Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKX4

Aatf, Protein AATF, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 526 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AatfQ9JKX4 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
AatfQ9JKX4 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
AatfQ9JKX4 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
AatfQ9JKX4 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
AatfQ9JKX4 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
AatfQ9JKX4 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
AatfQ9JKX4 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
AatfQ9JKX4 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
AatfQ9JKX4 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
AatfQ9JKX4 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
AatfQ9JKX4 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
AatfQ9JKX4 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
AatfQ9JKX4 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
AatfQ9JKX4 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
AatfQ9JKX4 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
AatfQ9JKX4 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
AatfQ9JKX4 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
AatfQ9JKX4 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
AatfQ9JKX4 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
AatfQ9JKX4 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
AatfQ9JKX4 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
AatfQ9JKX4 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
AatfQ9JKX4 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
AatfQ9JKX4 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
AatfQ9JKX4 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
AatfQ9JKX4 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
AatfQ9JKX4 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
AatfQ9JKX4 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
AatfQ9JKX4 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
AatfQ9JKX4 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
AatfQ9JKX4 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
AatfQ9JKX4 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
AatfQ9JKX4 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
AatfQ9JKX4 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
AatfQ9JKX4 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
AatfQ9JKX4 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
AatfQ9JKX4 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
AatfQ9JKX4 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
AatfQ9JKX4 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
AatfQ9JKX4 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
AatfQ9JKX4 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
AatfQ9JKX4 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
AatfQ9JKX4 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
AatfQ9JKX4 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
AatfQ9JKX4 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
AatfQ9JKX4 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
AatfQ9JKX4 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
AatfQ9JKX4 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
AatfQ9JKX4 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
AatfQ9JKX4 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
AatfQ9JKX4 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
AatfQ9JKX4 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
AatfQ9JKX4 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
AatfQ9JKX4 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
AatfQ9JKX4 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
AatfQ9JKX4 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
AatfQ9JKX4 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
AatfQ9JKX4 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
AatfQ9JKX4 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
AatfQ9JKX4 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
AatfQ9JKX4 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
AatfQ9JKX4 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
AatfQ9JKX4 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
AatfQ9JKX4 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
AatfQ9JKX4 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
AatfQ9JKX4 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
AatfQ9JKX4 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
AatfQ9JKX4 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
AatfQ9JKX4 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
AatfQ9JKX4 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
AatfQ9JKX4 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
AatfQ9JKX4 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
AatfQ9JKX4 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
AatfQ9JKX4 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
AatfQ9JKX4 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
AatfQ9JKX4 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
AatfQ9JKX4 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
AatfQ9JKX4 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
AatfQ9JKX4 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
AatfQ9JKX4 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
AatfQ9JKX4 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
AatfQ9JKX4 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
AatfQ9JKX4 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
AatfQ9JKX4 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
AatfQ9JKX4 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
AatfQ9JKX4 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
AatfQ9JKX4 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
AatfQ9JKX4 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
AatfQ9JKX4 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.23
AatfQ9JKX4 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
AatfQ9JKX4 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
AatfQ9JKX4 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
AatfQ9JKX4 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
AatfQ9JKX4 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
AatfQ9JKX4 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
AatfQ9JKX4 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
AatfQ9JKX4 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
AatfQ9JKX4 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
AatfQ9JKX4 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
AatfQ9JKX4 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms