Protein–RNA interactions for Protein: Q13554

CAMK2B, Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type II subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMK2BQ13554 RNU6-1036P-201ENST00000383959 104 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
CAMK2BQ13554 SNORD116-16-201ENST00000384533 92 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
CAMK2BQ13554 PSMC1P5-201ENST00000512850 177 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
CAMK2BQ13554 RNU4-54P-201ENST00000516428 129 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
CAMK2BQ13554 RNU7-154P-201ENST00000516194 62 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
CAMK2BQ13554 RNU6-231P-201ENST00000517122 103 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
CAMK2BQ13554 CPEB3_ribozyme.1-201ENST00000408115 78 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
CAMK2BQ13554 RNU7-129P-201ENST00000516128 62 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
CAMK2BQ13554 SNORD115-25-201ENST00000362619 82 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
CAMK2BQ13554 RNU6-1184P-201ENST00000384588 108 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
CAMK2BQ13554 MIR501-201ENST00000390204 84 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
CAMK2BQ13554 RNU6-863P-201ENST00000515989 104 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
CAMK2BQ13554 RNU6-1232P-201ENST00000516299 86 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
CAMK2BQ13554 SNORD116.2-201ENST00000391251 93 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
CAMK2BQ13554 AC098934.3-201ENST00000430450 190 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
CAMK2BQ13554 MIR5000-201ENST00000577717 103 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
CAMK2BQ13554 MIR548AD-201ENST00000584780 82 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
CAMK2BQ13554 MIR373-201ENST00000362273 69 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
CAMK2BQ13554 Y_RNA.282-201ENST00000364793 102 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
CAMK2BQ13554 RNA5SP128-201ENST00000365305 116 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
CAMK2BQ13554 RNU6-337P-201ENST00000391243 106 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
CAMK2BQ13554 AC087343.1-201ENST00000477341 475 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
CAMK2BQ13554 MIR4295-201ENST00000585286 85 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
CAMK2BQ13554 MIR1285-1-201ENST00000408593 84 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
CAMK2BQ13554 RNU6-175P-201ENST00000516896 107 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
CAMK2BQ13554 MIR7110-201ENST00000612638 86 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
CAMK2BQ13554 MIR6755-201ENST00000619993 66 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
CAMK2BQ13554 FAM135A-203ENST00000370479 5930 ntTSL 1 (best) BASIC1.11□□□□□ -2.23
CAMK2BQ13554 RNU6-246P-201ENST00000384702 107 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
CAMK2BQ13554 RN7SL793P-201ENST00000583259 296 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
CAMK2BQ13554 MIRLET7B-201ENST00000385140 83 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
CAMK2BQ13554 RNU6-782P-201ENST00000516852 104 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
CAMK2BQ13554 SNORA49-201ENST00000386157 136 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CAMK2BQ13554 MIR499B-201ENST00000636498 73 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
CAMK2BQ13554 RNU6-502P-201ENST00000362419 108 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CAMK2BQ13554 AC103810.9-201ENST00000606688 112 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CAMK2BQ13554 HOTAIRM1_3.1-201ENST00000619974 59 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CAMK2BQ13554 snoR1.1-201ENST00000628177 80 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
CAMK2BQ13554 AC008883.1-201ENST00000506562 193 ntTSL 3 BASIC1.03□□□□□ -2.24
CAMK2BQ13554 CYP3A137P-201ENST00000562436 69 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
CAMK2BQ13554 Y_RNA.379-201ENST00000365653 102 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
CAMK2BQ13554 MIR216A-201ENST00000385063 110 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
CAMK2BQ13554 TRAJ22-201ENST00000390515 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.02□□□□□ -2.25
CAMK2BQ13554 AP000676.1-201ENST00000533307 52 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
CAMK2BQ13554 RN7SL660P-201ENST00000614852 299 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
CAMK2BQ13554 Y_RNA.30-201ENST00000362572 97 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
CAMK2BQ13554 SCARNA11.2-201ENST00000517183 154 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
CAMK2BQ13554 MIR3973-201ENST00000579824 107 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
