Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKQ4

Irx5, Iroquois-class homeodomain protein IRX-5, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx5Q9JKQ4 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Irx5Q9JKQ4 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Irx5Q9JKQ4 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Irx5Q9JKQ4 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Irx5Q9JKQ4 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Irx5Q9JKQ4 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Irx5Q9JKQ4 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Irx5Q9JKQ4 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Irx5Q9JKQ4 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Irx5Q9JKQ4 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Irx5Q9JKQ4 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Irx5Q9JKQ4 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Irx5Q9JKQ4 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Irx5Q9JKQ4 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Irx5Q9JKQ4 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Irx5Q9JKQ4 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Irx5Q9JKQ4 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Irx5Q9JKQ4 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Irx5Q9JKQ4 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Irx5Q9JKQ4 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Irx5Q9JKQ4 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Irx5Q9JKQ4 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Irx5Q9JKQ4 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Irx5Q9JKQ4 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Irx5Q9JKQ4 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Irx5Q9JKQ4 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Irx5Q9JKQ4 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Irx5Q9JKQ4 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Irx5Q9JKQ4 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Irx5Q9JKQ4 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Irx5Q9JKQ4 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Irx5Q9JKQ4 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Irx5Q9JKQ4 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Irx5Q9JKQ4 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Irx5Q9JKQ4 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Irx5Q9JKQ4 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Irx5Q9JKQ4 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Irx5Q9JKQ4 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Irx5Q9JKQ4 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Irx5Q9JKQ4 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Irx5Q9JKQ4 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Irx5Q9JKQ4 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Irx5Q9JKQ4 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Irx5Q9JKQ4 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Irx5Q9JKQ4 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Irx5Q9JKQ4 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Irx5Q9JKQ4 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Irx5Q9JKQ4 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Irx5Q9JKQ4 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Irx5Q9JKQ4 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Irx5Q9JKQ4 Gm38134-201ENSMUST00000191858 1234 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Irx5Q9JKQ4 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Irx5Q9JKQ4 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Irx5Q9JKQ4 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Irx5Q9JKQ4 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Irx5Q9JKQ4 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Irx5Q9JKQ4 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Irx5Q9JKQ4 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Irx5Q9JKQ4 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Irx5Q9JKQ4 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Irx5Q9JKQ4 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Irx5Q9JKQ4 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Irx5Q9JKQ4 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Irx5Q9JKQ4 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Irx5Q9JKQ4 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Irx5Q9JKQ4 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Irx5Q9JKQ4 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Irx5Q9JKQ4 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Irx5Q9JKQ4 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Irx5Q9JKQ4 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Irx5Q9JKQ4 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Irx5Q9JKQ4 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Irx5Q9JKQ4 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Irx5Q9JKQ4 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Irx5Q9JKQ4 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Irx5Q9JKQ4 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Irx5Q9JKQ4 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Irx5Q9JKQ4 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Irx5Q9JKQ4 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Irx5Q9JKQ4 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Irx5Q9JKQ4 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Irx5Q9JKQ4 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Irx5Q9JKQ4 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Irx5Q9JKQ4 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Irx5Q9JKQ4 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Irx5Q9JKQ4 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Irx5Q9JKQ4 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Irx5Q9JKQ4 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Irx5Q9JKQ4 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Irx5Q9JKQ4 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Irx5Q9JKQ4 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Irx5Q9JKQ4 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Irx5Q9JKQ4 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Irx5Q9JKQ4 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Irx5Q9JKQ4 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Irx5Q9JKQ4 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Irx5Q9JKQ4 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Irx5Q9JKQ4 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Irx5Q9JKQ4 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Irx5Q9JKQ4 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms