
SYCP1Q15431 Y_RNA.74-201ENST00000362911 99 ntBASIC-2.56□□□□□ -2.82
SYCP1Q15431 SNORD58C-201ENST00000365223 64 ntBASIC-2.56□□□□□ -2.82
SYCP1Q15431 Y_RNA.535-201ENST00000384612 99 ntBASIC-2.56□□□□□ -2.82
SYCP1Q15431 MIR3144-201ENST00000579460 79 ntBASIC-2.56□□□□□ -2.82
SYCP1Q15431 MIR4796-201ENST00000580742 81 ntBASIC-2.56□□□□□ -2.82
SYCP1Q15431 MIR3128-201ENST00000581957 66 ntBASIC-2.56□□□□□ -2.82
SYCP1Q15431 Y_RNA.11-201ENST00000362375 109 ntBASIC-2.57□□□□□ -2.82
SYCP1Q15431 RNU6-340P-201ENST00000364005 107 ntBASIC-2.57□□□□□ -2.82
SYCP1Q15431 Y_RNA.236-201ENST00000364427 111 ntBASIC-2.57□□□□□ -2.82
SYCP1Q15431 MT-TM-201ENST00000387377 68 ntBASIC-2.57□□□□□ -2.82
SYCP1Q15431 RNU6-1191P-201ENST00000516799 107 ntBASIC-2.57□□□□□ -2.82
SYCP1Q15431 MIR548AM-201ENST00000584298 74 ntBASIC-2.57□□□□□ -2.82
SYCP1Q15431 Y_RNA.272-201ENST00000364696 102 ntBASIC-2.58□□□□□ -2.82
SYCP1Q15431 SNORD58A-201ENST00000383875 65 ntBASIC-2.58□□□□□ -2.82
SYCP1Q15431 MIR548A3-201ENST00000385297 97 ntBASIC-2.59□□□□□ -2.82
SYCP1Q15431 MTCYBP6-201ENST00000441810 138 ntBASIC-2.59□□□□□ -2.82
SYCP1Q15431 Y_RNA.778-201ENST00000620203 90 ntBASIC-2.59□□□□□ -2.82
SYCP1Q15431 CR2-207ENST00000640301 151 ntTSL 1 (best) BASIC-2.59□□□□□ -2.82
SYCP1Q15431 Y_RNA.240-201ENST00000364469 95 ntBASIC-2.6□□□□□ -2.83
SYCP1Q15431 Y_RNA.449-201ENST00000384187 102 ntBASIC-2.6□□□□□ -2.83
SYCP1Q15431 RNU7-174P-201ENST00000516248 59 ntBASIC-2.6□□□□□ -2.83
SYCP1Q15431 RNU6-1061P-201ENST00000516530 99 ntBASIC-2.6□□□□□ -2.83
SYCP1Q15431 Y_RNA.781-201ENST00000620301 103 ntBASIC-2.6□□□□□ -2.83
SYCP1Q15431 SNORA20.1-201ENST00000364790 130 ntBASIC-2.61□□□□□ -2.83
SYCP1Q15431 Y_RNA.282-201ENST00000364793 102 ntBASIC-2.61□□□□□ -2.83
SYCP1Q15431 AL035461.1-201ENST00000421490 332 ntBASIC-2.61□□□□□ -2.83
SYCP1Q15431 AC120024.2-201ENST00000576526 175 ntBASIC-2.61□□□□□ -2.83
SYCP1Q15431 U7.2-201ENST00000607576 63 ntBASIC-2.61□□□□□ -2.83
SYCP1Q15431 Y_RNA.149-201ENST00000363558 117 ntBASIC-2.62□□□□□ -2.83
SYCP1Q15431 Y_RNA.422-201ENST00000384054 114 ntBASIC-2.62□□□□□ -2.83
SYCP1Q15431 RNU6-1023P-201ENST00000516137 106 ntBASIC-2.62□□□□□ -2.83
SYCP1Q15431 MIR5009-201ENST00000578736 100 ntBASIC-2.62□□□□□ -2.83
SYCP1Q15431 AC012531.4-201ENST00000616509 177 ntBASIC-2.62□□□□□ -2.83
SYCP1Q15431 RNU6-598P-201ENST00000364017 105 ntBASIC-2.63□□□□□ -2.83
SYCP1Q15431 RNU6-587P-201ENST00000391282 106 ntBASIC-2.63□□□□□ -2.83
SYCP1Q15431 AL117187.1-201ENST00000555482 181 ntBASIC-2.63□□□□□ -2.83
SYCP1Q15431 Y_RNA.109-201ENST00000363215 102 ntBASIC-2.64□□□□□ -2.83
SYCP1Q15431 RNU6-681P-201ENST00000364012 104 ntBASIC-2.64□□□□□ -2.83
SYCP1Q15431 RNU6-645P-201ENST00000364649 106 ntBASIC-2.64□□□□□ -2.83
SYCP1Q15431 RNU6-563P-201ENST00000364872 108 ntBASIC-2.64□□□□□ -2.83
SYCP1Q15431 Y_RNA.420-201ENST00000384043 110 ntBASIC-2.64□□□□□ -2.83
SYCP1Q15431 Y_RNA.680-201ENST00000516441 93 ntBASIC-2.64□□□□□ -2.83
SYCP1Q15431 AC044792.1-201ENST00000593294 196 ntBASIC-2.64□□□□□ -2.83
SYCP1Q15431 Y_RNA.29-201ENST00000362570 113 ntBASIC-2.65□□□□□ -2.83
SYCP1Q15431 RNU6-972P-201ENST00000391208 107 ntBASIC-2.65□□□□□ -2.83
SYCP1Q15431 AL450471.1-201ENST00000447509 127 ntBASIC-2.65□□□□□ -2.83
SYCP1Q15431 RNU6-795P-201ENST00000516323 103 ntBASIC-2.65□□□□□ -2.83
SYCP1Q15431 MIR1236-201ENST00000408340 102 ntBASIC-2.66□□□□□ -2.84
SYCP1Q15431 MIR4801-201ENST00000582704 82 ntBASIC-2.66□□□□□ -2.84
SYCP1Q15431 Y_RNA.668-201ENST00000516233 93 ntBASIC-2.67□□□□□ -2.84
SYCP1Q15431 Y_RNA.705-201ENST00000516862 110 ntBASIC-2.67□□□□□ -2.84
SYCP1Q15431 Y_RNA.325-201ENST00000365171 122 ntBASIC-2.68□□□□□ -2.84
SYCP1Q15431 Y_RNA.662-201ENST00000516028 97 ntBASIC-2.68□□□□□ -2.84
SYCP1Q15431 ST7-OT3_1.1-201ENST00000619607 74 ntBASIC-2.68□□□□□ -2.84
SYCP1Q15431 MIR429-201ENST00000362106 83 ntBASIC-2.69□□□□□ -2.84
SYCP1Q15431 Y_RNA.580-201ENST00000391004 95 ntBASIC-2.69□□□□□ -2.84
SYCP1Q15431 RNU6-887P-201ENST00000410660 100 ntBASIC-2.69□□□□□ -2.84
SYCP1Q15431 Y_RNA.61-201ENST00000362835 102 ntBASIC-2.7□□□□□ -2.84
SYCP1Q15431 RNU6-1227P-201ENST00000383981 107 ntBASIC-2.7□□□□□ -2.84
SYCP1Q15431 MIR548X2-201ENST00000579776 100 ntBASIC-2.7□□□□□ -2.84
SYCP1Q15431 MIR3170-201ENST00000582699 77 ntBASIC-2.7□□□□□ -2.84
SYCP1Q15431 Y_RNA.284-201ENST00000364806 102 ntBASIC-2.71□□□□□ -2.84
SYCP1Q15431 RNU6-1034P-201ENST00000365335 101 ntBASIC-2.71□□□□□ -2.84
SYCP1Q15431 RNU4-88P-201ENST00000411220 86 ntBASIC-2.71□□□□□ -2.84
SYCP1Q15431 RNU6-861P-201ENST00000516745 106 ntBASIC-2.71□□□□□ -2.84