CAMK2BQ13554 RNU6-945P-201ENST00000383947 107 ntBASIC1□□□□□ -2.25
CAMK2BQ13554 MIR876-201ENST00000401147 81 ntBASIC1□□□□□ -2.25
CAMK2BQ13554 MIR3925-201ENST00000584674 77 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
CAMK2BQ13554 RNU6-458P-201ENST00000384179 107 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
CAMK2BQ13554 RNU6-172P-201ENST00000411000 93 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
CAMK2BQ13554 RPL39P28-201ENST00000465655 155 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
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CAMK2BQ13554 MIR6857-201ENST00000613267 93 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
CAMK2BQ13554 Y_RNA.109-201ENST00000363215 102 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
CAMK2BQ13554 MIR532-201ENST00000385025 91 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
CAMK2BQ13554 LINC01984-201ENST00000583863 301 ntTSL 3 BASIC0.97□□□□□ -2.25
CAMK2BQ13554 SPRY4-IT1_2.1-201ENST00000612613 121 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
CAMK2BQ13554 SAMD9-203ENST00000620985 6754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.97□□□□□ -2.25
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CAMK2BQ13554 G3BP1-214ENST00000627077 114 ntTSL 5 BASIC0.96□□□□□ -2.26
CAMK2BQ13554 RNA5SP98-201ENST00000363158 137 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
CAMK2BQ13554 SNORD44.1-201ENST00000363202 61 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
CAMK2BQ13554 RNU4-38P-201ENST00000364472 129 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
CAMK2BQ13554 MIR106A-201ENST00000384870 81 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
CAMK2BQ13554 SNORA40B-201ENST00000385573 128 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
CAMK2BQ13554 MIR4653-201ENST00000585107 83 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
CAMK2BQ13554 SNORD1B-201ENST00000363091 84 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
CAMK2BQ13554 RNA5SP457-201ENST00000363657 124 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
CAMK2BQ13554 RNU6-810P-201ENST00000364001 107 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
CAMK2BQ13554 MIR193B-201ENST00000384907 83 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
CAMK2BQ13554 RNA5SP121-201ENST00000516537 101 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
CAMK2BQ13554 SNORA40.16-201ENST00000517238 121 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
CAMK2BQ13554 AC108740.1-201ENST00000498629 225 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
CAMK2BQ13554 MIR1273G-201ENST00000577677 100 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
CAMK2BQ13554 MIR548AG1-201ENST00000579932 66 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
CAMK2BQ13554 MIR4714-201ENST00000580728 77 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
CAMK2BQ13554 Y_RNA.178-201ENST00000363832 102 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
CAMK2BQ13554 RNU6-753P-201ENST00000363926 107 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
CAMK2BQ13554 uc_338.17-201ENST00000619633 179 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
CAMK2BQ13554 MIR146A-201ENST00000385201 99 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
CAMK2BQ13554 RNU6-1133P-201ENST00000410963 100 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
CAMK2BQ13554 MIR4698-201ENST00000577795 80 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
CAMK2BQ13554 MIR6513-201ENST00000621188 64 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
CAMK2BQ13554 MIR4432-201ENST00000581823 84 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
CAMK2BQ13554 RNU4-88P-201ENST00000411220 86 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
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CAMK2BQ13554 MIR936-201ENST00000401264 98 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
CAMK2BQ13554 RNU6ATAC22P-201ENST00000516794 89 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
CAMK2BQ13554 Y_RNA.115-201ENST00000363272 98 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
CAMK2BQ13554 RNU4-33P-201ENST00000364316 85 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
CAMK2BQ13554 SNORD115-23-201ENST00000364461 82 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
CAMK2BQ13554 TEX15-201ENST00000256246 10110 ntTSL 1 (best) BASIC0.84□□□□□ -2.28
CAMK2BQ13554 SNORA68.3-201ENST00000515906 83 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
CAMK2BQ13554 RNA5SP330-201ENST00000517096 96 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
CAMK2BQ13554 MIR103A1-201ENST00000362165 78 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
CAMK2BQ13554 RNU6-127P-201ENST00000390897 107 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
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