Protein–RNA interactions for Protein: O75400

PRPF40A, Pre-mRNA-processing factor 40 homolog A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 957 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF40AO75400 CR383656.4-201ENST00000546909 122 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
PRPF40AO75400 HOTAIR_3.1-201ENST00000611352 97 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
PRPF40AO75400 RNU6-645P-201ENST00000364649 106 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
PRPF40AO75400 Y_RNA.565-201ENST00000384719 101 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
PRPF40AO75400 SNORA49-201ENST00000386157 136 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
PRPF40AO75400 MIR548H2-201ENST00000408874 88 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
PRPF40AO75400 SNORD115-25-201ENST00000362619 82 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
PRPF40AO75400 SNORD113.1-201ENST00000363280 73 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
PRPF40AO75400 SNORA33.1-201ENST00000364957 130 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
PRPF40AO75400 MIR145-201ENST00000384967 88 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
PRPF40AO75400 RNU6ATAC4P-201ENST00000387446 126 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
PRPF40AO75400 MTND4LP1-201ENST00000446263 157 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
PRPF40AO75400 AC023932.2-201ENST00000603176 175 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
PRPF40AO75400 SNORD114-5-201ENST00000362928 70 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
PRPF40AO75400 SNORD114-9-201ENST00000364370 72 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
PRPF40AO75400 RNU7-159P-201ENST00000459284 62 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
PRPF40AO75400 RNU6-982P-201ENST00000516216 102 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
PRPF40AO75400 AP000676.1-201ENST00000533307 52 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
PRPF40AO75400 Y_RNA.115-201ENST00000363272 98 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
PRPF40AO75400 MIR148A-201ENST00000362215 68 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
PRPF40AO75400 RNU6-634P-201ENST00000459134 106 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
PRPF40AO75400 RNU6-180P-201ENST00000516697 61 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
PRPF40AO75400 SNORD115-31-201ENST00000365318 82 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
PRPF40AO75400 RNU6-656P-201ENST00000516785 107 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
PRPF40AO75400 MIR6718-201ENST00000616153 80 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
PRPF40AO75400 RNA5SP457-201ENST00000363657 124 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
PRPF40AO75400 RNU6-1216P-201ENST00000362590 107 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
PRPF40AO75400 RNU6-668P-201ENST00000364180 107 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
PRPF40AO75400 MIR1295A-201ENST00000408463 79 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
PRPF40AO75400 RNU6-523P-201ENST00000516304 54 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
PRPF40AO75400 MIR6773-201ENST00000612812 74 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
PRPF40AO75400 RNA5SP299-201ENST00000391203 116 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
PRPF40AO75400 RNA5SP63-201ENST00000391225 112 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
PRPF40AO75400 RNU7-165P-201ENST00000458864 60 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
PRPF40AO75400 AL109933.3-201ENST00000619095 188 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
PRPF40AO75400 MIR548C-201ENST00000384815 97 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
PRPF40AO75400 MIR2909-201ENST00000617113 69 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
PRPF40AO75400 G3BP1-214ENST00000627077 114 ntTSL 5 BASIC0.09□□□□□ -2.4
PRPF40AO75400 RNU6-502P-201ENST00000362419 108 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
PRPF40AO75400 CYP3A54P-201ENST00000566950 75 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
PRPF40AO75400 RNU6-663P-201ENST00000391105 106 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
PRPF40AO75400 SNORD30.1-201ENST00000391309 70 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
PRPF40AO75400 AC008883.1-201ENST00000506562 193 ntTSL 3 BASIC0.06□□□□□ -2.4
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PRPF40AO75400 Y_RNA.30-201ENST00000362572 97 ntBASIC0□□□□□ -2.41
PRPF40AO75400 RNU6-46P-201ENST00000383860 107 ntBASIC0□□□□□ -2.41
PRPF40AO75400 SNORD116-24-201ENST00000384549 92 ntBASIC0□□□□□ -2.41
PRPF40AO75400 AC104692.1-201ENST00000472406 90 ntBASIC0□□□□□ -2.41
PRPF40AO75400 MIR4290-201ENST00000583807 95 ntBASIC0□□□□□ -2.41
PRPF40AO75400 U2.7-201ENST00000619197 100 ntBASIC0□□□□□ -2.41
PRPF40AO75400 SNORD114-16-201ENST00000363044 70 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
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PRPF40AO75400 AL021921.1-201ENST00000442774 93 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
PRPF40AO75400 RNA5SP470-201ENST00000516463 106 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
PRPF40AO75400 AC244250.2-201ENST00000418731 148 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
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PRPF40AO75400 SNORD49B-201ENST00000365172 72 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
PRPF40AO75400 MIR9-2-201ENST00000384838 87 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
PRPF40AO75400 MIR517B-201ENST00000385102 67 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
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PRPF40AO75400 uc_338.36-201ENST00000622331 158 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
PRPF40AO75400 U6.111-201ENST00000636093 83 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
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PRPF40AO75400 TRAJ54-201ENST00000390484 60 ntAPPRIS P1 BASIC-0.07□□□□□ -2.42
PRPF40AO75400 RNU7-55P-201ENST00000459426 62 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
PRPF40AO75400 AC114801.3-201ENST00000510231 177 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
PRPF40AO75400 AL391099.1-201ENST00000624635 187 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
PRPF40AO75400 MIR1295B-201ENST00000636144 60 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
PRPF40AO75400 RNU6-302P-201ENST00000365249 107 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
PRPF40AO75400 RNU6-973P-201ENST00000364690 107 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
PRPF40AO75400 MIR4432-201ENST00000581823 84 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
PRPF40AO75400 SNORA25.4-201ENST00000363666 124 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
PRPF40AO75400 SNORD115-23-201ENST00000364461 82 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
PRPF40AO75400 Y_RNA.375-201ENST00000365625 101 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
PRPF40AO75400 RNU7-154P-201ENST00000516194 62 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
PRPF40AO75400 RNU7-174P-201ENST00000516248 59 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
PRPF40AO75400 RNA5SP285-201ENST00000516619 119 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
PRPF40AO75400 MIR519A2-201ENST00000384990 87 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
PRPF40AO75400 MIR329-2-201ENST00000385029 84 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
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