SYCP1Q15431 Y_RNA.701-201ENST00000516812 110 ntBASIC-2.71□□□□□ -2.84
SYCP1Q15431 RNU6-537P-201ENST00000517277 103 ntBASIC-2.71□□□□□ -2.84
SYCP1Q15431 AC062037.2-201ENST00000610137 73 ntBASIC-2.71□□□□□ -2.84
SYCP1Q15431 RNU6-1094P-201ENST00000362416 104 ntBASIC-2.72□□□□□ -2.84
SYCP1Q15431 RNU6-1160P-201ENST00000384546 104 ntBASIC-2.72□□□□□ -2.84
SYCP1Q15431 RNU7-153P-201ENST00000516455 62 ntBASIC-2.72□□□□□ -2.84
SYCP1Q15431 SNORD116-10-201ENST00000363791 102 ntBASIC-2.73□□□□□ -2.85
SYCP1Q15431 LINC01984-201ENST00000583863 301 ntTSL 3 BASIC-2.73□□□□□ -2.85
SYCP1Q15431 RNU6-258P-201ENST00000390884 101 ntBASIC-2.74□□□□□ -2.85
SYCP1Q15431 RNU6-1089P-201ENST00000516473 104 ntBASIC-2.74□□□□□ -2.85
SYCP1Q15431 RNU6-1121P-201ENST00000516802 109 ntBASIC-2.74□□□□□ -2.85
SYCP1Q15431 U4.4-201ENST00000620626 117 ntBASIC-2.74□□□□□ -2.85
SYCP1Q15431 U2.18-201ENST00000622185 84 ntBASIC-2.74□□□□□ -2.85
SYCP1Q15431 RNU6-698P-201ENST00000363523 107 ntBASIC-2.75□□□□□ -2.85
SYCP1Q15431 RNU6-34P-201ENST00000364874 107 ntBASIC-2.75□□□□□ -2.85
SYCP1Q15431 SNORD116-18-201ENST00000383961 92 ntBASIC-2.75□□□□□ -2.85
SYCP1Q15431 Y_RNA.564-201ENST00000384708 106 ntBASIC-2.75□□□□□ -2.85
SYCP1Q15431 SNORD77.2-201ENST00000391045 68 ntBASIC-2.75□□□□□ -2.85
SYCP1Q15431 Y_RNA.609-201ENST00000410669 89 ntBASIC-2.75□□□□□ -2.85
SYCP1Q15431 AC008737.2-201ENST00000599446 118 ntBASIC-2.75□□□□□ -2.85
SYCP1Q15431 VTRNA2-1-201ENST00000602301 127 ntBASIC-2.75□□□□□ -2.85
SYCP1Q15431 ST7-OT3_3.1-201ENST00000611709 115 ntBASIC-2.75□□□□□ -2.85
SYCP1Q15431 RNA5SP405-201ENST00000363059 114 ntBASIC-2.76□□□□□ -2.85
SYCP1Q15431 Y_RNA.297-201ENST00000364950 91 ntBASIC-2.76□□□□□ -2.85
SYCP1Q15431 MIR548C-201ENST00000384815 97 ntBASIC-2.76□□□□□ -2.85
SYCP1Q15431 Y_RNA.96-201ENST00000363092 109 ntBASIC-2.77□□□□□ -2.85
SYCP1Q15431 RNU6-682P-201ENST00000363843 106 ntBASIC-2.77□□□□□ -2.85
SYCP1Q15431 Y_RNA.400-201ENST00000383963 111 ntBASIC-2.77□□□□□ -2.85
SYCP1Q15431 Y_RNA.459-201ENST00000384251 102 ntBASIC-2.77□□□□□ -2.85
SYCP1Q15431 RNU6-1111P-201ENST00000391118 107 ntBASIC-2.77□□□□□ -2.85
SYCP1Q15431 Y_RNA.591-201ENST00000410228 104 ntBASIC-2.77□□□□□ -2.85
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