Protein–RNA interactions for Protein: Q13275

SEMA3F, Semaphorin-3F, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3FQ13275 RNU6-808P-201ENST00000391233 108 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
SEMA3FQ13275 AC244090.1-201ENST00000441884 93 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
SEMA3FQ13275 RNU6-518P-201ENST00000516056 96 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
SEMA3FQ13275 SNORA41B-201ENST00000384785 128 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
SEMA3FQ13275 AL021921.1-201ENST00000442774 93 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
SEMA3FQ13275 RNU6-1232P-201ENST00000516299 86 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
SEMA3FQ13275 MIR1273G-201ENST00000577677 100 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
SEMA3FQ13275 MIR6755-201ENST00000619993 66 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
SEMA3FQ13275 Y_RNA.30-201ENST00000362572 97 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
SEMA3FQ13275 MIR1255B2-201ENST00000408618 67 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
SEMA3FQ13275 SYCP2-202ENST00000371001 5479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC0.9□□□□□ -2.26
SEMA3FQ13275 RNU6-945P-201ENST00000383947 107 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
SEMA3FQ13275 RNU6-520P-201ENST00000384717 104 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
SEMA3FQ13275 RNU6-848P-201ENST00000515948 107 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
SEMA3FQ13275 RNU6-617P-201ENST00000516147 107 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
SEMA3FQ13275 RNU6-473P-201ENST00000516164 107 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
SEMA3FQ13275 RNU6-1049P-201ENST00000516414 107 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
SEMA3FQ13275 SNORD114-29-201ENST00000364819 70 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
SEMA3FQ13275 MIR6513-201ENST00000621188 64 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
SEMA3FQ13275 G3BP1-214ENST00000627077 114 ntTSL 5 BASIC0.89□□□□□ -2.27
SEMA3FQ13275 Y_RNA.74-201ENST00000362911 99 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
SEMA3FQ13275 RNU6-1184P-201ENST00000384588 108 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
SEMA3FQ13275 MIR519A2-201ENST00000384990 87 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
SEMA3FQ13275 SNORD2-201ENST00000459163 69 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
SEMA3FQ13275 RNU7-188P-201ENST00000517063 64 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
SEMA3FQ13275 MIR527-201ENST00000385244 85 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
SEMA3FQ13275 MIR760-201ENST00000390220 80 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
SEMA3FQ13275 RNU7-119P-201ENST00000459279 63 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
SEMA3FQ13275 MIR548AD-201ENST00000584780 82 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
SEMA3FQ13275 AC243829.3-201ENST00000622177 108 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
SEMA3FQ13275 AC010487.4-201ENST00000637027 61 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
SEMA3FQ13275 Y_RNA.178-201ENST00000363832 102 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
SEMA3FQ13275 MIR936-201ENST00000401264 98 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
SEMA3FQ13275 RNU6ATAC29P-201ENST00000408088 125 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
SEMA3FQ13275 RNU6ATAC31P-201ENST00000408513 126 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
SEMA3FQ13275 MIR924-201ENST00000638017 53 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
SEMA3FQ13275 ZBTB41-201ENST00000367405 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.84□□□□□ -2.27
SEMA3FQ13275 SNORD44.1-201ENST00000363202 61 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
SEMA3FQ13275 MIR501-201ENST00000390204 84 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
SEMA3FQ13275 RNU6-863P-201ENST00000515989 104 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
SEMA3FQ13275 RNU6-231P-201ENST00000517122 103 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
SEMA3FQ13275 MIR4677-201ENST00000584153 80 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
SEMA3FQ13275 MIR6866-201ENST00000638146 69 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
SEMA3FQ13275 Y_RNA.282-201ENST00000364793 102 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
SEMA3FQ13275 SNORD116-16-201ENST00000384533 92 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
SEMA3FQ13275 RNU6-337P-201ENST00000391243 106 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
SEMA3FQ13275 MIR6773-201ENST00000612812 74 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
SEMA3FQ13275 SNORD114-23-201ENST00000363536 72 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
SEMA3FQ13275 SNORD116.2-201ENST00000391251 93 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
SEMA3FQ13275 AC084368.1-201ENST00000620935 65 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
SEMA3FQ13275 Y_RNA.68-201ENST00000362881 102 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
SEMA3FQ13275 Y_RNA.115-201ENST00000363272 98 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
SEMA3FQ13275 RNA5SP128-201ENST00000365305 116 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
SEMA3FQ13275 SNORA49-201ENST00000386157 136 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
SEMA3FQ13275 MIR6835-201ENST00000621552 64 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
SEMA3FQ13275 TEX15-201ENST00000256246 10110 ntTSL 1 (best) BASIC0.81□□□□□ -2.28
SEMA3FQ13275 CALCRL-202ENST00000409998 5223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.8□□□□□ -2.28
SEMA3FQ13275 SNORD115-25-201ENST00000362619 82 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
SEMA3FQ13275 RNU6-1036P-201ENST00000383959 104 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
SEMA3FQ13275 MIR508-201ENST00000384857 115 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
SEMA3FQ13275 RNU6-175P-201ENST00000516896 107 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
SEMA3FQ13275 Y_RNA.433-201ENST00000384089 102 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
SEMA3FQ13275 SNORA68.3-201ENST00000515906 83 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
SEMA3FQ13275 RNA5SP121-201ENST00000516537 101 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
SEMA3FQ13275 RNA5SP330-201ENST00000517096 96 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
SEMA3FQ13275 MIR548AG1-201ENST00000579932 66 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
SEMA3FQ13275 MIR7110-201ENST00000612638 86 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
SEMA3FQ13275 MIR499B-201ENST00000636498 73 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
SEMA3FQ13275 LINC00345-201ENST00000443679 285 ntTSL 5 BASIC0.77□□□□□ -2.29
SEMA3FQ13275 RNU7-129P-201ENST00000516128 62 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
SEMA3FQ13275 RNU7-154P-201ENST00000516194 62 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
SEMA3FQ13275 RNA5SP470-201ENST00000516463 106 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
SEMA3FQ13275 MIRLET7B-201ENST00000385140 83 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
SEMA3FQ13275 RNA5SP193-201ENST00000410353 107 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
SEMA3FQ13275 RNU6-782P-201ENST00000516852 104 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
SEMA3FQ13275 MIR103A1-201ENST00000362165 78 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
SEMA3FQ13275 MIR330-201ENST00000362196 94 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
SEMA3FQ13275 RNU6-246P-201ENST00000384702 107 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
SEMA3FQ13275 MIR4711-201ENST00000578274 70 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
SEMA3FQ13275 RN7SL660P-201ENST00000614852 299 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
SEMA3FQ13275 RNU6-502P-201ENST00000362419 108 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
SEMA3FQ13275 RNA5SP499-201ENST00000363982 119 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
SEMA3FQ13275 Y_RNA.379-201ENST00000365653 102 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
SEMA3FQ13275 LINC01984-201ENST00000583863 301 ntTSL 3 BASIC0.74□□□□□ -2.29
SEMA3FQ13275 RNA5SP257-201ENST00000363023 116 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
SEMA3FQ13275 Y_RNA.109-201ENST00000363215 102 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
SEMA3FQ13275 RNU4-88P-201ENST00000411220 86 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
SEMA3FQ13275 MIR8087-201ENST00000612745 78 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
SEMA3FQ13275 SAMD9-203ENST00000620985 6754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.72□□□□□ -2.29
SEMA3FQ13275 MIR429-201ENST00000362106 83 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
SEMA3FQ13275 MIRLET7D-201ENST00000362263 87 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
SEMA3FQ13275 RNU6-753P-201ENST00000363926 107 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
SEMA3FQ13275 SNORA40.16-201ENST00000517238 121 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
SEMA3FQ13275 AP000676.1-201ENST00000533307 52 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
SEMA3FQ13275 MIR3925-201ENST00000584674 77 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
SEMA3FQ13275 SNORD1B-201ENST00000363091 84 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
SEMA3FQ13275 RNU6-172P-201ENST00000411000 93 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
SEMA3FQ13275 RNA5SP347-201ENST00000362445 119 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
SEMA3FQ13275 RNU6-810P-201ENST00000364001 107 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
SEMA3FQ13275 RNU6-458P-201ENST00000384179 107 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
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