Protein–RNA interactions for Protein: Q14993

COL19A1, Collagen alpha-1(XIX) chain, humanhuman

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Length 1,142 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL19A1Q14993 RNU4-38P-201ENST00000364472 129 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
COL19A1Q14993 RNU6-246P-201ENST00000384702 107 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
COL19A1Q14993 MIR193B-201ENST00000384907 83 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
COL19A1Q14993 RNU6-1246P-201ENST00000391064 107 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
COL19A1Q14993 SNORD114-21-201ENST00000606412 72 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
COL19A1Q14993 MIR7107-201ENST00000611489 80 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
COL19A1Q14993 RNY1P8-201ENST00000383970 114 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
COL19A1Q14993 RNU6-35P-201ENST00000384530 107 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
COL19A1Q14993 MIR140-201ENST00000385282 100 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
COL19A1Q14993 SNORA40B-201ENST00000385573 128 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
COL19A1Q14993 MIR1255B2-201ENST00000408618 67 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
COL19A1Q14993 RNU7-154P-201ENST00000516194 62 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
COL19A1Q14993 RNA5SP470-201ENST00000516463 106 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
COL19A1Q14993 RNA5SP94-201ENST00000516917 108 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
COL19A1Q14993 RNU6-110P-201ENST00000384508 104 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
COL19A1Q14993 MIR519A2-201ENST00000384990 87 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
COL19A1Q14993 Y_RNA.115-201ENST00000363272 98 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
COL19A1Q14993 RPL39P28-201ENST00000465655 155 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
COL19A1Q14993 U7.6-201ENST00000610841 64 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
COL19A1Q14993 SNORD114-29-201ENST00000364819 70 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
COL19A1Q14993 MIR1285-1-201ENST00000408593 84 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
COL19A1Q14993 AL590095.2-201ENST00000604136 117 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
COL19A1Q14993 SNORA70.25-201ENST00000612741 95 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
COL19A1Q14993 TRGJP-201ENST00000390338 61 ntAPPRIS P1 BASIC1.02□□□□□ -2.25
COL19A1Q14993 HMGN2P22-201ENST00000427588 175 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
COL19A1Q14993 AC090617.8-201ENST00000623339 167 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
COL19A1Q14993 AC103810.9-201ENST00000606688 112 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
COL19A1Q14993 RNU6-810P-201ENST00000364001 107 ntBASIC1□□□□□ -2.25
COL19A1Q14993 MIR548F3-201ENST00000408509 87 ntBASIC1□□□□□ -2.25
COL19A1Q14993 TEX15-201ENST00000256246 10110 ntTSL 1 (best) BASIC1□□□□□ -2.25
COL19A1Q14993 SNORD115-25-201ENST00000362619 82 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
COL19A1Q14993 RNU6-838P-201ENST00000363399 108 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
COL19A1Q14993 RNU6-172P-201ENST00000411000 93 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
COL19A1Q14993 MIR6773-201ENST00000612812 74 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
COL19A1Q14993 RNU6-337P-201ENST00000391243 106 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
COL19A1Q14993 SNORD71-201ENST00000411292 86 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
COL19A1Q14993 MIR4714-201ENST00000580728 77 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
COL19A1Q14993 MIR6513-201ENST00000621188 64 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
COL19A1Q14993 SNORD1B-201ENST00000363091 84 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
COL19A1Q14993 RNA5SP476-201ENST00000516613 103 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
COL19A1Q14993 RNU6-419P-201ENST00000517030 63 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
COL19A1Q14993 RNA5SP330-201ENST00000517096 96 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
COL19A1Q14993 RNU6-848P-201ENST00000515948 107 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
COL19A1Q14993 RNU6-617P-201ENST00000516147 107 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
COL19A1Q14993 RNU6-473P-201ENST00000516164 107 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
COL19A1Q14993 RNU6-1049P-201ENST00000516414 107 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
COL19A1Q14993 RNU7-160P-201ENST00000516660 62 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
COL19A1Q14993 MIR4752-201ENST00000579672 72 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
COL19A1Q14993 MIR924-201ENST00000638017 53 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
COL19A1Q14993 Y_RNA.109-201ENST00000363215 102 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
COL19A1Q14993 RNA5SP517-201ENST00000364724 117 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
COL19A1Q14993 SNORA2A-201ENST00000383885 135 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
COL19A1Q14993 RNA5SP121-201ENST00000516537 101 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
COL19A1Q14993 RNU1-29P-201ENST00000606574 126 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
COL19A1Q14993 SNORA25.18-201ENST00000607153 114 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
COL19A1Q14993 HOTAIRM1_3.1-201ENST00000619974 59 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
COL19A1Q14993 C9orf84-203ENST00000374287 4721 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC0.95□□□□□ -2.26
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COL19A1Q14993 RNA5SP257-201ENST00000363023 116 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
COL19A1Q14993 MIR4653-201ENST00000585107 83 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
COL19A1Q14993 RNU6-458P-201ENST00000384179 107 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
COL19A1Q14993 MIRLET7B-201ENST00000385140 83 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
COL19A1Q14993 MIR4490-201ENST00000582647 84 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
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COL19A1Q14993 SNORA40.8-201ENST00000411034 126 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
COL19A1Q14993 AC069271.1-201ENST00000445577 156 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
COL19A1Q14993 RNU7-188P-201ENST00000517063 64 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
COL19A1Q14993 RNU6-502P-201ENST00000362419 108 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
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COL19A1Q14993 MIR4698-201ENST00000577795 80 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
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COL19A1Q14993 SNORD118-201ENST00000363593 134 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
COL19A1Q14993 SNORA49-201ENST00000386157 136 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
COL19A1Q14993 RNU6-175P-201ENST00000516896 107 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
COL19A1Q14993 MIR548AG1-201ENST00000579932 66 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
COL19A1Q14993 ZNF518A-209ENST00000614149 7911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.89□□□□□ -2.27
COL19A1Q14993 MIR146A-201ENST00000385201 99 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
COL19A1Q14993 HAR1A.1-201ENST00000459583 118 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
COL19A1Q14993 RNA5SP62-201ENST00000363457 110 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
COL19A1Q14993 MIR545-201ENST00000385085 106 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
COL19A1Q14993 RNA5SP193-201ENST00000410353 107 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
COL19A1Q14993 RNU6-1206P-201ENST00000516339 103 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
COL19A1Q14993 RNU6-782P-201ENST00000516852 104 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
COL19A1Q14993 RNU6-945P-201ENST00000383947 107 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
COL19A1Q14993 MIR4677-201ENST00000584153 80 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
COL19A1Q14993 AC084368.1-201ENST00000620935 65 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
COL19A1Q14993 MIR4711-201ENST00000578274 70 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
COL19A1Q14993 MIR8087-201ENST00000612745 78 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
COL19A1Q14993 RNU6-1036P-201ENST00000383959 104 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
COL19A1Q14993 AL353803.5-201ENST00000599815 141 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
COL19A1Q14993 Y_RNA.69-201ENST00000362885 109 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
COL19A1Q14993 RNU6-598P-201ENST00000364017 105 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
COL19A1Q14993 Y_RNA.423-201ENST00000384057 113 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
COL19A1Q14993 MIR548AA1-201ENST00000384971 97 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
COL19A1Q14993 RNU6-995P-201ENST00000391244 107 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
COL19A1Q14993 RNU7-151P-201ENST00000516930 53 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
COL19A1Q14993 RNU6-828P-201ENST00000364876 107 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
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