Protein–RNA interactions for Protein: Q13029

PRDM2, PR domain zinc finger protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM2Q13029 MIR1302-6-201ENST00000408466 90 ntBASIC-3.08□□□□□ -2.9
PRDM2Q13029 AC130289.1-201ENST00000577321 73 ntBASIC-3.08□□□□□ -2.9
PRDM2Q13029 MIR4694-201ENST00000578534 80 ntBASIC-3.08□□□□□ -2.9
PRDM2Q13029 Y_RNA.237-201ENST00000364439 102 ntBASIC-3.09□□□□□ -2.9
PRDM2Q13029 Y_RNA.279-201ENST00000364763 95 ntBASIC-3.09□□□□□ -2.9
PRDM2Q13029 RNU6-813P-201ENST00000384691 107 ntBASIC-3.09□□□□□ -2.9
PRDM2Q13029 MIR3613-201ENST00000579844 87 ntBASIC-3.09□□□□□ -2.9
PRDM2Q13029 AC090616.3-202ENST00000583346 205 ntTSL 2 BASIC-3.09□□□□□ -2.9
PRDM2Q13029 DNAJC19P2-201ENST00000593340 302 ntBASIC-3.09□□□□□ -2.9
PRDM2Q13029 Y_RNA.29-201ENST00000362570 113 ntBASIC-3.1□□□□□ -2.91
PRDM2Q13029 RNU6-277P-201ENST00000516272 106 ntBASIC-3.1□□□□□ -2.91
PRDM2Q13029 RNU6-340P-201ENST00000364005 107 ntBASIC-3.11□□□□□ -2.91
PRDM2Q13029 RNU6-450P-201ENST00000364654 107 ntBASIC-3.11□□□□□ -2.91
PRDM2Q13029 Y_RNA.276-201ENST00000364732 109 ntBASIC-3.11□□□□□ -2.91
PRDM2Q13029 SNORD113-3-201ENST00000364830 72 ntBASIC-3.11□□□□□ -2.91
PRDM2Q13029 RNU6-1318P-201ENST00000365389 103 ntBASIC-3.11□□□□□ -2.91
PRDM2Q13029 AC103810.7-201ENST00000607821 91 ntBASIC-3.11□□□□□ -2.91
PRDM2Q13029 Y_RNA.629-201ENST00000411368 105 ntBASIC-3.12□□□□□ -2.91
PRDM2Q13029 U2.18-201ENST00000622185 84 ntBASIC-3.12□□□□□ -2.91
PRDM2Q13029 RNU6-698P-201ENST00000363523 107 ntBASIC-3.13□□□□□ -2.91
PRDM2Q13029 RNU6-598P-201ENST00000364017 105 ntBASIC-3.13□□□□□ -2.91
PRDM2Q13029 RNU6-34P-201ENST00000364874 107 ntBASIC-3.13□□□□□ -2.91
PRDM2Q13029 SNORD60-201ENST00000383903 83 ntBASIC-3.13□□□□□ -2.91
PRDM2Q13029 Y_RNA.467-201ENST00000384297 102 ntBASIC-3.13□□□□□ -2.91
PRDM2Q13029 RNU6-1153P-201ENST00000516760 105 ntBASIC-3.13□□□□□ -2.91
PRDM2Q13029 SNORD58A-201ENST00000383875 65 ntBASIC-3.13□□□□□ -2.91
PRDM2Q13029 Y_RNA.210-201ENST00000364161 110 ntBASIC-3.14□□□□□ -2.91
PRDM2Q13029 AL450471.1-201ENST00000447509 127 ntBASIC-3.14□□□□□ -2.91
PRDM2Q13029 U2.14-201ENST00000615943 113 ntBASIC-3.14□□□□□ -2.91
PRDM2Q13029 Y_RNA.632-201ENST00000459189 102 ntBASIC-3.15□□□□□ -2.91
PRDM2Q13029 MIR4796-201ENST00000580742 81 ntBASIC-3.15□□□□□ -2.91
PRDM2Q13029 MIR1236-201ENST00000408340 102 ntBASIC-3.16□□□□□ -2.91
PRDM2Q13029 MIR369-201ENST00000362155 70 ntBASIC-3.16□□□□□ -2.92
PRDM2Q13029 RNY3P2-201ENST00000362918 102 ntBASIC-3.16□□□□□ -2.92
PRDM2Q13029 Y_RNA.95-201ENST00000363079 95 ntBASIC-3.16□□□□□ -2.92
PRDM2Q13029 Y_RNA.109-201ENST00000363215 102 ntBASIC-3.16□□□□□ -2.92
PRDM2Q13029 ZEB1-AS1-204ENST00000450834 576 ntTSL 3 BASIC-3.16□□□□□ -2.92
PRDM2Q13029 U4.4-201ENST00000620626 117 ntBASIC-3.16□□□□□ -2.92
PRDM2Q13029 Y_RNA.516-201ENST00000384541 124 ntBASIC-3.17□□□□□ -2.92
PRDM2Q13029 MT-TL1-201ENST00000386347 75 ntBASIC-3.17□□□□□ -2.92
PRDM2Q13029 RNU6-718P-201ENST00000516166 105 ntBASIC-3.17□□□□□ -2.92
PRDM2Q13029 MIR3675-201ENST00000583661 73 ntBASIC-3.17□□□□□ -2.92
PRDM2Q13029 RNU6-645P-201ENST00000364649 106 ntBASIC-3.18□□□□□ -2.92
PRDM2Q13029 SNORD37.2-201ENST00000391075 66 ntBASIC-3.18□□□□□ -2.92
PRDM2Q13029 AC093831.1-201ENST00000509166 434 ntTSL 3 BASIC-3.18□□□□□ -2.92
PRDM2Q13029 Y_RNA.688-201ENST00000516565 95 ntBASIC-3.18□□□□□ -2.92
PRDM2Q13029 RNU6-1215P-201ENST00000384441 102 ntBASIC-3.19□□□□□ -2.92
PRDM2Q13029 MIR548C-201ENST00000384815 97 ntBASIC-3.19□□□□□ -2.92
PRDM2Q13029 RNU6-239P-201ENST00000390990 99 ntBASIC-3.19□□□□□ -2.92
PRDM2Q13029 SNORD127-201ENST00000458892 86 ntBASIC-3.19□□□□□ -2.92
PRDM2Q13029 RNU7-151P-201ENST00000516930 53 ntBASIC-3.19□□□□□ -2.92
PRDM2Q13029 SNORD113-2-201ENST00000391082 72 ntBASIC-3.2□□□□□ -2.92
PRDM2Q13029 RNY4P18-201ENST00000391107 89 ntBASIC-3.21□□□□□ -2.92
PRDM2Q13029 Y_RNA.277-201ENST00000364754 102 ntBASIC-3.22□□□□□ -2.92
PRDM2Q13029 MIR548V-201ENST00000584165 80 ntBASIC-3.22□□□□□ -2.92
PRDM2Q13029 RNU6-1128P-201ENST00000362825 109 ntBASIC-3.22□□□□□ -2.93
PRDM2Q13029 Y_RNA.563-201ENST00000384707 108 ntBASIC-3.22□□□□□ -2.93
PRDM2Q13029 RNU7-121P-201ENST00000516604 62 ntBASIC-3.22□□□□□ -2.93
PRDM2Q13029 RNA5SP215-201ENST00000363440 122 ntBASIC-3.23□□□□□ -2.93
PRDM2Q13029 RNU6-669P-201ENST00000365575 107 ntBASIC-3.23□□□□□ -2.93
PRDM2Q13029 MIR630-201ENST00000384957 97 ntBASIC-3.24□□□□□ -2.93
PRDM2Q13029 AC025166.1-201ENST00000612411 163 ntBASIC-3.24□□□□□ -2.93
PRDM2Q13029 RNU6-639P-201ENST00000384074 107 ntBASIC-3.24□□□□□ -2.93
PRDM2Q13029 RNU6-1324P-201ENST00000384222 107 ntBASIC-3.24□□□□□ -2.93
PRDM2Q13029 RNU6-1081P-201ENST00000384537 107 ntBASIC-3.24□□□□□ -2.93
PRDM2Q13029 RNU6-972P-201ENST00000391208 107 ntBASIC-3.24□□□□□ -2.93
PRDM2Q13029 MIR4679-2-201ENST00000578358 77 ntBASIC-3.24□□□□□ -2.93
PRDM2Q13029 MIR548F1-201ENST00000408667 84 ntBASIC-3.25□□□□□ -2.93
PRDM2Q13029 SNORD19B-201ENST00000459623 84 ntBASIC-3.25□□□□□ -2.93
PRDM2Q13029 Y_RNA.160-201ENST00000363677 92 ntBASIC-3.26□□□□□ -2.93
PRDM2Q13029 RNY1P1-201ENST00000364372 112 ntBASIC-3.26□□□□□ -2.93
PRDM2Q13029 Y_RNA.455-201ENST00000384230 98 ntBASIC-3.27□□□□□ -2.93
PRDM2Q13029 RNU6-800P-201ENST00000384473 103 ntBASIC-3.27□□□□□ -2.93
PRDM2Q13029 RNU6-995P-201ENST00000391244 107 ntBASIC-3.27□□□□□ -2.93
PRDM2Q13029 AC113195.1-201ENST00000579952 141 ntBASIC-3.27□□□□□ -2.93
PRDM2Q13029 ST7-OT3_3.1-201ENST00000611709 115 ntBASIC-3.27□□□□□ -2.93
PRDM2Q13029 RNU6-834P-201ENST00000362367 110 ntBASIC-3.27□□□□□ -2.93
PRDM2Q13029 MTND2P23-201ENST00000422990 651 ntBASIC-3.27□□□□□ -2.93
PRDM2Q13029 MIR4777-201ENST00000583710 86 ntBASIC-3.27□□□□□ -2.93
PRDM2Q13029 ZEB2_AS1_4.1-201ENST00000615159 78 ntBASIC-3.27□□□□□ -2.93
PRDM2Q13029 SNORD116-16-201ENST00000384533 92 ntBASIC-3.28□□□□□ -2.93
PRDM2Q13029 Y_RNA.626-201ENST00000411288 95 ntBASIC-3.28□□□□□ -2.93
PRDM2Q13029 MIR3658-201ENST00000636291 56 ntBASIC-3.28□□□□□ -2.93
PRDM2Q13029 MIR1302-1-201ENST00000637932 143 ntBASIC-3.28□□□□□ -2.93
PRDM2Q13029 Y_RNA.264-201ENST00000364665 102 ntBASIC-3.29□□□□□ -2.94
PRDM2Q13029 Y_RNA.435-201ENST00000384095 112 ntBASIC-3.29□□□□□ -2.94
PRDM2Q13029 Y_RNA.579-201ENST00000390939 94 ntBASIC-3.29□□□□□ -2.94
PRDM2Q13029 RNU6-1227P-201ENST00000383981 107 ntBASIC-3.3□□□□□ -2.94
PRDM2Q13029 MIR379-201ENST00000362218 67 ntBASIC-3.3□□□□□ -2.94
PRDM2Q13029 Y_RNA.395-201ENST00000383945 109 ntBASIC-3.3□□□□□ -2.94
PRDM2Q13029 RNU6-887P-201ENST00000410660 100 ntBASIC-3.3□□□□□ -2.94
PRDM2Q13029 AL158828.1-201ENST00000438582 197 ntTSL 5 BASIC-3.3□□□□□ -2.94
PRDM2Q13029 Y_RNA.58-201ENST00000362807 102 ntBASIC-3.31□□□□□ -2.94
PRDM2Q13029 RNU6-918P-201ENST00000391219 106 ntBASIC-3.31□□□□□ -2.94
PRDM2Q13029 Y_RNA.705-201ENST00000516862 110 ntBASIC-3.31□□□□□ -2.94
PRDM2Q13029 RNU6-988P-201ENST00000519081 107 ntBASIC-3.31□□□□□ -2.94
PRDM2Q13029 AL359920.1-201ENST00000618332 176 ntBASIC-3.31□□□□□ -2.94
PRDM2Q13029 Y_RNA.318-201ENST00000365131 97 ntBASIC-3.32□□□□□ -2.94
PRDM2Q13029 Y_RNA.321-201ENST00000365149 102 ntBASIC-3.32□□□□□ -2.94
PRDM2Q13029 SNORD77.2-201ENST00000391045 68 ntBASIC-3.32□□□□□ -2.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 275 ms