Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1L5

Cacna2d3, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna2d3Q9Z1L5 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cacna2d3Q9Z1L5 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cacna2d3Q9Z1L5 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cacna2d3Q9Z1L5 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cacna2d3Q9Z1L5 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cacna2d3Q9Z1L5 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cacna2d3Q9Z1L5 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cacna2d3Q9Z1L5 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cacna2d3Q9Z1L5 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cacna2d3Q9Z1L5 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cacna2d3Q9Z1L5 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cacna2d3Q9Z1L5 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cacna2d3Q9Z1L5 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cacna2d3Q9Z1L5 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cacna2d3Q9Z1L5 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cacna2d3Q9Z1L5 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cacna2d3Q9Z1L5 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cacna2d3Q9Z1L5 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cacna2d3Q9Z1L5 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cacna2d3Q9Z1L5 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cacna2d3Q9Z1L5 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cacna2d3Q9Z1L5 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cacna2d3Q9Z1L5 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cacna2d3Q9Z1L5 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cacna2d3Q9Z1L5 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cacna2d3Q9Z1L5 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cacna2d3Q9Z1L5 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cacna2d3Q9Z1L5 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cacna2d3Q9Z1L5 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cacna2d3Q9Z1L5 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cacna2d3Q9Z1L5 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cacna2d3Q9Z1L5 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cacna2d3Q9Z1L5 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cacna2d3Q9Z1L5 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cacna2d3Q9Z1L5 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cacna2d3Q9Z1L5 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cacna2d3Q9Z1L5 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cacna2d3Q9Z1L5 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cacna2d3Q9Z1L5 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cacna2d3Q9Z1L5 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cacna2d3Q9Z1L5 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cacna2d3Q9Z1L5 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cacna2d3Q9Z1L5 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cacna2d3Q9Z1L5 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cacna2d3Q9Z1L5 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cacna2d3Q9Z1L5 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Cacna2d3Q9Z1L5 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cacna2d3Q9Z1L5 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cacna2d3Q9Z1L5 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cacna2d3Q9Z1L5 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cacna2d3Q9Z1L5 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cacna2d3Q9Z1L5 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cacna2d3Q9Z1L5 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cacna2d3Q9Z1L5 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cacna2d3Q9Z1L5 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cacna2d3Q9Z1L5 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cacna2d3Q9Z1L5 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cacna2d3Q9Z1L5 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cacna2d3Q9Z1L5 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cacna2d3Q9Z1L5 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cacna2d3Q9Z1L5 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cacna2d3Q9Z1L5 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cacna2d3Q9Z1L5 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cacna2d3Q9Z1L5 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cacna2d3Q9Z1L5 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Cacna2d3Q9Z1L5 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cacna2d3Q9Z1L5 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cacna2d3Q9Z1L5 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cacna2d3Q9Z1L5 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Cacna2d3Q9Z1L5 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cacna2d3Q9Z1L5 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cacna2d3Q9Z1L5 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cacna2d3Q9Z1L5 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cacna2d3Q9Z1L5 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cacna2d3Q9Z1L5 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cacna2d3Q9Z1L5 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cacna2d3Q9Z1L5 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cacna2d3Q9Z1L5 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cacna2d3Q9Z1L5 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cacna2d3Q9Z1L5 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Cacna2d3Q9Z1L5 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cacna2d3Q9Z1L5 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cacna2d3Q9Z1L5 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cacna2d3Q9Z1L5 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cacna2d3Q9Z1L5 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cacna2d3Q9Z1L5 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cacna2d3Q9Z1L5 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cacna2d3Q9Z1L5 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cacna2d3Q9Z1L5 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.9 ms