Protein–RNA interactions for Protein: Q13608

PEX6, Peroxisome assembly factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 980 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX6Q13608 SNORD114-4-201ENST00000363962 75 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
PEX6Q13608 SNORA75.1-201ENST00000391130 148 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
PEX6Q13608 MIR4290-201ENST00000583807 95 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
PEX6Q13608 MIR1297-201ENST00000637311 77 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
PEX6Q13608 SNORD113.1-201ENST00000363280 73 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
PEX6Q13608 RNU6-645P-201ENST00000364649 106 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
PEX6Q13608 MIR9-2-201ENST00000384838 87 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
PEX6Q13608 TRAJ53-201ENST00000390485 66 ntAPPRIS P1 BASIC0.04□□□□□ -2.4
PEX6Q13608 RNU6ATAC22P-201ENST00000516794 89 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
PEX6Q13608 RNU6-807P-201ENST00000516805 107 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
PEX6Q13608 CR383656.4-201ENST00000546909 122 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
PEX6Q13608 U7.4-201ENST00000614961 63 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
PEX6Q13608 G3BP1-214ENST00000627077 114 ntTSL 5 BASIC0.04□□□□□ -2.4
PEX6Q13608 RNU6-776P-201ENST00000364403 104 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
PEX6Q13608 RNU6-1022P-201ENST00000365049 104 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
PEX6Q13608 RNU6-540P-201ENST00000384622 101 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
PEX6Q13608 MIR521-2-201ENST00000384818 87 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
PEX6Q13608 RNU6-638P-201ENST00000516582 104 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
PEX6Q13608 AP000676.1-201ENST00000533307 52 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
PEX6Q13608 SNORD115-25-201ENST00000362619 82 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
PEX6Q13608 SNORD114-16-201ENST00000363044 70 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
PEX6Q13608 Y_RNA.565-201ENST00000384719 101 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
PEX6Q13608 MIRLET7B-201ENST00000385140 83 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
PEX6Q13608 MIR610-201ENST00000385139 96 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
PEX6Q13608 RNU6-587P-201ENST00000391282 106 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
PEX6Q13608 CYP3A54P-201ENST00000566950 75 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
PEX6Q13608 MIR4667-201ENST00000578933 66 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
PEX6Q13608 MIR4743-201ENST00000584576 69 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
PEX6Q13608 MIR8068-201ENST00000618032 68 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
PEX6Q13608 U2.7-201ENST00000619197 100 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
PEX6Q13608 RNA5SP257-201ENST00000363023 116 ntBASIC0□□□□□ -2.41
PEX6Q13608 SNORD115-23-201ENST00000364461 82 ntBASIC0□□□□□ -2.41
PEX6Q13608 KIF20B-201ENST00000260753 6306 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC-0□□□□□ -2.41
PEX6Q13608 SNORD56B-201ENST00000384713 71 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
PEX6Q13608 RNU6-1246P-201ENST00000391064 107 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
PEX6Q13608 RNU7-55P-201ENST00000459426 62 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
PEX6Q13608 uc_338.36-201ENST00000622331 158 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
PEX6Q13608 U6.96-201ENST00000636425 70 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
PEX6Q13608 RNA5SP98-201ENST00000363158 137 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
PEX6Q13608 RNU6-411P-201ENST00000384451 107 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
PEX6Q13608 MIR892B-201ENST00000401279 77 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
PEX6Q13608 MIR1255B2-201ENST00000408618 67 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
PEX6Q13608 RNU6-634P-201ENST00000459134 106 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
PEX6Q13608 RNU7-159P-201ENST00000459284 62 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
PEX6Q13608 Y_RNA.681-201ENST00000516445 113 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
PEX6Q13608 MIR4464-201ENST00000580818 92 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
PEX6Q13608 MIR5190-201ENST00000581537 80 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
PEX6Q13608 MIR5704-201ENST00000584029 77 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
PEX6Q13608 MIR148A-201ENST00000362215 68 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
PEX6Q13608 Y_RNA.250-201ENST00000364542 110 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
PEX6Q13608 RNU6-455P-201ENST00000384681 107 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
PEX6Q13608 MIR519A2-201ENST00000384990 87 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
PEX6Q13608 Y_RNA.698-201ENST00000516798 118 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
PEX6Q13608 RNU6-302P-201ENST00000365249 107 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
PEX6Q13608 SNORA15B-2-201ENST00000384058 135 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
PEX6Q13608 SNORA15B-1-201ENST00000384334 135 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
PEX6Q13608 RNU6-380P-201ENST00000410207 107 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
PEX6Q13608 MIR4280-201ENST00000582178 76 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
PEX6Q13608 AL590491.3-201ENST00000610731 82 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
PEX6Q13608 Y_RNA.545-201ENST00000384652 105 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
PEX6Q13608 MIR154-201ENST00000385243 84 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
PEX6Q13608 RNU7-174P-201ENST00000516248 59 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
PEX6Q13608 MIR2909-201ENST00000617113 69 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
PEX6Q13608 U4.4-201ENST00000620626 117 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
PEX6Q13608 RNU6-1162P-201ENST00000384443 104 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
PEX6Q13608 MIR329-2-201ENST00000385029 84 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
PEX6Q13608 AC114755.3-201ENST00000481111 251 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
PEX6Q13608 RNU6-1089P-201ENST00000516473 104 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
PEX6Q13608 RNA5SP285-201ENST00000516619 119 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
PEX6Q13608 Y_RNA.30-201ENST00000362572 97 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
PEX6Q13608 RNU6-900P-201ENST00000384498 102 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
PEX6Q13608 TRAJ54-201ENST00000390484 60 ntAPPRIS P1 BASIC-0.07□□□□□ -2.42
PEX6Q13608 RNU6ATAC29P-201ENST00000408088 125 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
PEX6Q13608 MIR6888-201ENST00000621977 67 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
PEX6Q13608 MIR4662A-201ENST00000637499 67 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
PEX6Q13608 RNU6-1216P-201ENST00000362590 107 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
PEX6Q13608 SNORD49B-201ENST00000365172 72 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
PEX6Q13608 Y_RNA.386-201ENST00000383913 105 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
PEX6Q13608 RNU6ATAC11P-201ENST00000408541 125 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
PEX6Q13608 hsa-mir-3130-1.1-201ENST00000579223 75 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
PEX6Q13608 MIR8053-201ENST00000613344 75 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
PEX6Q13608 Y_RNA.325-201ENST00000365171 122 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
PEX6Q13608 AC096531.1-201ENST00000419107 107 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
PEX6Q13608 AC008883.1-201ENST00000506562 193 ntTSL 3 BASIC-0.09□□□□□ -2.42
PEX6Q13608 RNU6-518P-201ENST00000516056 96 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
PEX6Q13608 AL353803.5-201ENST00000599815 141 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
PEX6Q13608 AL391099.1-201ENST00000624635 187 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
PEX6Q13608 Y_RNA.68-201ENST00000362881 102 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
PEX6Q13608 Y_RNA.185-201ENST00000363894 100 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
PEX6Q13608 RNU6-973P-201ENST00000364690 107 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
PEX6Q13608 RNA5SP169-201ENST00000517268 117 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
PEX6Q13608 MIR1295B-201ENST00000636144 60 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
PEX6Q13608 CCDC7-215ENST00000639629 4158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC-0.1□□□□□ -2.43
PEX6Q13608 SNORD114-11-201ENST00000363738 75 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
PEX6Q13608 Y_RNA.375-201ENST00000365625 101 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
PEX6Q13608 MIR630-201ENST00000384957 97 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
PEX6Q13608 SNORD2-201ENST00000459163 69 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
PEX6Q13608 AC104692.1-201ENST00000472406 90 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
PEX6Q13608 MIR4432-201ENST00000581823 84 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
PEX6Q13608 MIR548V-201ENST00000584165 80 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 345.6 ms