Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1N5

Ddx39b, Spliceosome RNA helicase Ddx39b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx39bQ9Z1N5 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ddx39bQ9Z1N5 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ddx39bQ9Z1N5 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ddx39bQ9Z1N5 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ddx39bQ9Z1N5 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ddx39bQ9Z1N5 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ddx39bQ9Z1N5 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ddx39bQ9Z1N5 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ddx39bQ9Z1N5 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ddx39bQ9Z1N5 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ddx39bQ9Z1N5 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ddx39bQ9Z1N5 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ddx39bQ9Z1N5 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ddx39bQ9Z1N5 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ddx39bQ9Z1N5 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ddx39bQ9Z1N5 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ddx39bQ9Z1N5 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ddx39bQ9Z1N5 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ddx39bQ9Z1N5 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ddx39bQ9Z1N5 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ddx39bQ9Z1N5 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ddx39bQ9Z1N5 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ddx39bQ9Z1N5 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ddx39bQ9Z1N5 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ddx39bQ9Z1N5 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ddx39bQ9Z1N5 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ddx39bQ9Z1N5 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ddx39bQ9Z1N5 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ddx39bQ9Z1N5 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ddx39bQ9Z1N5 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ddx39bQ9Z1N5 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ddx39bQ9Z1N5 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ddx39bQ9Z1N5 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ddx39bQ9Z1N5 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ddx39bQ9Z1N5 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ddx39bQ9Z1N5 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ddx39bQ9Z1N5 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ddx39bQ9Z1N5 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ddx39bQ9Z1N5 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ddx39bQ9Z1N5 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ddx39bQ9Z1N5 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ddx39bQ9Z1N5 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ddx39bQ9Z1N5 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ddx39bQ9Z1N5 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ddx39bQ9Z1N5 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ddx39bQ9Z1N5 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ddx39bQ9Z1N5 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ddx39bQ9Z1N5 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ddx39bQ9Z1N5 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ddx39bQ9Z1N5 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ddx39bQ9Z1N5 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ddx39bQ9Z1N5 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ddx39bQ9Z1N5 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ddx39bQ9Z1N5 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ddx39bQ9Z1N5 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ddx39bQ9Z1N5 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ddx39bQ9Z1N5 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ddx39bQ9Z1N5 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ddx39bQ9Z1N5 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ddx39bQ9Z1N5 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ddx39bQ9Z1N5 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ddx39bQ9Z1N5 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ddx39bQ9Z1N5 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ddx39bQ9Z1N5 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ddx39bQ9Z1N5 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ddx39bQ9Z1N5 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ddx39bQ9Z1N5 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ddx39bQ9Z1N5 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ddx39bQ9Z1N5 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ddx39bQ9Z1N5 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ddx39bQ9Z1N5 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ddx39bQ9Z1N5 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ddx39bQ9Z1N5 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ddx39bQ9Z1N5 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ddx39bQ9Z1N5 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ddx39bQ9Z1N5 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ddx39bQ9Z1N5 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ddx39bQ9Z1N5 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ddx39bQ9Z1N5 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ddx39bQ9Z1N5 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ddx39bQ9Z1N5 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ddx39bQ9Z1N5 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ddx39bQ9Z1N5 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ddx39bQ9Z1N5 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ddx39bQ9Z1N5 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ddx39bQ9Z1N5 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ddx39bQ9Z1N5 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ddx39bQ9Z1N5 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ddx39bQ9Z1N5 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ddx39bQ9Z1N5 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ddx39bQ9Z1N5 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ddx39bQ9Z1N5 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ddx39bQ9Z1N5 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ddx39bQ9Z1N5 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ddx39bQ9Z1N5 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ddx39bQ9Z1N5 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ddx39bQ9Z1N5 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ddx39bQ9Z1N5 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ddx39bQ9Z1N5 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ddx39bQ9Z1N5 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms