Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV35

Apobec2, C->U-editing enzyme APOBEC-2, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec2Q9WV35 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Apobec2Q9WV35 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Apobec2Q9WV35 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Apobec2Q9WV35 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Apobec2Q9WV35 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Apobec2Q9WV35 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Apobec2Q9WV35 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Apobec2Q9WV35 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Apobec2Q9WV35 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Apobec2Q9WV35 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Apobec2Q9WV35 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Apobec2Q9WV35 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Apobec2Q9WV35 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Apobec2Q9WV35 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Apobec2Q9WV35 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Apobec2Q9WV35 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Apobec2Q9WV35 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Apobec2Q9WV35 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Apobec2Q9WV35 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Apobec2Q9WV35 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Apobec2Q9WV35 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Apobec2Q9WV35 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Apobec2Q9WV35 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Apobec2Q9WV35 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Apobec2Q9WV35 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Apobec2Q9WV35 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Apobec2Q9WV35 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Apobec2Q9WV35 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Apobec2Q9WV35 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Apobec2Q9WV35 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Apobec2Q9WV35 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Apobec2Q9WV35 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Apobec2Q9WV35 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Apobec2Q9WV35 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Apobec2Q9WV35 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Apobec2Q9WV35 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Apobec2Q9WV35 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Apobec2Q9WV35 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Apobec2Q9WV35 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Apobec2Q9WV35 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Apobec2Q9WV35 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Apobec2Q9WV35 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Apobec2Q9WV35 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Apobec2Q9WV35 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Apobec2Q9WV35 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Apobec2Q9WV35 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Apobec2Q9WV35 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Apobec2Q9WV35 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Apobec2Q9WV35 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Apobec2Q9WV35 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Apobec2Q9WV35 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Apobec2Q9WV35 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Apobec2Q9WV35 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Apobec2Q9WV35 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Apobec2Q9WV35 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Apobec2Q9WV35 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Apobec2Q9WV35 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Apobec2Q9WV35 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Apobec2Q9WV35 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Apobec2Q9WV35 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Apobec2Q9WV35 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Apobec2Q9WV35 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Apobec2Q9WV35 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Apobec2Q9WV35 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Apobec2Q9WV35 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Apobec2Q9WV35 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Apobec2Q9WV35 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Apobec2Q9WV35 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Apobec2Q9WV35 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Apobec2Q9WV35 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Apobec2Q9WV35 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Apobec2Q9WV35 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Apobec2Q9WV35 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Apobec2Q9WV35 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Apobec2Q9WV35 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Apobec2Q9WV35 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Apobec2Q9WV35 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Apobec2Q9WV35 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Apobec2Q9WV35 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Apobec2Q9WV35 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Apobec2Q9WV35 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Apobec2Q9WV35 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Apobec2Q9WV35 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Apobec2Q9WV35 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Apobec2Q9WV35 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Apobec2Q9WV35 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Apobec2Q9WV35 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Apobec2Q9WV35 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Apobec2Q9WV35 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Apobec2Q9WV35 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Apobec2Q9WV35 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Apobec2Q9WV35 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Apobec2Q9WV35 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Apobec2Q9WV35 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Apobec2Q9WV35 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Apobec2Q9WV35 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Apobec2Q9WV35 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Apobec2Q9WV35 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Apobec2Q9WV35 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Apobec2Q9WV35 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.3 ms