Protein–RNA interactions for Protein: P28289

TMOD1, Tropomodulin-1, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD1P28289 RNU6-184P-201ENST00000516514 107 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
TMOD1P28289 U7.3-201ENST00000616123 62 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
TMOD1P28289 Y_RNA.93-201ENST00000363066 109 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
TMOD1P28289 RNU6-1113P-201ENST00000384348 107 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
TMOD1P28289 RNU6-24P-201ENST00000384440 107 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
TMOD1P28289 Y_RNA.818-201ENST00000618813 71 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
TMOD1P28289 SNORA19-201ENST00000384737 128 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
TMOD1P28289 MIR29B1-201ENST00000385015 81 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
TMOD1P28289 MIR1255B2-201ENST00000408618 67 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
TMOD1P28289 RNU6-1064P-201ENST00000410626 104 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
TMOD1P28289 SNX3P1X-201ENST00000414887 175 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
TMOD1P28289 SNORD63.1-201ENST00000516178 80 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
TMOD1P28289 RNU6-479P-201ENST00000516348 105 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
TMOD1P28289 MIR3668-201ENST00000582138 75 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
TMOD1P28289 ULK3-223ENST00000631115 126 ntTSL 5 BASIC-1.23□□□□□ -2.61
TMOD1P28289 Y_RNA.190-201ENST00000363964 101 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
TMOD1P28289 Y_RNA.365-201ENST00000365537 102 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
TMOD1P28289 RNU7-134P-201ENST00000458997 64 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
TMOD1P28289 SNORD115-33-201ENST00000363723 82 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
TMOD1P28289 SNORA26.4-201ENST00000391188 123 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
TMOD1P28289 RNU7-153P-201ENST00000516455 62 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
TMOD1P28289 CYP3A54P-201ENST00000566950 75 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
TMOD1P28289 AL365222.1-201ENST00000614661 98 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
TMOD1P28289 MIR6129-201ENST00000616087 109 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
TMOD1P28289 AC132825.6-201ENST00000638861 357 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
TMOD1P28289 RNU6-924P-201ENST00000362926 108 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
TMOD1P28289 Y_RNA.606-201ENST00000410579 103 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
TMOD1P28289 MIR6818-201ENST00000621576 65 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
TMOD1P28289 MIR3115-201ENST00000577915 68 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
TMOD1P28289 RNA5SP192-201ENST00000364404 120 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
TMOD1P28289 SNORD115-22-201ENST00000364456 82 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
TMOD1P28289 AL450471.1-201ENST00000447509 127 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
TMOD1P28289 HOTAIRM1_3.1-201ENST00000619974 59 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
TMOD1P28289 SNORD115-27-201ENST00000364430 82 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
TMOD1P28289 RNU6-81P-201ENST00000365608 104 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
TMOD1P28289 MIR521-2-201ENST00000384818 87 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
TMOD1P28289 AL031386.1-201ENST00000411940 142 ntTSL 5 BASIC-1.29□□□□□ -2.62
TMOD1P28289 RNU6-752P-201ENST00000516376 102 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
TMOD1P28289 RNU6-766P-201ENST00000362478 107 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
TMOD1P28289 RNU6-589P-201ENST00000516485 107 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
TMOD1P28289 FAS-AS1.1-201ENST00000615327 126 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
TMOD1P28289 MIR1468-201ENST00000410600 86 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
TMOD1P28289 RNU7-154P-201ENST00000516194 62 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
TMOD1P28289 RNA5SP26-201ENST00000362406 119 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
TMOD1P28289 RNU2-51P-201ENST00000410708 197 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
TMOD1P28289 Y_RNA.613-201ENST00000410726 97 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
TMOD1P28289 MIR6739-201ENST00000622461 75 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
TMOD1P28289 RNU6-340P-201ENST00000364005 107 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
TMOD1P28289 Y_RNA.290-201ENST00000364879 114 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
TMOD1P28289 RNU6-1056P-201ENST00000383996 107 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
TMOD1P28289 MIR519A2-201ENST00000384990 87 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
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TMOD1P28289 TRAJ37-201ENST00000612375 65 ntAPPRIS P1 BASIC-1.33□□□□□ -2.62
TMOD1P28289 LEKR1-212ENST00000640869 237 ntTSL 5 BASIC-1.33□□□□□ -2.62
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TMOD1P28289 Y_RNA.544-201ENST00000384650 113 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
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TMOD1P28289 MIR8485-201ENST00000401372 91 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
TMOD1P28289 RNU6-158P-201ENST00000517104 100 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
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TMOD1P28289 MIR3165-201ENST00000579874 75 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
TMOD1P28289 AC138207.3-201ENST00000585289 166 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
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TMOD1P28289 RNU6-576P-201ENST00000390854 102 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
TMOD1P28289 MTATP8P2-201ENST00000435212 202 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
TMOD1P28289 TMSB4XP3-201ENST00000445144 114 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
TMOD1P28289 RNU6-681P-201ENST00000364012 104 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
TMOD1P28289 TRAJ61-201ENST00000390479 60 ntAPPRIS P1 BASIC-1.36□□□□□ -2.63
TMOD1P28289 SNORD77.2-201ENST00000391045 68 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
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TMOD1P28289 RNU6-1168P-201ENST00000390831 104 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
TMOD1P28289 AL353691.2-201ENST00000443795 59 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
TMOD1P28289 AP002795.1-201ENST00000534879 84 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
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TMOD1P28289 AL035461.1-201ENST00000421490 332 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
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TMOD1P28289 Y_RNA.709-201ENST00000516952 92 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
TMOD1P28289 RNU6-1238P-201ENST00000517215 102 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
TMOD1P28289 AC091912.2-201ENST00000624798 167 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
TMOD1P28289 MIR2052-201ENST00000636055 55 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
TMOD1P28289 RNU6-633P-201ENST00000362612 103 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.64
TMOD1P28289 RNU6-164P-201ENST00000364604 103 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.64
TMOD1P28289 MIR507-201ENST00000385234 94 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.64
TMOD1P28289 RNU6-1108P-201ENST00000516308 104 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.64
TMOD1P28289 MIR4668-201ENST00000582284 70 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.64
TMOD1P28289 SNORD115-37-201ENST00000363768 82 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
TMOD1P28289 RNU6-1117P-201ENST00000384525 104 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
TMOD1P28289 RNU6-246P-201ENST00000384702 107 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
TMOD1P28289 MIR548M-201ENST00000408260 86 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
TMOD1P28289 AL021921.1-201ENST00000442774 93 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
TMOD1P28289 MIR6502-201ENST00000617296 76 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
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