Protein–RNA interactions for Protein: Q12857

NFIA, Nuclear factor 1 A-type, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIAQ12857 SNORA49-201ENST00000386157 136 ntBASIC1□□□□□ -2.25
NFIAQ12857 RPL39P28-201ENST00000465655 155 ntBASIC1□□□□□ -2.25
NFIAQ12857 MIR4714-201ENST00000580728 77 ntBASIC1□□□□□ -2.25
NFIAQ12857 SNORA25.18-201ENST00000607153 114 ntBASIC1□□□□□ -2.25
NFIAQ12857 RNU6-35P-201ENST00000384530 107 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
NFIAQ12857 ACA64.5-201ENST00000516207 127 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
NFIAQ12857 MIR6773-201ENST00000612812 74 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
NFIAQ12857 C18orf54-201ENST00000300091 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.99□□□□□ -2.25
NFIAQ12857 RNU4-33P-201ENST00000364316 85 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
NFIAQ12857 SNORD114-29-201ENST00000364819 70 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
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NFIAQ12857 RNU7-188P-201ENST00000517063 64 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
NFIAQ12857 SNORD115-25-201ENST00000362619 82 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
NFIAQ12857 TRGJP-201ENST00000390338 61 ntAPPRIS P1 BASIC0.97□□□□□ -2.25
NFIAQ12857 SNORD2-201ENST00000459163 69 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
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NFIAQ12857 RNU6-810P-201ENST00000364001 107 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
NFIAQ12857 RNU6-246P-201ENST00000384702 107 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
NFIAQ12857 MIR140-201ENST00000385282 100 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
NFIAQ12857 SNORA40B-201ENST00000385573 128 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
NFIAQ12857 RNU7-154P-201ENST00000516194 62 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
NFIAQ12857 RNU6-1232P-201ENST00000516299 86 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
NFIAQ12857 Y_RNA.30-201ENST00000362572 97 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
NFIAQ12857 Y_RNA.109-201ENST00000363215 102 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
NFIAQ12857 RNU6-172P-201ENST00000411000 93 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
NFIAQ12857 RNU6-229P-201ENST00000516614 102 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
NFIAQ12857 RNU6-175P-201ENST00000516896 107 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
NFIAQ12857 DLEU2_4.2-201ENST00000616613 58 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
NFIAQ12857 G3BP1-214ENST00000627077 114 ntTSL 5 BASIC0.95□□□□□ -2.26
NFIAQ12857 C9orf84-203ENST00000374287 4721 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC0.95□□□□□ -2.26
NFIAQ12857 SNORD118-201ENST00000363593 134 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
NFIAQ12857 SNORA2A-201ENST00000383885 135 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
NFIAQ12857 Y_RNA.423-201ENST00000384057 113 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
NFIAQ12857 MIRLET7B-201ENST00000385140 83 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
NFIAQ12857 MIR548X-201ENST00000580069 75 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
NFIAQ12857 U7.6-201ENST00000610841 64 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
NFIAQ12857 RNU6-351P-201ENST00000516097 100 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
NFIAQ12857 MIR4677-201ENST00000584153 80 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
NFIAQ12857 SNORD114-2-201ENST00000363953 78 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
NFIAQ12857 MIR501-201ENST00000390204 84 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
NFIAQ12857 SNORA40.8-201ENST00000411034 126 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
NFIAQ12857 RNU4-54P-201ENST00000516428 129 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
NFIAQ12857 RNA5SP470-201ENST00000516463 106 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
NFIAQ12857 RNU6-782P-201ENST00000516852 104 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
NFIAQ12857 SYCP2-202ENST00000371001 5479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC0.91□□□□□ -2.26
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NFIAQ12857 HOTAIRM1_3.1-201ENST00000619974 59 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
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NFIAQ12857 MIR548F3-201ENST00000408509 87 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
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NFIAQ12857 MIR760-201ENST00000390220 80 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
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NFIAQ12857 PSMC1P5-201ENST00000512850 177 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
NFIAQ12857 AL353803.5-201ENST00000599815 141 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
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NFIAQ12857 RNU6-1049P-201ENST00000516414 107 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
NFIAQ12857 RNU6-419P-201ENST00000517030 63 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
NFIAQ12857 MIR3925-201ENST00000584674 77 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
NFIAQ12857 U2.18-201ENST00000622185 84 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
NFIAQ12857 AC098934.3-201ENST00000430450 190 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
NFIAQ12857 Y_RNA.115-201ENST00000363272 98 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
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NFIAQ12857 SNORD115-23-201ENST00000364461 82 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
NFIAQ12857 RNA5SP128-201ENST00000365305 116 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
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NFIAQ12857 RNU7-151P-201ENST00000516930 53 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
NFIAQ12857 AP000676.1-201ENST00000533307 52 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
NFIAQ12857 TEX15-201ENST00000256246 10110 ntTSL 1 (best) BASIC0.79□□□□□ -2.28
NFIAQ12857 Y_RNA.68-201ENST00000362881 102 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
NFIAQ12857 RNU6-924P-201ENST00000362926 108 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
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NFIAQ12857 SNORD114-23-201ENST00000363536 72 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
NFIAQ12857 RNA5SP499-201ENST00000363982 119 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
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