Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS2

Rnf4, E3 ubiquitin-protein ligase RNF4, mousemouse

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Length 194 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf4Q9QZS2 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rnf4Q9QZS2 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rnf4Q9QZS2 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rnf4Q9QZS2 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rnf4Q9QZS2 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rnf4Q9QZS2 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rnf4Q9QZS2 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rnf4Q9QZS2 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rnf4Q9QZS2 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rnf4Q9QZS2 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rnf4Q9QZS2 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rnf4Q9QZS2 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rnf4Q9QZS2 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rnf4Q9QZS2 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rnf4Q9QZS2 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rnf4Q9QZS2 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rnf4Q9QZS2 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rnf4Q9QZS2 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rnf4Q9QZS2 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rnf4Q9QZS2 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rnf4Q9QZS2 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rnf4Q9QZS2 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rnf4Q9QZS2 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rnf4Q9QZS2 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rnf4Q9QZS2 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rnf4Q9QZS2 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rnf4Q9QZS2 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rnf4Q9QZS2 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rnf4Q9QZS2 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rnf4Q9QZS2 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rnf4Q9QZS2 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rnf4Q9QZS2 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rnf4Q9QZS2 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Rnf4Q9QZS2 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rnf4Q9QZS2 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rnf4Q9QZS2 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rnf4Q9QZS2 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rnf4Q9QZS2 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rnf4Q9QZS2 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rnf4Q9QZS2 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rnf4Q9QZS2 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rnf4Q9QZS2 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rnf4Q9QZS2 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rnf4Q9QZS2 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rnf4Q9QZS2 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
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Rnf4Q9QZS2 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
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Rnf4Q9QZS2 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rnf4Q9QZS2 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Rnf4Q9QZS2 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Rnf4Q9QZS2 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rnf4Q9QZS2 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rnf4Q9QZS2 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
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Rnf4Q9QZS2 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rnf4Q9QZS2 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Rnf4Q9QZS2 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
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Rnf4Q9QZS2 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rnf4Q9QZS2 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rnf4Q9QZS2 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rnf4Q9QZS2 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
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Rnf4Q9QZS2 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rnf4Q9QZS2 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rnf4Q9QZS2 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rnf4Q9QZS2 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rnf4Q9QZS2 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rnf4Q9QZS2 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rnf4Q9QZS2 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rnf4Q9QZS2 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rnf4Q9QZS2 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rnf4Q9QZS2 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rnf4Q9QZS2 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rnf4Q9QZS2 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rnf4Q9QZS2 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rnf4Q9QZS2 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rnf4Q9QZS2 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rnf4Q9QZS2 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rnf4Q9QZS2 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rnf4Q9QZS2 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rnf4Q9QZS2 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rnf4Q9QZS2 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rnf4Q9QZS2 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rnf4Q9QZS2 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rnf4Q9QZS2 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rnf4Q9QZS2 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rnf4Q9QZS2 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rnf4Q9QZS2 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rnf4Q9QZS2 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rnf4Q9QZS2 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rnf4Q9QZS2 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rnf4Q9QZS2 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rnf4Q9QZS2 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rnf4Q9QZS2 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rnf4Q9QZS2 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rnf4Q9QZS2 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rnf4Q9QZS2 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
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