Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1Q5

Clic1, Chloride intracellular channel protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clic1Q9Z1Q5 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Clic1Q9Z1Q5 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Clic1Q9Z1Q5 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Clic1Q9Z1Q5 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Clic1Q9Z1Q5 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Clic1Q9Z1Q5 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Clic1Q9Z1Q5 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Clic1Q9Z1Q5 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Clic1Q9Z1Q5 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Clic1Q9Z1Q5 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Clic1Q9Z1Q5 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Clic1Q9Z1Q5 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Clic1Q9Z1Q5 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Clic1Q9Z1Q5 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Clic1Q9Z1Q5 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Clic1Q9Z1Q5 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Clic1Q9Z1Q5 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Clic1Q9Z1Q5 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Clic1Q9Z1Q5 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Clic1Q9Z1Q5 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Clic1Q9Z1Q5 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Clic1Q9Z1Q5 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Clic1Q9Z1Q5 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Clic1Q9Z1Q5 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Clic1Q9Z1Q5 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Clic1Q9Z1Q5 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Clic1Q9Z1Q5 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Clic1Q9Z1Q5 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Clic1Q9Z1Q5 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Clic1Q9Z1Q5 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Clic1Q9Z1Q5 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Clic1Q9Z1Q5 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Clic1Q9Z1Q5 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Clic1Q9Z1Q5 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Clic1Q9Z1Q5 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Clic1Q9Z1Q5 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Clic1Q9Z1Q5 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Clic1Q9Z1Q5 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Clic1Q9Z1Q5 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Clic1Q9Z1Q5 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Clic1Q9Z1Q5 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Clic1Q9Z1Q5 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Clic1Q9Z1Q5 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Clic1Q9Z1Q5 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Clic1Q9Z1Q5 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Clic1Q9Z1Q5 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Clic1Q9Z1Q5 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Clic1Q9Z1Q5 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Clic1Q9Z1Q5 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Clic1Q9Z1Q5 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Clic1Q9Z1Q5 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Clic1Q9Z1Q5 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Clic1Q9Z1Q5 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Clic1Q9Z1Q5 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Clic1Q9Z1Q5 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Clic1Q9Z1Q5 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Clic1Q9Z1Q5 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Clic1Q9Z1Q5 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Clic1Q9Z1Q5 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Clic1Q9Z1Q5 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Clic1Q9Z1Q5 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Clic1Q9Z1Q5 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Clic1Q9Z1Q5 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Clic1Q9Z1Q5 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Clic1Q9Z1Q5 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Clic1Q9Z1Q5 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Clic1Q9Z1Q5 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Clic1Q9Z1Q5 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Clic1Q9Z1Q5 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Clic1Q9Z1Q5 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Clic1Q9Z1Q5 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Clic1Q9Z1Q5 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Clic1Q9Z1Q5 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Clic1Q9Z1Q5 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Clic1Q9Z1Q5 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Clic1Q9Z1Q5 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Clic1Q9Z1Q5 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Clic1Q9Z1Q5 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Clic1Q9Z1Q5 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Clic1Q9Z1Q5 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Clic1Q9Z1Q5 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Clic1Q9Z1Q5 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Clic1Q9Z1Q5 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Clic1Q9Z1Q5 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Clic1Q9Z1Q5 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Clic1Q9Z1Q5 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Clic1Q9Z1Q5 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Clic1Q9Z1Q5 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Clic1Q9Z1Q5 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Clic1Q9Z1Q5 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Clic1Q9Z1Q5 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Clic1Q9Z1Q5 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Clic1Q9Z1Q5 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Clic1Q9Z1Q5 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Clic1Q9Z1Q5 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Clic1Q9Z1Q5 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Clic1Q9Z1Q5 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Clic1Q9Z1Q5 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Clic1Q9Z1Q5 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Clic1Q9Z1Q5 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms