Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1R2

Trim3, Tripartite motif-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 744 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim3Q9R1R2 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trim3Q9R1R2 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trim3Q9R1R2 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Trim3Q9R1R2 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trim3Q9R1R2 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Trim3Q9R1R2 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trim3Q9R1R2 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Trim3Q9R1R2 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trim3Q9R1R2 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trim3Q9R1R2 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trim3Q9R1R2 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trim3Q9R1R2 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trim3Q9R1R2 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Trim3Q9R1R2 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Trim3Q9R1R2 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trim3Q9R1R2 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trim3Q9R1R2 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Trim3Q9R1R2 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trim3Q9R1R2 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trim3Q9R1R2 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trim3Q9R1R2 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Trim3Q9R1R2 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trim3Q9R1R2 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Trim3Q9R1R2 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Trim3Q9R1R2 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Trim3Q9R1R2 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Trim3Q9R1R2 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trim3Q9R1R2 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Trim3Q9R1R2 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Trim3Q9R1R2 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trim3Q9R1R2 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Trim3Q9R1R2 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trim3Q9R1R2 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trim3Q9R1R2 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trim3Q9R1R2 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trim3Q9R1R2 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.04■□□□□ -0
Trim3Q9R1R2 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Trim3Q9R1R2 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trim3Q9R1R2 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trim3Q9R1R2 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trim3Q9R1R2 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trim3Q9R1R2 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Trim3Q9R1R2 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trim3Q9R1R2 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Trim3Q9R1R2 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trim3Q9R1R2 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trim3Q9R1R2 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trim3Q9R1R2 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Trim3Q9R1R2 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Trim3Q9R1R2 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trim3Q9R1R2 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trim3Q9R1R2 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trim3Q9R1R2 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Trim3Q9R1R2 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trim3Q9R1R2 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trim3Q9R1R2 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trim3Q9R1R2 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trim3Q9R1R2 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Trim3Q9R1R2 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trim3Q9R1R2 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Trim3Q9R1R2 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Trim3Q9R1R2 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Trim3Q9R1R2 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Trim3Q9R1R2 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Trim3Q9R1R2 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Trim3Q9R1R2 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Trim3Q9R1R2 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Trim3Q9R1R2 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Trim3Q9R1R2 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Trim3Q9R1R2 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Trim3Q9R1R2 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Trim3Q9R1R2 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Trim3Q9R1R2 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Trim3Q9R1R2 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Trim3Q9R1R2 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Trim3Q9R1R2 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Trim3Q9R1R2 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Trim3Q9R1R2 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Trim3Q9R1R2 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Trim3Q9R1R2 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Trim3Q9R1R2 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Trim3Q9R1R2 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Trim3Q9R1R2 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Trim3Q9R1R2 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Trim3Q9R1R2 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Trim3Q9R1R2 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Trim3Q9R1R2 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trim3Q9R1R2 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trim3Q9R1R2 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trim3Q9R1R2 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trim3Q9R1R2 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trim3Q9R1R2 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trim3Q9R1R2 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trim3Q9R1R2 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trim3Q9R1R2 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trim3Q9R1R2 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trim3Q9R1R2 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trim3Q9R1R2 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Trim3Q9R1R2 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trim3Q9R1R2 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms