Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY61

Irx4, Iroquois-class homeodomain protein IRX-4, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx4Q9QY61 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Irx4Q9QY61 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Irx4Q9QY61 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Irx4Q9QY61 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Irx4Q9QY61 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Irx4Q9QY61 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Irx4Q9QY61 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Irx4Q9QY61 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Irx4Q9QY61 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Irx4Q9QY61 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Irx4Q9QY61 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Irx4Q9QY61 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Irx4Q9QY61 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Irx4Q9QY61 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Irx4Q9QY61 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Irx4Q9QY61 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Irx4Q9QY61 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Irx4Q9QY61 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Irx4Q9QY61 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Irx4Q9QY61 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Irx4Q9QY61 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Irx4Q9QY61 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Irx4Q9QY61 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Irx4Q9QY61 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Irx4Q9QY61 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Irx4Q9QY61 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Irx4Q9QY61 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Irx4Q9QY61 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Irx4Q9QY61 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Irx4Q9QY61 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Irx4Q9QY61 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Irx4Q9QY61 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Irx4Q9QY61 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Irx4Q9QY61 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Irx4Q9QY61 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Irx4Q9QY61 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Irx4Q9QY61 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Irx4Q9QY61 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Irx4Q9QY61 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Irx4Q9QY61 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Irx4Q9QY61 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Irx4Q9QY61 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Irx4Q9QY61 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Irx4Q9QY61 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Irx4Q9QY61 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Irx4Q9QY61 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Irx4Q9QY61 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Irx4Q9QY61 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Irx4Q9QY61 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Irx4Q9QY61 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Irx4Q9QY61 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Irx4Q9QY61 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Irx4Q9QY61 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Irx4Q9QY61 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Irx4Q9QY61 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Irx4Q9QY61 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Irx4Q9QY61 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Irx4Q9QY61 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Irx4Q9QY61 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Irx4Q9QY61 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Irx4Q9QY61 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Irx4Q9QY61 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Irx4Q9QY61 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Irx4Q9QY61 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Irx4Q9QY61 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Irx4Q9QY61 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Irx4Q9QY61 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Irx4Q9QY61 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Irx4Q9QY61 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Irx4Q9QY61 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Irx4Q9QY61 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Irx4Q9QY61 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Irx4Q9QY61 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Irx4Q9QY61 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Irx4Q9QY61 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Irx4Q9QY61 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Irx4Q9QY61 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Irx4Q9QY61 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Irx4Q9QY61 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Irx4Q9QY61 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Irx4Q9QY61 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Irx4Q9QY61 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Irx4Q9QY61 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Irx4Q9QY61 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Irx4Q9QY61 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Irx4Q9QY61 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Irx4Q9QY61 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Irx4Q9QY61 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Irx4Q9QY61 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Irx4Q9QY61 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Irx4Q9QY61 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Irx4Q9QY61 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Irx4Q9QY61 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Irx4Q9QY61 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Irx4Q9QY61 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Irx4Q9QY61 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Irx4Q9QY61 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
Irx4Q9QY61 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Irx4Q9QY61 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Irx4Q9QY61 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms